Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert

Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) er en gjellesykdom som er knyttet til høy dødelighet i lakseoppdrettsnæringen og som er ansett som en trussel mot fiskevelferden. Det mangler fortsatt grunnleggende kunnskap om viruset og sykdommen det forårsaker, og rutiner til å kunne takle sykdomsutbrudd i opp...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Amundsen, Marit Måsøy
Other Authors: Dahle, Maria Krudtaa, Gjessing, Mona, Tengs, Torstein
Format: Master Thesis
Language:Norwegian Bokmål
Published: Norwegian University of Life Sciences, Ås 2019
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/11250/2637318
id ftunivmob:oai:nmbu.brage.unit.no:11250/2637318
record_format openpolar
spelling ftunivmob:oai:nmbu.brage.unit.no:11250/2637318 2023-05-15T15:33:03+02:00 Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) in Atlantic salmon (salmo salar), development of disease and gene expression in virus and host Amundsen, Marit Måsøy Dahle, Maria Krudtaa Gjessing, Mona Tengs, Torstein Norway 2019 application/pdf http://hdl.handle.net/11250/2637318 nob nob Norwegian University of Life Sciences, Ås Norges forskningsråd: 267491 http://hdl.handle.net/11250/2637318 Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internasjonal http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.no CC-BY-NC-ND 80 VDP::Teknologi: 500 Master thesis 2019 ftunivmob 2021-09-23T20:16:01Z Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) er en gjellesykdom som er knyttet til høy dødelighet i lakseoppdrettsnæringen og som er ansett som en trussel mot fiskevelferden. Det mangler fortsatt grunnleggende kunnskap om viruset og sykdommen det forårsaker, og rutiner til å kunne takle sykdomsutbrudd i oppdrettsnæringen på best mulig måte. Hovedmålet med denne oppgaven var derfor å øke kunnskapen om viruset og sykdomsforløpet hos laksen. Dette ble undersøkt i sammenheng med stress fordi dette reduserer laksens motstandskraft. Oppgaven baserte seg på et smitteforsøk med to grupper SGPV-smittet laks, der den ene gruppen i tillegg ble injisert med hydrokortison for å få økt kortisol i blodet. Genekspresjon av viruset og laksen ble målt ved bruk av RT-qPCR og kvalitativ deteksjon av virusinfiserte celler ble detektert ved bruk av in situ hybridisering. I tillegg ble funksjonelle domener i hypotetiske SGPV-proteiner funnet ved bruk av bioinformatiske verktøy. Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) is a gill disease associated with high mortality in the aquaculture industry and considered as a threat to fish welfare. More basic knowledge on the virus and the disease it causes is needed to be able to cope with disease outbreaks in the aquaculture industry. The main aim of this study was to increase the knowledge about the virus and the salmon response to infection. This was studied in the context of stress, because stress is known to reduce the disease resistence. The thesis were based on a challenge trial with two groups of SGPV-infected salmon, in which one group was also injected with hydrocortisone to increase the cortisol level in the blood. Gene expression from the virus and the salmon was measured using RT-qPCR, and virus-infected cells were detected using in situ hybridization. In addition, novel functional domains in the SGPV hypothetical proteins were detected using bioinformatic tools. submittedVersion M-BIOTEK Master Thesis Atlantic salmon Salmo salar Open archive Norwegian University of Life Sciences: Brage NMBU Norway Laksen ENVELOPE(12.319,12.319,65.351,65.351)
institution Open Polar
collection Open archive Norwegian University of Life Sciences: Brage NMBU
op_collection_id ftunivmob
language Norwegian Bokmål
topic VDP::Teknologi: 500
spellingShingle VDP::Teknologi: 500
Amundsen, Marit Måsøy
Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert
topic_facet VDP::Teknologi: 500
description Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) er en gjellesykdom som er knyttet til høy dødelighet i lakseoppdrettsnæringen og som er ansett som en trussel mot fiskevelferden. Det mangler fortsatt grunnleggende kunnskap om viruset og sykdommen det forårsaker, og rutiner til å kunne takle sykdomsutbrudd i oppdrettsnæringen på best mulig måte. Hovedmålet med denne oppgaven var derfor å øke kunnskapen om viruset og sykdomsforløpet hos laksen. Dette ble undersøkt i sammenheng med stress fordi dette reduserer laksens motstandskraft. Oppgaven baserte seg på et smitteforsøk med to grupper SGPV-smittet laks, der den ene gruppen i tillegg ble injisert med hydrokortison for å få økt kortisol i blodet. Genekspresjon av viruset og laksen ble målt ved bruk av RT-qPCR og kvalitativ deteksjon av virusinfiserte celler ble detektert ved bruk av in situ hybridisering. I tillegg ble funksjonelle domener i hypotetiske SGPV-proteiner funnet ved bruk av bioinformatiske verktøy. Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) is a gill disease associated with high mortality in the aquaculture industry and considered as a threat to fish welfare. More basic knowledge on the virus and the disease it causes is needed to be able to cope with disease outbreaks in the aquaculture industry. The main aim of this study was to increase the knowledge about the virus and the salmon response to infection. This was studied in the context of stress, because stress is known to reduce the disease resistence. The thesis were based on a challenge trial with two groups of SGPV-infected salmon, in which one group was also injected with hydrocortisone to increase the cortisol level in the blood. Gene expression from the virus and the salmon was measured using RT-qPCR, and virus-infected cells were detected using in situ hybridization. In addition, novel functional domains in the SGPV hypothetical proteins were detected using bioinformatic tools. submittedVersion M-BIOTEK
author2 Dahle, Maria Krudtaa
Gjessing, Mona
Tengs, Torstein
format Master Thesis
author Amundsen, Marit Måsøy
author_facet Amundsen, Marit Måsøy
author_sort Amundsen, Marit Måsøy
title Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert
title_short Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert
title_full Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert
title_fullStr Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert
title_full_unstemmed Salmon Gill Poxvirus Disease (SGPVD) i Atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert
title_sort salmon gill poxvirus disease (sgpvd) i atlantisk laks (salmo salar), sykdomsutvikling og genuttrykk hos virus og vert
publisher Norwegian University of Life Sciences, Ås
publishDate 2019
url http://hdl.handle.net/11250/2637318
op_coverage Norway
long_lat ENVELOPE(12.319,12.319,65.351,65.351)
geographic Norway
Laksen
geographic_facet Norway
Laksen
genre Atlantic salmon
Salmo salar
genre_facet Atlantic salmon
Salmo salar
op_source 80
op_relation Norges forskningsråd: 267491
http://hdl.handle.net/11250/2637318
op_rights Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internasjonal
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.no
op_rightsnorm CC-BY-NC-ND
_version_ 1766363525447417856