Genomics, transcriptomics and metabolomics of cold adaptation in arctic Mesorhizobium sp. N33
La souche arctique Mesorhizobium sp. N33 est une bactérie psychrotrophe reconnue comme l'un des rhizobiums fixateurs d'azote le mieux adapté au froid. Le profil transcriptomique et métabolomique de la souche arctique N33 a été déterminé en identifiant les patrons d'expression génétiqu...
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2018
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Online Access: | https://hdl.handle.net/20.500.11794/24128 |
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ftunivlavalcorp:oai:corpus.ulaval.ca:20.500.11794/24128 2024-06-23T07:50:50+00:00 Genomics, transcriptomics and metabolomics of cold adaptation in arctic Mesorhizobium sp. N33 Ghobakhlou, Abdollah Antoun, Hani Laberge, Serge 2018-04-19T21:17:37Z xiii, 219 p. application/pdf https://hdl.handle.net/20.500.11794/24128 eng eng 29489 http://hdl.handle.net/20.500.11794/24128 TC-QQLA-29489 http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 S 405 UL 2012 G427 Mesorhizobium sp. N33 -- Aspect génétique Génétique bactérienne Bactéries psychrophiles -- Facteurs climatiques Azote -- Fixation -- Aspect génétique Métabolomique thèse de doctorat COAR1_1::Texte::Thèse::Thèse de doctorat 2018 ftunivlavalcorp https://doi.org/20.500.11794/24128 2024-05-27T23:52:32Z La souche arctique Mesorhizobium sp. N33 est une bactérie psychrotrophe reconnue comme l'un des rhizobiums fixateurs d'azote le mieux adapté au froid. Le profil transcriptomique et métabolomique de la souche arctique N33 a été déterminé en identifiant les patrons d'expression génétique et les changements des metabolites sous différents stress hypothermiques. Des études utilisant des macropuces et des micropuces d'ADN et la PCR quantitative en temps réel ont montré que différentes fonctions cellulaires sont significativement affectées à basse température. Les chaperonnes, les protéines de choc au froid, la transcription, la traduction, les fonctions membranaires, les métabolismes, les systèmes de transport des éléments nutritifs, la génération d'énergie, l'accumulation de cryoprotectants (polyamines et mannitol), la detoxification des espèces réactives à oxygène (ROS), l'activité xylukinase, des facteurs de transcription et des protéines ayant des fonctions inconnues sont significativement régulés à la hausse à basse température. Beaucoup moins de gènes sont régulés à la baisse à basse température et appartiennent à diverses classes dont le métabolisme général, la motilité cellulaire, les systèmes de transport et de sécrétion, qui indiquent dans leur ensemble une baisse du métabolisme et de la dépense énergétique à basse température. Des études métabolomiques, utilisant la Chromatographie gazeuse couplée à la spectrométrie de masse et la résonance magnétique nucléaire, indiquent que la souche arctique N33 régule les niveaux de plusieurs composés. L'acide linoléique polyinsaturé (18:2(9, 12)) et l'acide gras polyinsaturé 18:2 (6, 9) sont les acides gras les plus abondants pour les conditions de cultures à basse température (4 et 10°C). L'acide gras phospho/neutre mono-insaturé 14:1(11) était le plus induit (45 fois plus élevé) lh de choc au froid. Cet acide gras rend la membrane cellulaire plus fluide, permet la detoxification des cellules des espèces réactives de l'oxygène (ROS) et agit comme source d'énergie ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Arctic Arctique* Université Laval: CorpusUL Arctic |
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Open Polar |
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Université Laval: CorpusUL |
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English |
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S 405 UL 2012 G427 Mesorhizobium sp. N33 -- Aspect génétique Génétique bactérienne Bactéries psychrophiles -- Facteurs climatiques Azote -- Fixation -- Aspect génétique Métabolomique |
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La souche arctique Mesorhizobium sp. N33 est une bactérie psychrotrophe reconnue comme l'un des rhizobiums fixateurs d'azote le mieux adapté au froid. Le profil transcriptomique et métabolomique de la souche arctique N33 a été déterminé en identifiant les patrons d'expression génétique et les changements des metabolites sous différents stress hypothermiques. Des études utilisant des macropuces et des micropuces d'ADN et la PCR quantitative en temps réel ont montré que différentes fonctions cellulaires sont significativement affectées à basse température. Les chaperonnes, les protéines de choc au froid, la transcription, la traduction, les fonctions membranaires, les métabolismes, les systèmes de transport des éléments nutritifs, la génération d'énergie, l'accumulation de cryoprotectants (polyamines et mannitol), la detoxification des espèces réactives à oxygène (ROS), l'activité xylukinase, des facteurs de transcription et des protéines ayant des fonctions inconnues sont significativement régulés à la hausse à basse température. Beaucoup moins de gènes sont régulés à la baisse à basse température et appartiennent à diverses classes dont le métabolisme général, la motilité cellulaire, les systèmes de transport et de sécrétion, qui indiquent dans leur ensemble une baisse du métabolisme et de la dépense énergétique à basse température. Des études métabolomiques, utilisant la Chromatographie gazeuse couplée à la spectrométrie de masse et la résonance magnétique nucléaire, indiquent que la souche arctique N33 régule les niveaux de plusieurs composés. L'acide linoléique polyinsaturé (18:2(9, 12)) et l'acide gras polyinsaturé 18:2 (6, 9) sont les acides gras les plus abondants pour les conditions de cultures à basse température (4 et 10°C). L'acide gras phospho/neutre mono-insaturé 14:1(11) était le plus induit (45 fois plus élevé) lh de choc au froid. Cet acide gras rend la membrane cellulaire plus fluide, permet la detoxification des cellules des espèces réactives de l'oxygène (ROS) et agit comme source d'énergie ... |
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Antoun, Hani Laberge, Serge |
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2018 |
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https://hdl.handle.net/20.500.11794/24128 |
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Arctic |
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29489 http://hdl.handle.net/20.500.11794/24128 TC-QQLA-29489 |
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1802641771958632448 |