Distribution, expression et diversité de l'ammonium monooxygénase (amoA) des archaea dans les eaux du nord

• Main Author: Pedneault, Estelle
• Other Authors: Lovejoy, Connie
• Format: Thesis
• Language: French
• Published: Université Laval 2009
• Subjects: envir; geo; Arctic; Baffin Bay; Baie de Baffin; Ellesmere Island; Greenland; Arctique*; Baffin; Groenland
• Online Access: https://hdl.handle.net/20.500.11794/21065

Les micro-organismes constituent 90 % de la matière vivante océanique. Parmi eux, le Crenarchaeota Candidatus Nitrosopumilus maritimus a récemment été isolé, révélant que les membres du même clade sont responsables d'une grande part de la nitrification, dans le cycle de l'azote. Ce potentiel biochimique est détecté chez les Crenarchaeota avec une approche moléculaire, avec la présence et l'expression du gène de la sous-unité A de l'ammonium monooxygénase (amoA). L'environnement échantillonné, la région des Eaux du Nord (Nord de la Baie de Baffin, entre l'île Ellesmere et le Groenland) a une productivité biologique parmi les plus élevées en Arctique. Celle-ci résulte notamment d'apports externes de nitrate, le produit final de la nitrification. Les résultats obtenus démontrent que le gène amoA était abondamment présent et exprimé dans les Eaux du Nord, que sa distribution et son expression étaient influencées par certains paramètres environnementaux et que sa diversité phylogénétique différerait entre les analyses basées sur l'ADN (présence) et l'ADNc (expression). Microorganisms make up 90 % of living oceanic matter. Among them, Crenarchaeota Candidatus Nitrosopumilus maritimus has recently been isolated, revealing that the members of the same clade are responsible for a large part of nitrification in the nitrogen cycle. This biochemical potential is detected in Crenarchaeota with a molecular approach, with the presence and expression of the ammonium monooxygenase (amoA) subunit A gene. The sampled environment, the Northern Waters region (North Baffin Bay, between Ellesmere Island and Greenland) has some of the highest biological productivity in the Arctic. In particular, this is the result of external nitrate inputs, the final product of nitrification. The results show that the amoA gene was abundantly present and expressed in Northern Waters, that its distribution and expression were influenced by certain environmental parameters and that its phylogenetic diversity would differ between DNA (presence) and ...