Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris

La present tesi doctoral es centra en la caracterització de sistemes d'expressió utilitzats per a la producció de proteïnes recombinants (RPP) en el llevat metilotròfic Pichia pastoris. Al llarg de tot aquest treball s'integren els resultats de diferents camps -enginyeria de bioprocessos i...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Garrigos, Javier
Other Authors: Valero Barranco, Francisco, Montesinos Seguí, José Luis, Garcia-Ortega, Xavier
Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
Language:Basque
Published: 2021
Subjects:
Online Access:https://ddd.uab.cat/record/241208
id ftuabarcelonapb:oai:ddd.uab.cat:241208
record_format openpolar
spelling ftuabarcelonapb:oai:ddd.uab.cat:241208 2023-07-16T03:52:03+02:00 Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris Garrigos, Javier Valero Barranco, Francisco, Montesinos Seguí, José Luis, Garcia-Ortega, Xavier 2021 application/pdf https://ddd.uab.cat/record/241208 baq baq Programa de Doctorat en Biotecnologia https://ddd.uab.cat/record/241208 urn:oai:ddd.uab.cat:241208 urn:oai:www.tdx.cat:10803/671119 urn:oai:egreta.uab.cat:studenttheses/a0e1b89e-0126-4db2-8453-8db7f863fb75 urn:oai:localhost:10803/671119 open access Tots els drets reservats. https://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/ Pichia pastoris Proteïna recombinant Proteína recombinante Recombinant protein Enginyeria de bioprocés Ingeniería de bioprocesos Bioprocess engineering Tecnologies Tesi doctoral TEXT 2021 ftuabarcelonapb 2023-06-27T23:50:36Z La present tesi doctoral es centra en la caracterització de sistemes d'expressió utilitzats per a la producció de proteïnes recombinants (RPP) en el llevat metilotròfic Pichia pastoris. Al llarg de tot aquest treball s'integren els resultats de diferents camps -enginyeria de bioprocessos i regulació génica- per tal d'ampliar la informació sobre els sistemes d'expressió analitzats i, així, reduir la incertesa a l'dissenyar un bioprocés RPP. En el primer capítol de la tesi, s'estudia el sistema clàssic d'expressió basat en el PAOX1. En un primer pas, es van cultivar en quimiòstat dos clons productors de la Lipasa 1 de Candida rugosa (Cr1l) amb diferent dosi gènica. D'aquesta manera, es va determinar la interrelació de tres factors importants en els bioprocessos RPP com ara la velocitat específica de creixement (μ), els nivells d'expressió relativa de el gen heteròleg (RTL) i la velocitat específica de generació de producte (qp) . A més, també es va monitoritzar l'expressió d'un factor de transcripció important per a la via d'utilització de metanol (MIT1). Un cop establertes les condicions òptimes d'operació en continu, es van dur a terme cultius en fed-batch per validar i comparar el comportament dels clons productors observat, tant des del punt de vista del seu estat fisiològic com de la cinètica de producció de Crl1 . Els inconvenients de l'ús de el potent sistema d'expressió basat en PAOX1-principalment derivat de l'ús de l'metanol com a font de carboni, font d'electrons i inductor de RPP- han portat a la comunitat de Pichia a investigar i desenvolupar sistemes d'expressió alternatius que no depenguin de l'addició de metanol. A causa d'això, en el segon capítol de la tesi, es van caracteritzar dos nous sistemes d'expressió, basats en el PPDF i PUPP, per determinar si poden competir amb l'àmpliament utilitzat PGAP en la producció de la Lipasa B de Candida antarctica (Calb) . El comportament dels tres sistemes d'expressió es va comparar, en primer lloc, en quimiòstat. Això va permetre obtenir informació sobre la ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Antarc* Antarctica Universitat Autònoma de Barcelona: Dipòsit Digital de Documents de la UAB Rugosa ENVELOPE(-61.250,-61.250,-62.633,-62.633)
institution Open Polar
collection Universitat Autònoma de Barcelona: Dipòsit Digital de Documents de la UAB
op_collection_id ftuabarcelonapb
language Basque
topic Pichia pastoris
Proteïna recombinant
Proteína recombinante
Recombinant protein
Enginyeria de bioprocés
Ingeniería de bioprocesos
Bioprocess engineering
Tecnologies
spellingShingle Pichia pastoris
Proteïna recombinant
Proteína recombinante
Recombinant protein
Enginyeria de bioprocés
Ingeniería de bioprocesos
Bioprocess engineering
Tecnologies
Garrigos, Javier
Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris
topic_facet Pichia pastoris
Proteïna recombinant
Proteína recombinante
Recombinant protein
Enginyeria de bioprocés
Ingeniería de bioprocesos
Bioprocess engineering
Tecnologies
description La present tesi doctoral es centra en la caracterització de sistemes d'expressió utilitzats per a la producció de proteïnes recombinants (RPP) en el llevat metilotròfic Pichia pastoris. Al llarg de tot aquest treball s'integren els resultats de diferents camps -enginyeria de bioprocessos i regulació génica- per tal d'ampliar la informació sobre els sistemes d'expressió analitzats i, així, reduir la incertesa a l'dissenyar un bioprocés RPP. En el primer capítol de la tesi, s'estudia el sistema clàssic d'expressió basat en el PAOX1. En un primer pas, es van cultivar en quimiòstat dos clons productors de la Lipasa 1 de Candida rugosa (Cr1l) amb diferent dosi gènica. D'aquesta manera, es va determinar la interrelació de tres factors importants en els bioprocessos RPP com ara la velocitat específica de creixement (μ), els nivells d'expressió relativa de el gen heteròleg (RTL) i la velocitat específica de generació de producte (qp) . A més, també es va monitoritzar l'expressió d'un factor de transcripció important per a la via d'utilització de metanol (MIT1). Un cop establertes les condicions òptimes d'operació en continu, es van dur a terme cultius en fed-batch per validar i comparar el comportament dels clons productors observat, tant des del punt de vista del seu estat fisiològic com de la cinètica de producció de Crl1 . Els inconvenients de l'ús de el potent sistema d'expressió basat en PAOX1-principalment derivat de l'ús de l'metanol com a font de carboni, font d'electrons i inductor de RPP- han portat a la comunitat de Pichia a investigar i desenvolupar sistemes d'expressió alternatius que no depenguin de l'addició de metanol. A causa d'això, en el segon capítol de la tesi, es van caracteritzar dos nous sistemes d'expressió, basats en el PPDF i PUPP, per determinar si poden competir amb l'àmpliament utilitzat PGAP en la producció de la Lipasa B de Candida antarctica (Calb) . El comportament dels tres sistemes d'expressió es va comparar, en primer lloc, en quimiòstat. Això va permetre obtenir informació sobre la ...
author2 Valero Barranco, Francisco,
Montesinos Seguí, José Luis,
Garcia-Ortega, Xavier
format Doctoral or Postdoctoral Thesis
author Garrigos, Javier
author_facet Garrigos, Javier
author_sort Garrigos, Javier
title Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris
title_short Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris
title_full Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris
title_fullStr Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris
title_full_unstemmed Multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in Pichia pastoris
title_sort multidisciplinary approach for recombinant protein production bioprocess design with classic and novel expression systems in pichia pastoris
publishDate 2021
url https://ddd.uab.cat/record/241208
long_lat ENVELOPE(-61.250,-61.250,-62.633,-62.633)
geographic Rugosa
geographic_facet Rugosa
genre Antarc*
Antarctica
genre_facet Antarc*
Antarctica
op_relation Programa de Doctorat en Biotecnologia
https://ddd.uab.cat/record/241208
urn:oai:ddd.uab.cat:241208
urn:oai:www.tdx.cat:10803/671119
urn:oai:egreta.uab.cat:studenttheses/a0e1b89e-0126-4db2-8453-8db7f863fb75
urn:oai:localhost:10803/671119
op_rights open access
Tots els drets reservats.
https://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/
_version_ 1771544354743123968