Diversité des communautés microbiennes de la rhizosphère d’une plante endémique des îles subantarctiques de Kerguelen et implication dans sa réponse au changement climatique et implication dans sa réponse au changement climatique

• Main Authors: B.R. Martins, T. Guillemette
• Format: Report
• Language: French
• Published: 2019
• Subjects: Communautés microbiennes; Iles Kerguelen; Lyallia Kerguelensis; rhizosphère; Subantarctique; Antarctic; Champignons; Îles Kerguelen; Kerguelen; Kerguelen Islands; Antarc*; Antarctique*
• Online Access: https://dune.univ-angers.fr/documents/dune10688; https://dune.univ-angers.fr/fichiers/17010131/2019TMBV10688/fichier/10688F.pdf

La région Subantarctique est menacée par un réchauffement climatique particulièrement intense et rapide. C’est le cas aux îles Kerguelen, une des Terres Australes et Antarctiques Françaises (TAAF) qui hébergent une plante en coussin Lyallia kerguelensis strictement endémique. Cette plante présente des nécroses dans toutes ses populations, un phénomène possiblement en rapport avec le changement climatique. Il convient dans l’urgence d’étudier en profondeur les facteurs environnementaux (biotiques et abiotiques) pouvant influencer la nécrose de cette plante afin de définir des stratégies efficaces et durables pour sa conservation. Les communautés microbiennes du sol jouent un rôle majeur dans ces écosystèmes (décomposition de la matière organique et production primaire) en raison de l’absence ou quasi-absence des insectes, herbivores et mammifères. Nous avons observé que ces sols hébergent une diversité plus importante de phyla bactériens que de phyla fongiques et que les réponses de ces derniers à leur environnement étaient différentes. Les bactéries étaient plus abondantes dans la rhizosphère que dans le sol contrôle alors que le type d’échantillon n’a pas influencé l’abondance fongique relative. Le ratio C/N quant à lui influence significativement la richesse bactérienne et fongique tandis que les teneurs en azote et carbone ont montré des corrélations uniquement chez les champignons. Des liens entre proportion de surface nécrosée et richesse des communautés microbiennes de la rhizosphère ont été observés chez L. kerguelensis sur une des stations. Ces travaux apportent les premières connaissances sur la composition des communautés microbiennes associées à une plante aux îles Kerguelen, ainsi que leurs corrélations avec des facteurs environnementaux et avec l’importance des nécroses au sein de la plante. The Subantarctic region is threatened by a particularly intense and rapid global warming. This is the case in the Kerguelen Islands, one of the French Southern and Antarctic Lands (TAAF), which hosts a strictly endemic cushion plant Lyallia kerguelensis. This plant shows necrosis in all its populations, a phenomenon possibly related to climate change. It is urgent to study in depth the environmental factors (biotic and abiotic) that can influence the necrosis of this plant in order to define effective and sustainable strategies for its conservation. Soil microbial communities play a major role in the subantarctic island ecosystems (decomposition of organic matter and primary production) due to the absence or near-absence of insects, herbivores and mammals. We observed that these soils harbor a greater diversity of bacterial phyla than fungal phyla and that the responses of these phyla to their environment were different. Bacteria were more abundant in the rhizosphere than in control soil, whereas the type of sample, either rhizosphere or control did not influence relative fungal abundance. The C:N ratio significantly influences the bacterial and fungal richness while the nitrogen and carbon contents showed correlations only in the fungi. Links between L. kerguelensis necrosis and richness of microbial communities were observed at one of the sampling stations. This work provides the first hints into the composition of soil microbial communities associated with a plant in Kerguelen, as well as their correlations with environmental factors and with the extent of necrosis within the plant.