Structure des communautés microbiennes dans les sédiments lacustres du Haut-Arctique

• Main Author: Lapointe, Anne-Marie
• Other Authors: Culley, Alexander, Antoniades, Dermot
• Format: Other/Unknown Material
• Language: French
• Published: 2022
• Subjects: Sédiments lacustres > Nunavut > Ellesmere; Île d'; Paléolimnologie > Arctique > Holocène; Limnologie > Nunavut > Ellesmere; Température atmosphérique > Modification à l'échelle planétaire; Glace de mer > Arctique; Micro-organismes > Nunavut > Ellesmere; Glaciers > Arctique > Écoulement; Nunavut; Arctique*
• Online Access: https://hdl.handle.net/20.500.11794/73612

La vallée de Stuckberry a été touchée par une importante variabilité climatique au cours de l'Holocène et constitue actuellement un environnement en transition rapide en raison de la hausse des températures. Le retrait du glacier principal de la vallée a entraîné la formation de quatre lacs, où l'âge de chaque lac est proportionnel à la distance de l'océan Arctique. Les sédiments des lacs représentent un trésor d'informations sur les changements passés dans le bassin versant de la vallée de Stuckberry et fournissent une « mémoire à long terme » de la façon dont les lacs ont réagi à ces changements. L'objectif spécifique de l'étude est de caractériser les changements au fil du temps dans la structure des communautés microbiennes. Pour ce faire, l'ADN a été extrait à partir de couches de sédiments et la technologie de séquençage d'amplicons du gène de l'ARNr 16S a été utilisée pour la fraction bactérienne et archéenne et la technologie métagénomique shotgun a été utilisée dans quelques couches ciblées pour la fraction virale. Des analyses bio-informatiques et statistiques ont ensuite été effectuées pour réaliser l'affiliation taxonomique et les comparaisons de la diversité microbienne des couches des carottes de sédiments des lacs, l'hypothèse étant que la diversité microbienne varierait avec le temps et que cette dynamique reflèterait les changements environnementaux passés dans le bassin versant. Les résultats obtenus dans cette recherche nous permettent de conclure qu'il y a bien des changements au niveau des structures des communautés microbiennes au fil du temps qui semblent être influencées par les changements environnementaux subits par la vallée de Stuckberry et les variances entre les lacs semblent être dues à leur composition physico-chimique respective et à leur temps d'évolution différent. Ce travail contribue à de nouvelles connaissances sur les forces à l'origine des changements épisodiques et interannuels des communautés microbiennes. Stuckberry Valley experienced significant climatic variability ...