Association analyses of novel polymorphisms in the MMP-1 promoter gene with osteoarthritis secondary to hip dysplasia in dogs

• Main Authors: Fassa, V.B., Oertlin, G., Waldhorn, J.G., Álvarez, A.O., Maubecin, E.G., Pazos, D.A., Flores, M., Pinto, G.B., Huguet, M.J., Conte, A., Marrube, G.
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: English
• Published: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. 2010
• Subjects: canis lupus familiaris; displasia de cadera; osteoartritis; gen MMP-1; polimorfismos; hip dysplasia; osteoarthritis; MMP-1 gene; polymorphisms; Argentina; Hallan; Hallo; Indel’; Referencia; Canis lupus
• Online Access: http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=pveterinaria/invet&cl=CL1&d=HWA_4996; http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/pveterinaria/invet/index/assoc/HWA_4996.dir/4996.PDF

Hip dysplasia (HD) is a polygenic disease characterized by joint laxity and lack of congruence leading to osteoarthritis (OA). Under many pathogenic conditions including arthritis, MMP-1 synthesis is augmented. The MMP-1 gene promoter contains cytokine response elements, transcription factors AP-1 and SAF-1 that are increased in OA. The objective of the present study was to identify and characterize new polymorphisms of the canine MMP-1 promoter gene and evaluate their association with OA secondary to HD in different dog breeds. Based on the NCBI_006587 reference sequence, two novel polymorphisms, Indel CTGCCCT (bp31986794) and C>T (bpSNP 31986815) substitution were selected due their position in a consensus sequence belonging to a SAF-1 response element. Data was uploaded in the GenBank database (accession number GQ475524 and GQ475525). 125 dogs of different breeds were sampled and hip status was evaluated through ventrodorsal extended-hip radiographs. A chi-squared analysis was performed to test the association of the variables: breed, sex and genotype for each polymorphism with OA status (healthy and affected). No significant association (p>0.05) was found between any variable and OA secondary to HD. This study does not exclude MMP-1 as a gene responsible of OA secondary to HD in the breeds sampled because only the promoter sequence was evaluated. Fil: Fassa, V.B. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Área de Genética. Buenos Aires, Argentina Fil: Oertlin, G. Universidad de Morón. Buenos Aires, Argentina Fil: Waldhorn, J.G. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Hospital Escuela ?Ernesto Canepa?. Buenos Aires, Argentina Fil: Álvarez, A.O. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Hospital Escuela ?Ernesto Canepa?. Buenos Aires, Argentina Fil: Maubecin, E.G. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Hospital Escuela ?Ernesto Canepa?. Buenos Aires, Argentina Fil: Pazos, D.A. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Área de Bases Agrícolas. Buenos Aires, Argentina Fil: Flores, M. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Área de Estadística. Buenos Aires, Argentina Fil: Pinto, G.B. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Área de Genética. Buenos Aires, Argentina Fil: Huguet, M.J. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Área de Genética. Buenos Aires, Argentina Fil: Conte, A. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Área de Genética. Buenos Aires, Argentina Fil: Marrube, G. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Área de Genética. Buenos Aires, Argentina La displasia de cadera (DC) es una enfermedad poligénica caracterizada por laxitud articular y pérdida de congruencia que conduce a la osteoartritis (OA). En muchas condiciones patológicas, incluyendo a la artritis puede observarse un aumento de la síntesis de MMP-1. El promotor del gen MMP-1 contiene elementos de respuesta a citoquinas, los factores de trascripción AP-1 y SAF-1 que se hallan aumentados en OA. El objetivo del presente estudio fue la identificación y análisis de polimorfismos en el promotor del gen MMP-1 canino y su asociación a la OA secundaria a DC. Basados en la secuencia de referencia NCBI_006587, se detectaron dos nuevos polimorfismos, Indel CTGCCCT (bp31986794) y una sustitución C>T (bp31986815) que fueron seleccionadas para su análisis debido a su posición en la secuencia de consenso perteneciente al elemento de respuesta SAF-1. Los polimorfismos detectados se ingresaron a la base del GenBank (números de acceso GQ475524 y GQ475525). Se tomaron muestras de 125 perros de diferentes razas y se evaluó el estado de la cadera por medio de radiografías en posición ventro-dorsal. Se realizó un análisis estadístico por medio de un chi cuadrado para probar la asociación entre las variables raza, sexo y genotipo con el estado para OA (sanos y afectados). No se hallo asociación (p>0.05) entre ninguna variable y la condición de OA secundaria a DC. El estudio no excluye al gen MMP-1 como candidato responsable de OA secundaria a DC en las razas estudiadas ya que sólo se ha evaluado la región promotora del mismo.