Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo

Parkinsonova bolezen je kronična nevrodegenerativna bolezen, ki močno poslabša kvaliteto življenja pacientov. Čakalne vrste za nevrologa so danes precej dolge, pacienti pa so v tem obdobju brez ustrezne terapije s katero bi si olajšali simptome. Zato smo razvili avtomatsko metodo za določanje stopnj...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Zupanič, Matjaž
Other Authors: Žabkar, Jure
Format: Master Thesis
Language:Slovenian
Published: 2024
Subjects:
Online Access:https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=158700
https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=186413&dn=
https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/201613827
https://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-158700
id ftuniljubljanair:oai:repozitorij.uni-lj.si:IzpisGradiva.php-id-158700
record_format openpolar
spelling ftuniljubljanair:oai:repozitorij.uni-lj.si:IzpisGradiva.php-id-158700 2024-09-15T18:33:40+00:00 Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo Automatic assessment of finger tapping in patients with Parkinson's disease Zupanič, Matjaž Žabkar, Jure 2024-06-19 application/pdf https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=158700 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=186413&dn= https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/201613827 https://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-158700 slv slv https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=158700 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=186413&dn= https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/201613827 http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-158700 info:eu-repo/semantics/openAccess klasifikacija Parkinsonova bolezen test tapkanja s prsti strojno učenje classification Parkinson’s disease finger tapping test machine learning info:eu-repo/semantics/masterThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2024 ftuniljubljanair https://doi.org/20.500.12556/RUL-158700 2024-08-22T06:53:14Z Parkinsonova bolezen je kronična nevrodegenerativna bolezen, ki močno poslabša kvaliteto življenja pacientov. Čakalne vrste za nevrologa so danes precej dolge, pacienti pa so v tem obdobju brez ustrezne terapije s katero bi si olajšali simptome. Zato smo razvili avtomatsko metodo za določanje stopnje motorične prizadetosti oziroma bradikinezije Parkinsonove bolezni na podlagi testa tapkanja in s tem omogočili hitrejšo postavitev diagnoze. Zbrali smo 183 video posnetkov tapkanja, posnetih kar s pametnim telefonom v vsakdanjem okolju. Videe je v 5 razredov lestvice MDS-UPDRS ocenil nevrolog. Za prepoznavo roke smo uporabili MediaPipe Hand, ki nam kot rezultat vrne časovno vrsto skeleta roke. Za klasifikacijo smo ubrali dva različna pristopa. Prvič smo iz časovne vrste skeleta roke sami sestavili značilke, enkrat strogo po lestvici MDS-UPDRS, drugič pa se te nismo strogo držali. Te značilke smo nato uporabili v klasifikatorjih in z večplastnim perceptronom dosegli 61 % točnost in 0,62 F1 vrednost. V drugem pristopu smo časovno vrsto razdalj med palcem in kazalcem uporabili neposredno v polnem konvolucijskem nevronskem omrežju in dosegli 77 % točnost in 0,75 F1 vrednost. Izdelali smo še orodje za vizualizacijo tapkanja in izpis ključnih podatkov. Parkinson's disease is a chronic neurodegenerative disorder that severely impairs patients' quality of life. Currently, the waiting lists for a neurologist are quite long, and during this period, patients are without adequate therapy to alleviate their symptoms. Therefore, we have developed an automatic method to determine the level of motor impairment or bradykinesia of Parkinson's disease based on a tapping test, thus enabling faster diagnosis. We collected 183 tapping videos recorded with a smartphone in everyday environments, which were assessed by a neurologist into 5 classes of the MDS-UPDRS scale. For hand detection we used MediaPipe Hand, which returns a time series of the hand skeleton. For classification, we took two different approaches. First, we constructed ... Master Thesis sami Repository of the University of Ljubljana (RUL)
institution Open Polar
collection Repository of the University of Ljubljana (RUL)
op_collection_id ftuniljubljanair
language Slovenian
topic klasifikacija
Parkinsonova bolezen
test tapkanja s prsti
strojno učenje
classification
Parkinson’s disease
finger tapping test
machine learning
spellingShingle klasifikacija
Parkinsonova bolezen
test tapkanja s prsti
strojno učenje
classification
Parkinson’s disease
finger tapping test
machine learning
Zupanič, Matjaž
Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo
topic_facet klasifikacija
Parkinsonova bolezen
test tapkanja s prsti
strojno učenje
classification
Parkinson’s disease
finger tapping test
machine learning
description Parkinsonova bolezen je kronična nevrodegenerativna bolezen, ki močno poslabša kvaliteto življenja pacientov. Čakalne vrste za nevrologa so danes precej dolge, pacienti pa so v tem obdobju brez ustrezne terapije s katero bi si olajšali simptome. Zato smo razvili avtomatsko metodo za določanje stopnje motorične prizadetosti oziroma bradikinezije Parkinsonove bolezni na podlagi testa tapkanja in s tem omogočili hitrejšo postavitev diagnoze. Zbrali smo 183 video posnetkov tapkanja, posnetih kar s pametnim telefonom v vsakdanjem okolju. Videe je v 5 razredov lestvice MDS-UPDRS ocenil nevrolog. Za prepoznavo roke smo uporabili MediaPipe Hand, ki nam kot rezultat vrne časovno vrsto skeleta roke. Za klasifikacijo smo ubrali dva različna pristopa. Prvič smo iz časovne vrste skeleta roke sami sestavili značilke, enkrat strogo po lestvici MDS-UPDRS, drugič pa se te nismo strogo držali. Te značilke smo nato uporabili v klasifikatorjih in z večplastnim perceptronom dosegli 61 % točnost in 0,62 F1 vrednost. V drugem pristopu smo časovno vrsto razdalj med palcem in kazalcem uporabili neposredno v polnem konvolucijskem nevronskem omrežju in dosegli 77 % točnost in 0,75 F1 vrednost. Izdelali smo še orodje za vizualizacijo tapkanja in izpis ključnih podatkov. Parkinson's disease is a chronic neurodegenerative disorder that severely impairs patients' quality of life. Currently, the waiting lists for a neurologist are quite long, and during this period, patients are without adequate therapy to alleviate their symptoms. Therefore, we have developed an automatic method to determine the level of motor impairment or bradykinesia of Parkinson's disease based on a tapping test, thus enabling faster diagnosis. We collected 183 tapping videos recorded with a smartphone in everyday environments, which were assessed by a neurologist into 5 classes of the MDS-UPDRS scale. For hand detection we used MediaPipe Hand, which returns a time series of the hand skeleton. For classification, we took two different approaches. First, we constructed ...
author2 Žabkar, Jure
format Master Thesis
author Zupanič, Matjaž
author_facet Zupanič, Matjaž
author_sort Zupanič, Matjaž
title Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo
title_short Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo
title_full Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo
title_fullStr Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo
title_full_unstemmed Avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s Parkinsonovo boleznijo
title_sort avtomatsko ocenjevanje testa tapkanja s prsti pri bolnikih s parkinsonovo boleznijo
publishDate 2024
url https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=158700
https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=186413&dn=
https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/201613827
https://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-158700
genre sami
genre_facet sami
op_relation https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=158700
https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=186413&dn=
https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/201613827
http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-158700
op_rights info:eu-repo/semantics/openAccess
op_doi https://doi.org/20.500.12556/RUL-158700
_version_ 1810475366230261760