Biologia estrutural da FABP4 humana e FABP2 de ostra: um estudo in silico das interações com ácidos graxos, xenobióticos e membrana

• Main Author: Santos, Karin dos
• Other Authors: Maciel, Guilherme Razzera, Universidade Federal de Santa Catarina
• Format: Master Thesis
• Language: Portuguese
• Published: 2021
• Subjects: Bioquímica; Ácidos graxos; Dinâmica molecular; Bioinformática; Claro; Crassostrea gigas
• Online Access: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/229240

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2021. Os lipídios são moléculas essenciais para os organismos e a família das proteínas de ligação com ácidos graxos (FABP) é uma das principais transportadoras dessas moléculas nas células. Nosso grupo mostrou uma diversidade aumentada de FABP em invertebrados, usando ostras como organismos modelo. Aumento na expressão gênica de FABP2 da ostra do Pacífico Crassostrea gigas foram observados após testes com estressores ambientais, sugerindo um potencial uso dessa proteína como biomarcador de contaminação aquática. O mecanismo molecular pelo qual os lipídios atingem os bolsões de ligação nas FABP ainda não está totalmente claro. Além disso, detalhes acerca da interação entre a proteína e as membranas na função de transporte precisam ser elucidados, até mesmo para os vertebrados. Devido à complexidade envolvida na interação FABP-membrana, FABP-ligante e FABP-proteínas citosólicas, faz-se necessário o uso de ferramentas modernas de biologia estrutural para compreender o processo em nível atômico. Para isso, nesse estudo foram empregadas técnicas de modelagem 3D, docking e dinâmica molecular em FABP2 de C. gigas. Foram encontradas preferências de ligação da proteína com ácido palmítico e com o xenobiótico diclofenaco. O resíduo R112 parece ser chave para a interação. Além disso, foram utilizadas técnicas de dinâmica molecular acelerada em um estudo aprofundado sobre a interação de FABP4 humana com a membrana, cujo modelo está em consonância com resultados experimentais reportados. Nossos resultados mostraram que o resíduo de F28 na hélice II parece ter papel fundamental para o mecanismo de interação com membranas e as mutações nessa posição podem ter efeitos expressivos na dinâmica de ligação. Esses dados podem contribuir para o entendimento dos mecanismos de interação da família das FABPs e para a área da toxicologia em geral, impulsionando o campo com novas ...