Diversidade estrutural da superfamília de receptores nucleares da ostra do pacífico: análise in silico de candidatos à ligação com estradiol

• Main Author: Madaloz, Tâmela Zamboni
• Other Authors: Maciel, Guilherme Razzera, Universidade Federal de Santa Catarina
• Format: Master Thesis
• Language: Portuguese
• Published: 2022
• Subjects: Bioquímica; Dinâmica molecular; Toxicologia ambiental; Bioinformática; Ostra-do-pacífico; Crassostrea gigas
• Online Access: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/237978

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2022. A crescente presença de contaminantes de origem antrópica em ambientes aquáticos representa desafios para as espécies que habitam locais contaminados. A superfamília dos receptores nucleares de animais, devido às características estruturais de ligação com ligantes que inibem ou induzem a transcrição de genes, são frequentes alvos de compostos xenobióticos. O presente trabalho busca entender o potencial de interação entre o hormônio estradiol, enquanto contaminante ambiental, e os receptores nucleares de Crassostrea gigas, a ostra do Pacífico, uma espécie filtradora e séssil, sujeita a mudanças ambientais e exposição a contaminantes. Na ostra do Pacífico, o receptor nuclear homólogo ao receptor de estrógeno de vertebrados não é capaz de ligar ao hormônio estradiol como ocorre em vertebrados. Possivelmente, outro receptor apresenta capacidade de responder a moléculas semelhantes ao estrógeno e derivados. A união de metodologias in silico de alto desempenho, como modelagem tridimensional, atracamento molecular e dinâmicas moleculares atomísticas foram empregadas para a identificação de candidatos de ligação provável com a molécula de interesse. Através dessa perspectiva, foi possível prever características estruturais para a superfamília de receptores nucleares da ostra do Pacífico e selecionar candidatos de interação com o contaminante desregulador endócrino de interesse, em um organismo invertebrado não modelo. Candidatos de interação muito favorável com a molécula de interesse, dentre a superfamília de receptores nucleares de C. gigas, foram encontrados em nossa abordagem, pertencentes aos grupos de receptores nucleares NR1D, NR1P, NR2E e NR0B. A aplicação dessa estratégia metodológica computacional demonstrou alto desempenho na triagem virtual de candidatos à ligação com a molécula xenobiótica de interesse, podendo ser empregada em outros estudos na área ...