Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder
Antibiotikaresistens har blitt en av de store helseutfordringene som verden står ovenfor. Stadig økende utvikling av resistente- samt multiresistente bakterier har medført økt behandlingssvikt. På grunn av denne negative utviklingen er det viktig med riktig og kritisk bruk av antibiotika, i tillegg...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Format: | Master Thesis |
Language: | Norwegian Bokmål |
Published: |
Norwegian University of Life Sciences, Ås
2022
|
Subjects: | |
Online Access: | https://hdl.handle.net/11250/3042603 |
id |
ftunivmob:oai:nmbu.brage.unit.no:11250/3042603 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftunivmob:oai:nmbu.brage.unit.no:11250/3042603 2023-05-15T17:24:09+02:00 Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder Identification of resistancespreading bacteria in the environment using qualitative and quantitative methods Moen, Kaja Lindstedt, Bjørn-Arne 2022 application/pdf https://hdl.handle.net/11250/3042603 nob nob Norwegian University of Life Sciences, Ås https://hdl.handle.net/11250/3042603 Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internasjonal http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.no CC-BY-NC-ND Master thesis 2022 ftunivmob 2023-01-18T23:44:24Z Antibiotikaresistens har blitt en av de store helseutfordringene som verden står ovenfor. Stadig økende utvikling av resistente- samt multiresistente bakterier har medført økt behandlingssvikt. På grunn av denne negative utviklingen er det viktig med riktig og kritisk bruk av antibiotika, i tillegg til å kartlegge resistensutviklingen hos bakterier for å kunne gjøre konkrete tiltak for å motvirke denne spredningen (Nord-Norge, 2018). Formålet med denne masteroppgaven var å få kartlagt hvilke resistente bakterier som finnes i miljøet i Norge, identifisere tilstedeværelse av resistente gener og grad av resistens mot de klinisk viktigste antibiotikaene på markedet. For å kunne kartlegge hvilke resistente bakterier som finnes i Norge ble det tatt opp vannprøver fra fire innsjøer sørøst i Norge, fra tre årstider. Vannprøvene ble filtrert og dyrket opp på ESBL- og CRE-agarskåler, for å dyrke fram bakterier med resistens mot de klinisk viktigste antibiotikaene fra antibiotikagruppen β-laktam. Bakteriekoloniene ble identifisert ved amplifisering og sekvensering av 16S-genet. De identifiserte bakteriene ble testet for ESBL-gener, ved PCR og elektroforering. Videre ble de MIC-testet for grad av resistens mot de klinisk viktige antibiotikagruppene β-laktam, kinoloner, makrolider og tetrasykliner. Ut ifra resultatene fra 16S- og MIC-verdiene ble prøvene S9, H8 og V6 til slutt helgenomsekvensert, for identifisering av resistente gener av klinisk relevans. Ved 16S-sekvenseringen ble bakterieslektene Erwinia, Pseudomonas, Enterobacter, Aeromonas, Herbaspirillum, Rhizobium, Klebsiella og Brucella identifisert. Flere av disse bakterieslektene var assosiert med humanpatogene arter. Ingen av bakterieprøvene fikk identifisert ESBL-gener ved PCR, men alle bakterieprøvene viste en begynnende resistensutvikling mot antibiotikagruppene β-laktam, kinoloner, makrolider og tetrasykliner. Bakterieprøvene viste også full resistens mot førstegenerasjon av penicillin og makrolider. Prøvene H8 og V6 ble ut ifra MIC-verdiene betegnet som ... Master Thesis Nord-Norge Open archive Norwegian University of Life Sciences: Brage NMBU Finnes ENVELOPE(17.883,17.883,69.483,69.483) |
institution |
Open Polar |
collection |
Open archive Norwegian University of Life Sciences: Brage NMBU |
op_collection_id |
ftunivmob |
language |
Norwegian Bokmål |
description |
Antibiotikaresistens har blitt en av de store helseutfordringene som verden står ovenfor. Stadig økende utvikling av resistente- samt multiresistente bakterier har medført økt behandlingssvikt. På grunn av denne negative utviklingen er det viktig med riktig og kritisk bruk av antibiotika, i tillegg til å kartlegge resistensutviklingen hos bakterier for å kunne gjøre konkrete tiltak for å motvirke denne spredningen (Nord-Norge, 2018). Formålet med denne masteroppgaven var å få kartlagt hvilke resistente bakterier som finnes i miljøet i Norge, identifisere tilstedeværelse av resistente gener og grad av resistens mot de klinisk viktigste antibiotikaene på markedet. For å kunne kartlegge hvilke resistente bakterier som finnes i Norge ble det tatt opp vannprøver fra fire innsjøer sørøst i Norge, fra tre årstider. Vannprøvene ble filtrert og dyrket opp på ESBL- og CRE-agarskåler, for å dyrke fram bakterier med resistens mot de klinisk viktigste antibiotikaene fra antibiotikagruppen β-laktam. Bakteriekoloniene ble identifisert ved amplifisering og sekvensering av 16S-genet. De identifiserte bakteriene ble testet for ESBL-gener, ved PCR og elektroforering. Videre ble de MIC-testet for grad av resistens mot de klinisk viktige antibiotikagruppene β-laktam, kinoloner, makrolider og tetrasykliner. Ut ifra resultatene fra 16S- og MIC-verdiene ble prøvene S9, H8 og V6 til slutt helgenomsekvensert, for identifisering av resistente gener av klinisk relevans. Ved 16S-sekvenseringen ble bakterieslektene Erwinia, Pseudomonas, Enterobacter, Aeromonas, Herbaspirillum, Rhizobium, Klebsiella og Brucella identifisert. Flere av disse bakterieslektene var assosiert med humanpatogene arter. Ingen av bakterieprøvene fikk identifisert ESBL-gener ved PCR, men alle bakterieprøvene viste en begynnende resistensutvikling mot antibiotikagruppene β-laktam, kinoloner, makrolider og tetrasykliner. Bakterieprøvene viste også full resistens mot førstegenerasjon av penicillin og makrolider. Prøvene H8 og V6 ble ut ifra MIC-verdiene betegnet som ... |
author2 |
Lindstedt, Bjørn-Arne |
format |
Master Thesis |
author |
Moen, Kaja |
spellingShingle |
Moen, Kaja Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder |
author_facet |
Moen, Kaja |
author_sort |
Moen, Kaja |
title |
Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder |
title_short |
Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder |
title_full |
Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder |
title_fullStr |
Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder |
title_full_unstemmed |
Identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder |
title_sort |
identifisering av resistensspredende bakterier i miljøet ved hjelp av kvalitative og kvantitative metoder |
publisher |
Norwegian University of Life Sciences, Ås |
publishDate |
2022 |
url |
https://hdl.handle.net/11250/3042603 |
long_lat |
ENVELOPE(17.883,17.883,69.483,69.483) |
geographic |
Finnes |
geographic_facet |
Finnes |
genre |
Nord-Norge |
genre_facet |
Nord-Norge |
op_relation |
https://hdl.handle.net/11250/3042603 |
op_rights |
Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internasjonal http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.no |
op_rightsnorm |
CC-BY-NC-ND |
_version_ |
1766115049419571200 |