Identificación de genes codificantes para sintetasas de péptidos no ribosomales sideróforas y sus potenciales metabolitos en el hongo Antártico Pseudogymnoascus 131209-E2A-C5II-EB
Entre todos los metabolitos secundarios fúngicos, los sideróforos destacan por ser un grupo de compuestos con gran diversidad estructural y aplicabilidad en diversas industrias biotecnológicas. Es por ello que la búsqueda de nuevos compuestos de esta familia de péptidos no ribosomales supone gran in...
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Universidad de Chile
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ftunivchile:oai:repositorio.uchile.cl:2250/188108 2023-05-15T14:16:27+02:00 Identificación de genes codificantes para sintetasas de péptidos no ribosomales sideróforas y sus potenciales metabolitos en el hongo Antártico Pseudogymnoascus 131209-E2A-C5II-EB Díaz Morales, Anaís Daniela Vaca Cerezo, Inmaculada 2022 application/pdf https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/188108 es spa Universidad de Chile https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/188108 Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ CC-BY-NC-ND Metabolitos secundarios Pseudogymnoascus 131209-E2A-C5II-EB Tesis 2022 ftunivchile 2022-10-01T23:49:46Z Entre todos los metabolitos secundarios fúngicos, los sideróforos destacan por ser un grupo de compuestos con gran diversidad estructural y aplicabilidad en diversas industrias biotecnológicas. Es por ello que la búsqueda de nuevos compuestos de esta familia de péptidos no ribosomales supone gran interés científico. Particularmente, el estudio de compuestos sideróforos producidos por hongos de ambientes extremos se ha enfocado en levaduras o en géneros fúngicos ampliamente conocidos como, por ejemplo, Aspergillus. Así, el estudio de otros géneros que habitan ambientes extremos y que son mucho menos conocidos, como Pseudogymnoascus, alberga un gran potencial interesantemente desconocido. En nuestro laboratorio se está estudiando como cepa modelo, la cepa fúngica antártica Pseudogymnoascus sp. 131209-E2A-C5II-EB. En ella se ha identificado un fragmento de 528 nucleótidos cuya secuencia evidenció un 63% de identidad con la de una sintetasa de péptidos no ribosomales (NRPS) productora de sideróforos de Aspergillus flavus. En base a este antecedente, el objetivo de este trabajo fue identificar en Pseudogymnoascus 131209-E2A-C5II-EB genes codificantes de sintetasas de péptidos no ribosomales y determinar si alguno de estos genes pertenece a la ruta de biosíntesis de algún potencial compuesto sideróforo producido por este organismo. El análisis bioinformático realizado determinó la presencia de dos genes que potencialmente codifican NRPSs sideróforas: gymA y gymE. El gen gymA se sitúa en un potencial cluster con sidA, un gen clave para la biosíntesis de sideróforos intracelulares de tipo ferricromo. Por otro lado, gymE se organiza entorno a un cluster conteniendo genes similares a sidJ, sidF, sidH, mirB y sit1, todos ellos potencialmente implicados en el metabolismo de sideróforos extracelulares, y cuyo producto sideróforo resultante pertenece a la familia de las fusarininas. En condiciones de cultivo deficientes en hierro se consiguió inducir la expresión del gen gymE, la cual se correlacionó con la presencia de ... Thesis Antártica Universidad de Chile: Repositorio académico Hongo ENVELOPE(-67.867,-67.867,-68.883,-68.883) Ruta ENVELOPE(18.412,18.412,69.835,69.835) Sida ENVELOPE(101.683,101.683,67.800,67.800) |
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Entre todos los metabolitos secundarios fúngicos, los sideróforos destacan por ser un grupo de compuestos con gran diversidad estructural y aplicabilidad en diversas industrias biotecnológicas. Es por ello que la búsqueda de nuevos compuestos de esta familia de péptidos no ribosomales supone gran interés científico. Particularmente, el estudio de compuestos sideróforos producidos por hongos de ambientes extremos se ha enfocado en levaduras o en géneros fúngicos ampliamente conocidos como, por ejemplo, Aspergillus. Así, el estudio de otros géneros que habitan ambientes extremos y que son mucho menos conocidos, como Pseudogymnoascus, alberga un gran potencial interesantemente desconocido. En nuestro laboratorio se está estudiando como cepa modelo, la cepa fúngica antártica Pseudogymnoascus sp. 131209-E2A-C5II-EB. En ella se ha identificado un fragmento de 528 nucleótidos cuya secuencia evidenció un 63% de identidad con la de una sintetasa de péptidos no ribosomales (NRPS) productora de sideróforos de Aspergillus flavus. En base a este antecedente, el objetivo de este trabajo fue identificar en Pseudogymnoascus 131209-E2A-C5II-EB genes codificantes de sintetasas de péptidos no ribosomales y determinar si alguno de estos genes pertenece a la ruta de biosíntesis de algún potencial compuesto sideróforo producido por este organismo. El análisis bioinformático realizado determinó la presencia de dos genes que potencialmente codifican NRPSs sideróforas: gymA y gymE. El gen gymA se sitúa en un potencial cluster con sidA, un gen clave para la biosíntesis de sideróforos intracelulares de tipo ferricromo. Por otro lado, gymE se organiza entorno a un cluster conteniendo genes similares a sidJ, sidF, sidH, mirB y sit1, todos ellos potencialmente implicados en el metabolismo de sideróforos extracelulares, y cuyo producto sideróforo resultante pertenece a la familia de las fusarininas. En condiciones de cultivo deficientes en hierro se consiguió inducir la expresión del gen gymE, la cual se correlacionó con la presencia de ... |
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