Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters

La crescente domanda di poliesteri funzionalizzabili ha accresciuto l’interesse nello sviluppo di nuove strade per la sintesi biocatalizzata di polimeri, dove gli enzimi sono in grado di rispondere alla sfida di combinare condizioni di reazione sostenibili dal punto di vista ambientale con l’alta se...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: CESPUGLI, MARCO
Other Authors: Cespugli, Marco, GARDOSSI, Lucia
Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
Language:English
Published: Università degli Studi di Trieste 2019
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/11368/2938808
id ftunitriestiris:oai:arts.units.it:11368/2938808
record_format openpolar
spelling ftunitriestiris:oai:arts.units.it:11368/2938808 2023-05-15T14:03:34+02:00 Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters CESPUGLI, MARCO Cespugli, Marco GARDOSSI, Lucia 2019-03-01 http://hdl.handle.net/11368/2938808 eng eng Università degli Studi di Trieste http://hdl.handle.net/11368/2938808 info:eu-repo/semantics/openAccess biocatalysi polyester lipase cutinase bioinformatics Settore CHIM/06 - Chimica Organica info:eu-repo/semantics/doctoralThesis 2019 ftunitriestiris 2023-04-09T06:16:14Z La crescente domanda di poliesteri funzionalizzabili ha accresciuto l’interesse nello sviluppo di nuove strade per la sintesi biocatalizzata di polimeri, dove gli enzimi sono in grado di rispondere alla sfida di combinare condizioni di reazione sostenibili dal punto di vista ambientale con l’alta selettività ed efficienza della catalisi. Gli enzimi sono un’attrattiva sostenibile ai catalizzatori tossici usati nelle policondensazione, come quelli metallici, stagno in particolare. L’obiettivo di questa tesi è quello di integrare approcci sperimentali e bioinformatici per lo studio di nuovi biocatalizzatori per le policondensazioni. Una valida alternativa è infatti rappresentata dagli enzimi, i quali consentono riciclabilità, assenza di contaminazione del prodotto grazie all’immobilizzazione della proteina. Attualmente, i supporti per l’immobilizzazione sono di natura non rinnovabile (metacrilici e stirenici). In questa tesi (Capitolo 3) si è esplorata la possibilità di utilizzare la lolla di riso – un economico materiale di scarto lignocellulosico - a questo proposito. Verrà proposto un confronto tra metodi chemoenzimatici per la funzionalizzazione della lolla, con l’obiettivo di ottenere un supporto di immobilizzazione rinnovabile capace di rispondere alle sfide della green chemistry. Il metodo enzimatico utilizza un sistema laccasi-mediatore con l’inserimento di un linker diamminico. Questo approccio consente di evitare l’utilizzo del periodato di sodio, che è responsabile di importanti alterazioni nella struttura morfologica della lolla, come dimostrato da microscopia SEM. Candida antarctica Lipasi B e due asparaginasi sono state immobilizzate e testate. La lipasi immobilizzata è stata utilizzata per sintetizzare un poliestere con l’acido itaconico. Mentre le lipasi sono la più comune scelta per le reazioni di policondensazione, il nostro gruppo si è concentrato sullo studio di nuove serin idrolasi da utilizzare in questo campo, nello specifico, le cutinasi. Questa classe di enzimi è già stata utilizzata per ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Antarc* Antarctica Università degli studi di Trieste: ArTS (Archivio della ricerca di Trieste)
institution Open Polar
collection Università degli studi di Trieste: ArTS (Archivio della ricerca di Trieste)
op_collection_id ftunitriestiris
language English
topic biocatalysi
polyester
lipase
cutinase
bioinformatics
Settore CHIM/06 - Chimica Organica
spellingShingle biocatalysi
polyester
lipase
cutinase
bioinformatics
Settore CHIM/06 - Chimica Organica
CESPUGLI, MARCO
Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters
topic_facet biocatalysi
polyester
lipase
cutinase
bioinformatics
Settore CHIM/06 - Chimica Organica
description La crescente domanda di poliesteri funzionalizzabili ha accresciuto l’interesse nello sviluppo di nuove strade per la sintesi biocatalizzata di polimeri, dove gli enzimi sono in grado di rispondere alla sfida di combinare condizioni di reazione sostenibili dal punto di vista ambientale con l’alta selettività ed efficienza della catalisi. Gli enzimi sono un’attrattiva sostenibile ai catalizzatori tossici usati nelle policondensazione, come quelli metallici, stagno in particolare. L’obiettivo di questa tesi è quello di integrare approcci sperimentali e bioinformatici per lo studio di nuovi biocatalizzatori per le policondensazioni. Una valida alternativa è infatti rappresentata dagli enzimi, i quali consentono riciclabilità, assenza di contaminazione del prodotto grazie all’immobilizzazione della proteina. Attualmente, i supporti per l’immobilizzazione sono di natura non rinnovabile (metacrilici e stirenici). In questa tesi (Capitolo 3) si è esplorata la possibilità di utilizzare la lolla di riso – un economico materiale di scarto lignocellulosico - a questo proposito. Verrà proposto un confronto tra metodi chemoenzimatici per la funzionalizzazione della lolla, con l’obiettivo di ottenere un supporto di immobilizzazione rinnovabile capace di rispondere alle sfide della green chemistry. Il metodo enzimatico utilizza un sistema laccasi-mediatore con l’inserimento di un linker diamminico. Questo approccio consente di evitare l’utilizzo del periodato di sodio, che è responsabile di importanti alterazioni nella struttura morfologica della lolla, come dimostrato da microscopia SEM. Candida antarctica Lipasi B e due asparaginasi sono state immobilizzate e testate. La lipasi immobilizzata è stata utilizzata per sintetizzare un poliestere con l’acido itaconico. Mentre le lipasi sono la più comune scelta per le reazioni di policondensazione, il nostro gruppo si è concentrato sullo studio di nuove serin idrolasi da utilizzare in questo campo, nello specifico, le cutinasi. Questa classe di enzimi è già stata utilizzata per ...
author2 Cespugli, Marco
GARDOSSI, Lucia
format Doctoral or Postdoctoral Thesis
author CESPUGLI, MARCO
author_facet CESPUGLI, MARCO
author_sort CESPUGLI, MARCO
title Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters
title_short Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters
title_full Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters
title_fullStr Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters
title_full_unstemmed Integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters
title_sort integration of bioinformatics analysis and experimental biocatalysis for a comprehensive approach to the synthesis of renewable polyesters
publisher Università degli Studi di Trieste
publishDate 2019
url http://hdl.handle.net/11368/2938808
genre Antarc*
Antarctica
genre_facet Antarc*
Antarctica
op_relation http://hdl.handle.net/11368/2938808
op_rights info:eu-repo/semantics/openAccess
_version_ 1766274265998426112