Diversité microbienne associée au cycle du méthane dans les mares de fonte du pergélisol subarctique
La fonte et l’effondrement du pergélisol riche en glace dans la région subarctique du Québec ont donné lieu à la formation de petits lacs (mares de thermokarst) qui émettent des gaz à effet de serre dans l’atmosphère tels que du dioxyde de carbone et du méthane. Pourtant, la composition de la commun...
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2018
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ftunivlavalcorp:oai:corpus.ulaval.ca:20.500.11794/26939 2024-06-23T07:50:58+00:00 Diversité microbienne associée au cycle du méthane dans les mares de fonte du pergélisol subarctique Crevecoeur, Sophie Lovejoy, Connie Vincent, Warwick F. Québec (Province) Arctique 2018-04-24T20:53:24Z 1 ressource en ligne (xx, 111 pages) application/pdf https://hdl.handle.net/20.500.11794/26939 fre fre 32665 http://hdl.handle.net/20.500.11794/26939 TC-QQLA-32665 http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 QH 302.5 UL 2016 Méthane -- Québec (Province) Méthane -- Arctique Diversité microbienne -- Québec (Province) Diversité microbienne -- Arctique Pergélisols -- Québec (Province) Pergélisols -- Arctique Mares d'eau de fonte -- Québec (Province) Mares d'eau de fonte -- Arctique thèse de doctorat COAR1_1::Texte::Thèse::Thèse de doctorat 2018 ftunivlavalcorp https://doi.org/20.500.11794/26939 2024-05-27T23:52:33Z La fonte et l’effondrement du pergélisol riche en glace dans la région subarctique du Québec ont donné lieu à la formation de petits lacs (mares de thermokarst) qui émettent des gaz à effet de serre dans l’atmosphère tels que du dioxyde de carbone et du méthane. Pourtant, la composition de la communauté microbienne qui est à la base des processus biogéochimiques dans les mares de fonte a été très peu étudiée, particulièrement en ce qui concerne la diversité et l’activité des micro-organismes impliqués dans le cycle du méthane. L’objectif de cette thèse est donc d’étudier la diversité phylogénétique et fonctionnelle des micro-organismes dans les mares de fonte subarctiques en lien avec les caractéristiques de l’environnement et les émissions de méthane. Pour ce faire, une dizaine de mares ont été échantillonnées dans quatre vallées situées à travers un gradient de fonte du pergélisol, et disposant de différentes propriétés physico-chimiques. Selon les vallées, les mares peuvent être issues de la fonte de palses (buttes de tourbe, à dominance organique) ou de lithalses (buttes de sol à dominance minérale) ce qui influence la nature du carbone organique disponible pour la reminéralisation microbienne. Durant l’été, les mares étaient fortement stratifiées; il y avait un fort gradient physico-chimique au sein de la colonne d’eau, avec une couche d’eau supérieure oxique et une couche d’eau profonde pauvre en oxygène ou anoxique. Pour identifier les facteurs qui influencent les communautés microbiennes, des techniques de séquençage à haut débit ont été utilisées ciblant les transcrits des gènes de l’ARNr 16S et des gènes impliqués dans le cycle du méthane : mcrA pour la méthanogenèse et pmoA pour la méthanotrophie. Pour évaluer l’activité des micro-organismes, la concentration des transcrits des gènes fonctionnels a aussi été mesurée avec des PCR quantitatives (qPCR). Les résultats montrent une forte dominance de micro-organismes impliqués dans le cycle du méthane, c’est-à-dire des archées méthanogènes et des bactéries ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Arctique* palse* subarctique* Thermokarst pergélisol Université Laval: CorpusUL |
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QH 302.5 UL 2016 Méthane -- Québec (Province) Méthane -- Arctique Diversité microbienne -- Québec (Province) Diversité microbienne -- Arctique Pergélisols -- Québec (Province) Pergélisols -- Arctique Mares d'eau de fonte -- Québec (Province) Mares d'eau de fonte -- Arctique |
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La fonte et l’effondrement du pergélisol riche en glace dans la région subarctique du Québec ont donné lieu à la formation de petits lacs (mares de thermokarst) qui émettent des gaz à effet de serre dans l’atmosphère tels que du dioxyde de carbone et du méthane. Pourtant, la composition de la communauté microbienne qui est à la base des processus biogéochimiques dans les mares de fonte a été très peu étudiée, particulièrement en ce qui concerne la diversité et l’activité des micro-organismes impliqués dans le cycle du méthane. L’objectif de cette thèse est donc d’étudier la diversité phylogénétique et fonctionnelle des micro-organismes dans les mares de fonte subarctiques en lien avec les caractéristiques de l’environnement et les émissions de méthane. Pour ce faire, une dizaine de mares ont été échantillonnées dans quatre vallées situées à travers un gradient de fonte du pergélisol, et disposant de différentes propriétés physico-chimiques. Selon les vallées, les mares peuvent être issues de la fonte de palses (buttes de tourbe, à dominance organique) ou de lithalses (buttes de sol à dominance minérale) ce qui influence la nature du carbone organique disponible pour la reminéralisation microbienne. Durant l’été, les mares étaient fortement stratifiées; il y avait un fort gradient physico-chimique au sein de la colonne d’eau, avec une couche d’eau supérieure oxique et une couche d’eau profonde pauvre en oxygène ou anoxique. Pour identifier les facteurs qui influencent les communautés microbiennes, des techniques de séquençage à haut débit ont été utilisées ciblant les transcrits des gènes de l’ARNr 16S et des gènes impliqués dans le cycle du méthane : mcrA pour la méthanogenèse et pmoA pour la méthanotrophie. Pour évaluer l’activité des micro-organismes, la concentration des transcrits des gènes fonctionnels a aussi été mesurée avec des PCR quantitatives (qPCR). Les résultats montrent une forte dominance de micro-organismes impliqués dans le cycle du méthane, c’est-à-dire des archées méthanogènes et des bactéries ... |
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Québec (Province) Arctique |
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32665 http://hdl.handle.net/20.500.11794/26939 TC-QQLA-32665 |
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1802641932194676736 |