Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica

• Main Authors: Izwan Bharudin, Radziah Zolkefli, Mohd Faizal Abu Bakar, Shazilah Kamaruddin, Rosli Md. Illias, Nazalan Najimudin, Nor Muhammad Mahadi, Farah Diba Abu Bakar, Abdul Munir Abdul Murad
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: English
• Published: Penerbit Universiti Kebangsaan Malaysia 2018
• Subjects: Dua; Antarc*; Antarctica
• Online Access: http://journalarticle.ukm.my/12188/; http://journalarticle.ukm.my/12188/1/06%20Izwan%20Bharudin.pdf; http://www.ukm.my/jsm/english_journals/vol47num8_2018/contentsVol47num8_2018.html

Mekanisme pengambilan dan penghasilan asid amino bagi mikroorganisma psikrofil yang bermandiri dan berpoliferasi pada persekitaran sejuk melampau masih belum difahami sepenuhnya. Objektif kajian ini ialah untuk mengenal pasti gen yang terlibat dalam penjanaan asid amino bagi yis psikrofil, Glaciozyma antarctica serta menentukan pengekspresan gen tersebut semasa kehadiran dan kekurangan asid amino dalam medium pertumbuhan. Pengenalpastian gen telah dilakukan melalui penjanaan penanda jujukan terekspres (ESTs) daripada dua perpustakaan cDNA yang dibina daripada sel yang dikultur dalam medium pertumbuhan kompleks dan medium pertumbuhan minimum tanpa asid amino. Sebanyak 3552 klon cDNA daripada setiap perpustakaan dipilih secara rawak untuk dijujuk menghasilkan 1492 transkrip unik (medium kompleks) dan 1928 transkrip unik (medium minimum). Analisis pemadanan telah mengenl pasti gen mengekod protein yang terlibat di dalam pengambilan asid amino bebas, biosintesis asid amino serta gen yang terlibat dengan kitar semula asid amino berdasarkan tapak jalan yang digunakan oleh yis model, Saccharomyces cerevisiae. Analisis pengekspresan gen menggunakan kaedah RT-qPCR menunjukkan pengekspresan gen mengekod protein yang terlibat di dalam pengambilan asid amino bebas iaitu permease adalah tinggi pada medium kompleks manakala pengekspresan kebanyakan gen mengekod protein yang terlibat dalam kitar semula dan biosintesis asid amino adalah tinggi di dalam medium minimum. Kesimpulannya, gen yang terlibat dalam penjanaan dan pengambilan asid amino bagi mikroorganisma psikrofil adalah terpulihara seperti mikroorganisma mesofil dan pengekspresan gen-gen ini adalah diaruh oleh kehadiran atau ketiadaan asid amino bebas pada persekitaran.