Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2022. Ferramentas de biomonitoramento ambiental, como os biomarcadores, são necessárias para a identificação, avaliação e remediação do impacto antr...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | , , |
Format: | Master Thesis |
Language: | Portuguese |
Published: |
2022
|
Subjects: | |
Online Access: | https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/235030 |
id |
ftufsc:oai:repositorio.ufsc.br:123456789/235030 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftufsc:oai:repositorio.ufsc.br:123456789/235030 2024-09-09T19:37:19+00:00 Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) Vilas Bôas, Luiz Otávio de Barros Bainy, Afonso Celso Dias Maciel, Guilherme Razzera Universidade Federal de Santa Catarina 2022 64 p.| il., gráfs. application/pdf https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/235030 por por 375981 https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/235030 Bioquímica Glutationa Ostra-do-pacífico Dissertação (Mestrado) 2022 ftufsc 2024-06-21T08:20:18Z Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2022. Ferramentas de biomonitoramento ambiental, como os biomarcadores, são necessárias para a identificação, avaliação e remediação do impacto antrópico em ambientes aquáticos. Enzimas dos sistemas de biotransformação de fase II, como as Glutationa S-transferases (GST), estão entre os biomarcadores clássicos. Crassostrea gigas é a ostra mais cultivada do mundo e devido às suas características como organismo filtrante, séssil de ampla distribuição geográfica, tem sido frequentemente utilizada em estudos com biomarcadores. Mesmo que as GST sejam enzimas comumente estudadas em diversas espécies, pouco se sabe sobre esta família de proteínas em C. gigas. Em virtude de significativas mudanças na transcrição de genes e de atividade enzimática de GSTs da classe ômega, em ostras de aquicultura e ambientes naturais, ou expostas a hidrocarbonetos, diferentes salinidades e pH, em condições laboratoriais, o presente estudo teve como objetivo caracterizar estrutural e funcionalmente a GST Ômega 2.1 da ostra do Pacífico Crassostrea gigas (CgGSTO2.1), número de acesso XP_011429380.2 (NCBI). Um modelo tridimensional in silico dimérico foi construído para esta sequência. As análises de docking molecular geraram estimativas da afinidade por ligantes (?G) com os substratos Glutationa (GSH), Glutationa S-(2,4 dinitrobenzeno) (GDN) e Dehidroascorbato (DHA). Os valores de ?G sugerem maiores interações para GSH e GDN com GST ômega de C. gigas por meio dos resíduos Cisteína 28 (Cis28) e Lisina 55 (Lis55). Além disso, a proteína recombinante foi expressada, purificada, e uma fração foi obtida para testes de atividade. Os testes com CDNB demonstraram taxa de absorbância diferente do branco, sugerindo atividade GST, diferente da DHA, que demonstrou taxa de absorbância semelhante ao controle negativo. Novos ensaios in vitro com novas condições devem ser realizados, uma vez que as ... Master Thesis Crassostrea gigas Universidade Federal de Santa Catarina: Repositório Institucional da UFSC |
institution |
Open Polar |
collection |
Universidade Federal de Santa Catarina: Repositório Institucional da UFSC |
op_collection_id |
ftufsc |
language |
Portuguese |
topic |
Bioquímica Glutationa Ostra-do-pacífico |
spellingShingle |
Bioquímica Glutationa Ostra-do-pacífico Vilas Bôas, Luiz Otávio de Barros Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) |
topic_facet |
Bioquímica Glutationa Ostra-do-pacífico |
description |
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2022. Ferramentas de biomonitoramento ambiental, como os biomarcadores, são necessárias para a identificação, avaliação e remediação do impacto antrópico em ambientes aquáticos. Enzimas dos sistemas de biotransformação de fase II, como as Glutationa S-transferases (GST), estão entre os biomarcadores clássicos. Crassostrea gigas é a ostra mais cultivada do mundo e devido às suas características como organismo filtrante, séssil de ampla distribuição geográfica, tem sido frequentemente utilizada em estudos com biomarcadores. Mesmo que as GST sejam enzimas comumente estudadas em diversas espécies, pouco se sabe sobre esta família de proteínas em C. gigas. Em virtude de significativas mudanças na transcrição de genes e de atividade enzimática de GSTs da classe ômega, em ostras de aquicultura e ambientes naturais, ou expostas a hidrocarbonetos, diferentes salinidades e pH, em condições laboratoriais, o presente estudo teve como objetivo caracterizar estrutural e funcionalmente a GST Ômega 2.1 da ostra do Pacífico Crassostrea gigas (CgGSTO2.1), número de acesso XP_011429380.2 (NCBI). Um modelo tridimensional in silico dimérico foi construído para esta sequência. As análises de docking molecular geraram estimativas da afinidade por ligantes (?G) com os substratos Glutationa (GSH), Glutationa S-(2,4 dinitrobenzeno) (GDN) e Dehidroascorbato (DHA). Os valores de ?G sugerem maiores interações para GSH e GDN com GST ômega de C. gigas por meio dos resíduos Cisteína 28 (Cis28) e Lisina 55 (Lis55). Além disso, a proteína recombinante foi expressada, purificada, e uma fração foi obtida para testes de atividade. Os testes com CDNB demonstraram taxa de absorbância diferente do branco, sugerindo atividade GST, diferente da DHA, que demonstrou taxa de absorbância semelhante ao controle negativo. Novos ensaios in vitro com novas condições devem ser realizados, uma vez que as ... |
author2 |
Bainy, Afonso Celso Dias Maciel, Guilherme Razzera Universidade Federal de Santa Catarina |
format |
Master Thesis |
author |
Vilas Bôas, Luiz Otávio de Barros |
author_facet |
Vilas Bôas, Luiz Otávio de Barros |
author_sort |
Vilas Bôas, Luiz Otávio de Barros |
title |
Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) |
title_short |
Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) |
title_full |
Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) |
title_fullStr |
Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) |
title_full_unstemmed |
Caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) |
title_sort |
caracterização estrutural e funcional da isoforma glutationa s-transferase ômega 2.1, recombinante, de ostra crassostrea gigas (thunberg, 1793) |
publishDate |
2022 |
url |
https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/235030 |
genre |
Crassostrea gigas |
genre_facet |
Crassostrea gigas |
op_relation |
375981 https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/235030 |
_version_ |
1809906508375261184 |