Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas

La capacidad de los organismos psicrófilos para sobrevivir y proliferar a bajas temperaturas implica la superación de grandes obstáculos inherentes a los ambientes permanentemente fríos. Desafíos impuestos por las bajas temperaturas tales como la reducción de la actividad enzimática, alteración de l...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Pellizza Pena, Leonardo Agustín
Other Authors: Arán, Martín, Smal, Clara
Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
Language:Spanish
Published: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2017
Subjects:
Online Access:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n6160_PellizzaPena
id ftunibueairesbd:tesis:tesis_n6160_PellizzaPena
record_format openpolar
spelling ftunibueairesbd:tesis:tesis_n6160_PellizzaPena 2024-02-04T09:55:23+01:00 Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas Structural genomics of Bizionia argentinensis: search and characterization of proteins active at low temperatures Pellizza Pena, Leonardo Agustín Arán, Martín Smal, Clara 2017-03-17 application/pdf https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n6160_PellizzaPena spa spa Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n6160_PellizzaPena info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar GENOMICA ESTRUCTURAL BACTERIA ANTARTICA BIZIONIA ARGENTINENSIS TPM DOMAIN ACTIVIDAD FOSFATASA MER R RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR STRUCTURAL GENOMICS ANTARCTIC BACTERIA BIZIANIA ARGENTINENSIS PHOSPHATASE ACTIVITY NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:ar-repo/semantics/tesis doctoral info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2017 ftunibueairesbd https://doi.org/20.500.12110/tesis_n6160_PellizzaPena 2024-01-11T02:07:32Z La capacidad de los organismos psicrófilos para sobrevivir y proliferar a bajas temperaturas implica la superación de grandes obstáculos inherentes a los ambientes permanentemente fríos. Desafíos impuestos por las bajas temperaturas tales como la reducción de la actividad enzimática, alteración de la fluidez de la membrana, bajo transporte de nutrientes y productos de desecho, disminución de las tasas de transcripción, traducción y división celular, muestran que uno de los determinantes claves de la adaptación de la vida al frío yace indudablemente en la función de las proteínas que conducen el metabolismo y el ciclo celular de los organismos. En este escenario, la bacteria marina Bizionia argentinensis, aislada en el Territorio Antártico Nacional, constituye un modelo interesante para el estudio de nuevas proteínas que posean actividad biológica en condiciones de bajas temperaturas. La caracterización bioquímica y estructural de estas biomoléculas es un punto de partida para la comprensión general de los mecanismos que permiten a las bacterias marinas adaptarse a estas condiciones de vida extremas. En esta tesis se presenta un estudio de genómica estructural de proteínas de función desconocida de la bacteria B. argentinensis. En este contexto, se describe la caracterización bioquímica y estructural de dos blancos seleccionados: las proteínas BA42 y BA40. En particular, la estructura tridimensional de la proteína BA42 fue resuelta mediante RMN y Cristalografía de Rayos X. Estudios bioquímicos y biofísicos determinaron que BA42 es una fosfatasa la cual depende estrictamente de metales para su función y que la flexibilidad de la región comprendida por el sitio de unión a metales está asociada a la actividad de la proteína. Un análisis del contexto genómico de BA42 mostró que la proteína integra un operón constituido por algunas proteínas de función desconocida y otras asociadas a diversos roles celulares. Una de ellas, denominada BA40, pertenece a la superfamilia de factores de transcripción MerR. En este ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Antarc* Antarctic antartic* Biblioteca Digital FCEN-UBA (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires) Antarctic Partida ENVELOPE(-61.216,-61.216,-62.589,-62.589)
institution Open Polar
collection Biblioteca Digital FCEN-UBA (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires)
op_collection_id ftunibueairesbd
language Spanish
topic GENOMICA ESTRUCTURAL
BACTERIA ANTARTICA
BIZIONIA ARGENTINENSIS
TPM DOMAIN
ACTIVIDAD FOSFATASA
MER R
RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR
STRUCTURAL GENOMICS
ANTARCTIC BACTERIA
BIZIANIA ARGENTINENSIS
PHOSPHATASE ACTIVITY
NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE
spellingShingle GENOMICA ESTRUCTURAL
BACTERIA ANTARTICA
BIZIONIA ARGENTINENSIS
TPM DOMAIN
ACTIVIDAD FOSFATASA
MER R
RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR
STRUCTURAL GENOMICS
ANTARCTIC BACTERIA
BIZIANIA ARGENTINENSIS
PHOSPHATASE ACTIVITY
NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE
Pellizza Pena, Leonardo Agustín
Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas
topic_facet GENOMICA ESTRUCTURAL
BACTERIA ANTARTICA
BIZIONIA ARGENTINENSIS
TPM DOMAIN
ACTIVIDAD FOSFATASA
MER R
RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR
STRUCTURAL GENOMICS
ANTARCTIC BACTERIA
BIZIANIA ARGENTINENSIS
PHOSPHATASE ACTIVITY
NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE
description La capacidad de los organismos psicrófilos para sobrevivir y proliferar a bajas temperaturas implica la superación de grandes obstáculos inherentes a los ambientes permanentemente fríos. Desafíos impuestos por las bajas temperaturas tales como la reducción de la actividad enzimática, alteración de la fluidez de la membrana, bajo transporte de nutrientes y productos de desecho, disminución de las tasas de transcripción, traducción y división celular, muestran que uno de los determinantes claves de la adaptación de la vida al frío yace indudablemente en la función de las proteínas que conducen el metabolismo y el ciclo celular de los organismos. En este escenario, la bacteria marina Bizionia argentinensis, aislada en el Territorio Antártico Nacional, constituye un modelo interesante para el estudio de nuevas proteínas que posean actividad biológica en condiciones de bajas temperaturas. La caracterización bioquímica y estructural de estas biomoléculas es un punto de partida para la comprensión general de los mecanismos que permiten a las bacterias marinas adaptarse a estas condiciones de vida extremas. En esta tesis se presenta un estudio de genómica estructural de proteínas de función desconocida de la bacteria B. argentinensis. En este contexto, se describe la caracterización bioquímica y estructural de dos blancos seleccionados: las proteínas BA42 y BA40. En particular, la estructura tridimensional de la proteína BA42 fue resuelta mediante RMN y Cristalografía de Rayos X. Estudios bioquímicos y biofísicos determinaron que BA42 es una fosfatasa la cual depende estrictamente de metales para su función y que la flexibilidad de la región comprendida por el sitio de unión a metales está asociada a la actividad de la proteína. Un análisis del contexto genómico de BA42 mostró que la proteína integra un operón constituido por algunas proteínas de función desconocida y otras asociadas a diversos roles celulares. Una de ellas, denominada BA40, pertenece a la superfamilia de factores de transcripción MerR. En este ...
author2 Arán, Martín
Smal, Clara
format Doctoral or Postdoctoral Thesis
author Pellizza Pena, Leonardo Agustín
author_facet Pellizza Pena, Leonardo Agustín
author_sort Pellizza Pena, Leonardo Agustín
title Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas
title_short Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas
title_full Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas
title_fullStr Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas
title_full_unstemmed Genómica estructural de Bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas
title_sort genómica estructural de bizionia argentinensis : búsqueda y caracterización de proteínas activas a bajas temperaturas
publisher Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
publishDate 2017
url https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n6160_PellizzaPena
long_lat ENVELOPE(-61.216,-61.216,-62.589,-62.589)
geographic Antarctic
Partida
geographic_facet Antarctic
Partida
genre Antarc*
Antarctic
antartic*
genre_facet Antarc*
Antarctic
antartic*
op_relation https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n6160_PellizzaPena
op_rights info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
op_doi https://doi.org/20.500.12110/tesis_n6160_PellizzaPena
_version_ 1789959339775098880