| Summary: | En Europe, l'anguille (Anguilla anguilla) est une espèce en danger critique d'extinction. Or en RégionOccitanie, environ 160 professionnels vivent de la pêche à l'anguille. Au-delà de son intérêt économique, elle joue un rôle écologique majeurdans les écosystèmes, tant comme source d'alimentation que comme prédateur. L'infection par des pathogènes est considérée comme l'un desfacteurs de l'effondrement de la population d'anguilles. Depuis quelques années, des traitements alternatifs aux antibiotiques, préventifs et plusrespectueux de l'environnement sont mis au point, tels que les préparations à base de plantes terrestres ou d'algues. Des études ont montré lepotentiel des algues du genre Asparagopsis comme complément dans l'aquaculture puisque leur inclusion dans l'alimentation de certains poissonsa permis d'augmenter la croissance et l'expression de certains gènes liés à l'immunité. En Méditerranée, A. armata et A. taxiformis sontconsidérées comme envahissantes et représentent une biomasse peu valorisée dans ce cadre. Ainsi, l'objectif de la thèse est d'étudier le potentieldes deux espèces d'algues du genre Asparagopsis afin de prévenir et/ou traiter certaines pathologies (l'infection bactérienne par Edwardsiellaanguillarum et l'infection parasitaire par le nématode Anguillicola crassus), affectant l'anguille européenne. Pour cela, une approche combinantmétabolomique, métabarcoding, tests in vitro sur parasites et bactéries, tests in vivo de nourrissage et d'infection par des pathogènes ettranscriptomique a été utilisée. Cette approche transdisciplinaire a permis dans un premier temps, de mieux caractériser les facteurs de variationdu métabolome, des activités biologiques et du microbiote des deux espèces du genre Asparagopsis, et dans un deuxième temps d'évaluer leseffets d'extraits d'algues in vitro et de poudre d'algue in vivo sur la physiologie de l'anguille européenne et sur ses pathogènes. Ainsi, les deuxespèces présentent des différences significatives de composition chimique qui pourraient expliquer les ...
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