Prospecção e caracterização molecular de novas defensinas do tipo CSaß (Cg-Defs) e big defensinas (Cg-BigDefs) na ostra Crassostrea gigas
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2020. As defensinas são um dos peptídeos antimicrobianos (AMPs) mais abundantes e bem distribuídos entre os seres vivos. Elas compr...
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ftufsc:oai:repositorio.ufsc.br:123456789/216739 2024-09-09T19:37:26+00:00 Prospecção e caracterização molecular de novas defensinas do tipo CSaß (Cg-Defs) e big defensinas (Cg-BigDefs) na ostra Crassostrea gigas Rocha, Gustavo Rosa, Rafael da Universidade Federal de Santa Catarina 2020 58 p.| il., gráfs. application/pdf https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/216739 por por 370218 https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/216739 Biotecnologia Invertebrados Imunogenética Peptídeos Ostra-do-pacífico Dissertação (Mestrado) 2020 ftufsc 2024-06-21T09:33:34Z Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2020. As defensinas são um dos peptídeos antimicrobianos (AMPs) mais abundantes e bem distribuídos entre os seres vivos. Elas compreendem famílias multigênicas de peptídeos estabilizados por ligações dissulfeto e que apresentam atividade antimicrobiana contra um amplo espectro de microrganismos. Ostras Crassostrea gigas são organismos extremamente polimórficos e que possuem uma vasta diversidade de AMPs, incluindo defensinas do tipo CSaß e big defensinas. Embora possuam funções análogas, essas defensinas não são filogeneticamente relacionadas. Nesse contexto, o presente estudo investigou a diversidade molecular de defensinas do tipo CSaß (Cg-Defs) e big defensinas (Cg-BigDefs) em C. gigas. Por meio de buscas in silico, duas novas defensinas do tipo CSaß (nomeadas Cg-Defh3 e Cg- Defh4) e três big defensinas (nomeadas Cg-BigDef4, Cg-BigDef5 e Cg-BigDef6) foram encontradas em C. gigas. As duas novas Cg-Defs apresentam um peptídeo sinal, seguido de um pró-domínio e de um peptídeo maduro estabilizado por três ligações dissulfeto, possuindo uma alta identidade aminoacídica com defensinas do tipo CSaß de insetos. Além disso, as Cg-Defh3 e Cg-Defh4 são as primeiras defensinas de caráter aniônico identificadas em C. gigas. As três novas sequências de big defensinas são compostas por um peptídeo sinal, seguido de um pró- domínio e de um peptídeo maduro, possuindo a mesma assinatura molecular encontrada nas demais Cg-BigDefs. Ademais, os resultados também revelaram que as novas Cg-Defs e Cg- BigDefs apresentaram uma expressão muito baixa, ou até mesmo ausente, ainda que após a infecção experimental por patógenos de interesse aquícola. Esse resultado está possivelmente relacionado ao fato dessas defensinas estarem sujeitas ao fenômeno genético de PAV (gene presence/absence variation), no qual um gene está presente em alguns, mas não em todos os indivíduos ... Master Thesis Crassostrea gigas Universidade Federal de Santa Catarina: Repositório Institucional da UFSC Alta |
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Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2020. As defensinas são um dos peptídeos antimicrobianos (AMPs) mais abundantes e bem distribuídos entre os seres vivos. Elas compreendem famílias multigênicas de peptídeos estabilizados por ligações dissulfeto e que apresentam atividade antimicrobiana contra um amplo espectro de microrganismos. Ostras Crassostrea gigas são organismos extremamente polimórficos e que possuem uma vasta diversidade de AMPs, incluindo defensinas do tipo CSaß e big defensinas. Embora possuam funções análogas, essas defensinas não são filogeneticamente relacionadas. Nesse contexto, o presente estudo investigou a diversidade molecular de defensinas do tipo CSaß (Cg-Defs) e big defensinas (Cg-BigDefs) em C. gigas. Por meio de buscas in silico, duas novas defensinas do tipo CSaß (nomeadas Cg-Defh3 e Cg- Defh4) e três big defensinas (nomeadas Cg-BigDef4, Cg-BigDef5 e Cg-BigDef6) foram encontradas em C. gigas. As duas novas Cg-Defs apresentam um peptídeo sinal, seguido de um pró-domínio e de um peptídeo maduro estabilizado por três ligações dissulfeto, possuindo uma alta identidade aminoacídica com defensinas do tipo CSaß de insetos. Além disso, as Cg-Defh3 e Cg-Defh4 são as primeiras defensinas de caráter aniônico identificadas em C. gigas. As três novas sequências de big defensinas são compostas por um peptídeo sinal, seguido de um pró- domínio e de um peptídeo maduro, possuindo a mesma assinatura molecular encontrada nas demais Cg-BigDefs. Ademais, os resultados também revelaram que as novas Cg-Defs e Cg- BigDefs apresentaram uma expressão muito baixa, ou até mesmo ausente, ainda que após a infecção experimental por patógenos de interesse aquícola. Esse resultado está possivelmente relacionado ao fato dessas defensinas estarem sujeitas ao fenômeno genético de PAV (gene presence/absence variation), no qual um gene está presente em alguns, mas não em todos os indivíduos ... |
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