Étude de la variabilité à petite échelle spatiale du microbiote de la moule bleue (Mytilus spp.)

• Main Author: Boucher-Fontaine, Jérémie
• Other Authors: Archambault, Philippe, St-Pierre, Yves
• Format: Other/Unknown Material
• Language: French
• Published: 2023
• Subjects: Mytilus; Hémolymphe; Microbiote; Bleue; Canada; Sentinelles; inuktitut
• Online Access: https://hdl.handle.net/20.500.11794/109663

Ce projet s'inscrit dans le programme UVILUQ, le terme inuktitut pour « moule », dont l'objectif est de développer l'utilisation des biopsies liquides chez la moule associée à la bancarisation sur cartes FTA pour le suivi de l'état de santé des écosystèmes côtiers. Cette nouvelle plateforme d'échantillonnage idéale pour les études en milieux éloignés donne accès à une panoplie d'informations sous la forme d'acides nucléiques, dont des biomarqueurs potentiels pour le suivi de l'état de santé des moules. Ce projet s'intéresse à l'un de ces derniers, soit le microbiote bactérien de l'hémolymphe. L'étude du microbiote bactérien chez les espèces sentinelles telles que la moule bleue est un domaine de recherche en expansion. Toutefois, pour pouvoir l'utiliser comme biomarqueur, il est essentiel d'avoir une compréhension étayée de sa variabilité spatiale naturelle à petite échelle afin d'établir des comparaisons de sites valides. Ce mémoire se penche sur la variabilité spatiale à petite échelle de la communauté bactérienne de l'hémolymphe des moules bleues (Mytilus spp.) ainsi que sur les processus biogéographiques sous-jacents. Le premier et seul chapitre présente une étude réalisée dans la moulière de Pointe-Mitis, retrouvée sur la rive sud de l'estuaire du Saint-Laurent, au Canada. Le microbiote de l'hémolymphe de moules provenant de plusieurs aires de la moulière présentant des caractéristiques d'habitat contrastées y a été caractérisé par métataxonomie basée sur l'ARNr 16S, permettant de définir les échelles spatiales de variation et d'avoir un aperçu de l'origine de ces différences. La conclusion générale de ce mémoire revient sur les résultats de cette étude ainsi que sur leur portée quant à l'utilisation potentielle du microbiote bactérien de l'hémolymphe comme biomarqueur. Les perspectives de recherche révélées par cette étude sont également abordées à travers la brève présentation de la deuxième partie de ce projet non incluse dans ce mémoire. Ce projet constitue ainsi un pas de plus vers l'utilisation du ...