Régulation épigénétique du développement : approche eco-evo-devo des m6A-épitranscriptomes chez l'huître Crassostrea gigas

• Main Author: Le Franc, Lorane
• Other Authors: Normandie, Rivière, Guillaume, Favrel, Pascal
• Format: Thesis
• Language: French
• Published: 2021
• Subjects: Épitranscriptomique; M6A; Oyster; RNA; Methylation; Epitranscriptomic; Crassostrea gigas
• Online Access: http://www.theses.fr/2021NORMC216

La méthylation de l’ARN N6-méthyladénosine (m6A) est un nouveau mécanisme de régulation de l’expression des gènes via son implication dans l’épissage, la traduction et la stabilité des transcrits. Cette voie épitranscriptomique, composée de writers, d’erasers, et des readers, régule des étapes clés du développement comme la MZT et la différenciation cellulaire. Cependant, cette voie épitranscriptomique, influencée par l’environnement, montre des différences entre les Vertébrés et Ecdysozoaires étudiés et pose la question de sa conservation dans l’ensemble des Bilatériens et particulièrement chez les Lophotrochozoaires. L’étude de la conservation de la voie épitranscriptomique chez C. gigas a été réalisée par détection de la m6A par dotblot et spectrométrie de masse. Des orthologues de l’ensemble des acteurs de la machinerie ont été caractérisés in silico, et la présence de readers fonctionnels confirmée par RNA pull down/LC-MS2. L’analyse des méthylomes développementaux obtenus par MeRIP-seq montre une dynamique du niveau et de la localisation de la m6A au cours du développement de l’huître. Ces résultats montrent une régulation de la segmentation, de la gastrulation, de la différenciation tissulaire et de la métamorphose par la m6A, chez l’huître creuse. Enfin l’analyse de méthylomes ovocytaires dans des conditions environnementales contrastées démontre une fonction de transmission de trait de vie portée par la m6A chez l’huître. L’ensemble de ce travail a permis de démontrer la conservation du rôle développemental des épitranscriptomes m6A et de leur rôle de vecteur intergénérationnel de traits de vie pour la première fois, à notre connaissance, chez un Lophotrochozoaire. The RNA modification N6-methyladenosine (m6A) is a newly described regulatory layer of gene expression involved in RNA splicing, translation and stability. This epitranscriptomic pathway, composed of writers, erasers and readers, regulates key developmental steps such as MZT and cell differentiation. However, this epitranscriptomic ...