Compendium of 530 metagenome-assembled bacterial and archaeal genomes from the polar Arctic Ocean

International audience

Bibliographic Details
Published in:Nature Microbiology
Main Authors: Royo-Llonch, Marta, Sánchez, Pablo, Ruiz-González, Clara, Salazar, Guillem, Pedrós-Alió, Carlos, Sebastián, Marta, Labadie, Karine, Paoli, Lucas, M. Ibarbalz, Federico, Zinger, Lucie, Churcheward, Benjamin, Babin, Marcel, Bork, Peer, Boss, Emmanuel, Cochrane, Guy, de Vargas, Colomban, Gorsky, Gabriel, Grimsley, Nigel, Guidi, Lionel, Hingamp, Pascal, Iudicone, Daniele, Jaillon, Olivier, Kandels, Stefanie, Not, Fabrice, Ogata, Hiroyuki, Pesant, Stéphane, Poulton, Nicole, Raes, Jeroen, Sardet, Christian, Speich, Sabrina, Setmmann, Lars, Sullivan, Matthew, Chaffron, Samuel, Eveillard, Damien, Karsenti, Eric, Sunagawa, Shinichi, Wincker, Patrick, Karp-Boss, Lee, Bowler, Chris, Acinas, Silvia
Other Authors: Centro de Investigaciones Biológicas (CSIC), Consejo Superior de Investigaciones Cientificas = Spanish National Research Council (CSIC), Institute of Marine Sciences / Institut de Ciències del Mar Barcelona (ICM), Department of Biosystems Science and Engineering ETH Zürich (D-BSSE), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology Zürich (ETH Zürich), Centro Nacional de Biotecnología Madrid (CNB-CSIC), Universidad de Granada = University of Granada (UGR), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Department of Biological Sciences, University of Toronto Scarborough, Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics, Institut de biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas Buenos Aires (CONICET), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-École Centrale de Nantes (Nantes Univ - ECN), Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes université - UFR des Sciences et des Techniques (Nantes univ - UFR ST), Nantes Université - pôle Sciences et technologie, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Sciences et technologie, Nantes Université (Nantes Univ), Takuvik Joint International Laboratory ULAVAL-CNRS, Université Laval Québec (ULaval)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Molecular Biology Laboratory Heidelberg (EMBL), Universität Heidelberg Heidelberg = Heidelberg University, University of Maine - School of Marine Sciences, European Bioinformatics Institute Hinxton (EMBL-EBI), EMBL Heidelberg, ECOlogy of MArine Plankton (ECOMAP), Adaptation et diversité en milieu marin (ADMM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Biologie intégrative des organismes marins (BIOM), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Stazione Zoologica Anton Dohrn (SZN), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes (LAGE)
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:English
Published: HAL CCSD 2021
Subjects:
Online Access:https://hal.science/hal-04394793
https://doi.org/10.1038/s41564-021-00979-9
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Royo-Llonch, Marta
Sánchez, Pablo
Ruiz-González, Clara
Salazar, Guillem
Pedrós-Alió, Carlos
Sebastián, Marta
Labadie, Karine
Paoli, Lucas
M. Ibarbalz, Federico
Zinger, Lucie
Churcheward, Benjamin
Babin, Marcel
Bork, Peer
Boss, Emmanuel
Cochrane, Guy
de Vargas, Colomban
Gorsky, Gabriel
Grimsley, Nigel
Guidi, Lionel
Hingamp, Pascal
Iudicone, Daniele
Jaillon, Olivier
Kandels, Stefanie
Not, Fabrice
Ogata, Hiroyuki
Pesant, Stéphane
Poulton, Nicole
Raes, Jeroen
Sardet, Christian
Speich, Sabrina
Setmmann, Lars
Sullivan, Matthew
Chaffron, Samuel
Eveillard, Damien
Karsenti, Eric
Sunagawa, Shinichi
Wincker, Patrick
Karp-Boss, Lee
Bowler, Chris
Acinas, Silvia
Compendium of 530 metagenome-assembled bacterial and archaeal genomes from the polar Arctic Ocean
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description International audience
author2 Centro de Investigaciones Biológicas (CSIC)
Consejo Superior de Investigaciones Cientificas = Spanish National Research Council (CSIC)
Institute of Marine Sciences / Institut de Ciències del Mar Barcelona (ICM)
Department of Biosystems Science and Engineering ETH Zürich (D-BSSE)
Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology Zürich (ETH Zürich)
Centro Nacional de Biotecnología Madrid (CNB-CSIC)
Universidad de Granada = University of Granada (UGR)
Institut de Biologie François JACOB (JACOB)
Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
Department of Biological Sciences, University of Toronto Scarborough
Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
Institut de biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS)
École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas Buenos Aires (CONICET)
Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS)
Département de Biologie - ENS Paris
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N)
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-École Centrale de Nantes (Nantes Univ - ECN)
Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes université - UFR des Sciences et des Techniques (Nantes univ - UFR ST)
Nantes Université - pôle Sciences et technologie
Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Sciences et technologie
Nantes Université (Nantes Univ)
Takuvik Joint International Laboratory ULAVAL-CNRS
Université Laval Québec (ULaval)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg (EMBL)
Universität Heidelberg Heidelberg = Heidelberg University
University of Maine - School of Marine Sciences
European Bioinformatics Institute Hinxton (EMBL-EBI)
EMBL Heidelberg
ECOlogy of MArine Plankton (ECOMAP)
Adaptation et diversité en milieu marin (ADMM)
Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV)
Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV)
Biologie intégrative des organismes marins (BIOM)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut méditerranéen d'océanologie (MIO)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Stazione Zoologica Anton Dohrn (SZN)
Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE)
Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes (LAGE)
format Article in Journal/Newspaper
author Royo-Llonch, Marta
Sánchez, Pablo
Ruiz-González, Clara
Salazar, Guillem
Pedrós-Alió, Carlos
Sebastián, Marta
Labadie, Karine
Paoli, Lucas
M. Ibarbalz, Federico
Zinger, Lucie
Churcheward, Benjamin
Babin, Marcel
Bork, Peer
Boss, Emmanuel
Cochrane, Guy
de Vargas, Colomban
Gorsky, Gabriel
Grimsley, Nigel
Guidi, Lionel
Hingamp, Pascal
Iudicone, Daniele
Jaillon, Olivier
Kandels, Stefanie
Not, Fabrice
Ogata, Hiroyuki
Pesant, Stéphane
Poulton, Nicole
Raes, Jeroen
Sardet, Christian
Speich, Sabrina
Setmmann, Lars
Sullivan, Matthew
Chaffron, Samuel
Eveillard, Damien
Karsenti, Eric
Sunagawa, Shinichi
Wincker, Patrick
Karp-Boss, Lee
Bowler, Chris
Acinas, Silvia
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Sánchez, Pablo
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Babin, Marcel
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Boss, Emmanuel
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de Vargas, Colomban
Gorsky, Gabriel
Grimsley, Nigel
Guidi, Lionel
Hingamp, Pascal
Iudicone, Daniele
Jaillon, Olivier
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Not, Fabrice
Ogata, Hiroyuki
Pesant, Stéphane
Poulton, Nicole
Raes, Jeroen
Sardet, Christian
Speich, Sabrina
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Nature Microbiology
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Nature Microbiology, 2021, 6 (12), pp.1561-1574. ⟨10.1038/s41564-021-00979-9⟩
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Paris (ENS-PSL) Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas Buenos Aires (CONICET) Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS) Département de Biologie - ENS Paris Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL) Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N) Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique) Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-École Centrale de Nantes (Nantes Univ - 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Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE) Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes (LAGE) 2021-11-15 https://hal.science/hal-04394793 https://doi.org/10.1038/s41564-021-00979-9 en eng HAL CCSD Nature Publishing Group info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1038/s41564-021-00979-9 hal-04394793 https://hal.science/hal-04394793 doi:10.1038/s41564-021-00979-9 ISSN: 2058-5276 EISSN: 2058-5276 Nature Microbiology https://hal.science/hal-04394793 Nature Microbiology, 2021, 6 (12), pp.1561-1574. ⟨10.1038/s41564-021-00979-9⟩ [SDV]Life Sciences [q-bio] info:eu-repo/semantics/article Journal articles 2021 ftsorbonneuniv https://doi.org/10.1038/s41564-021-00979-9 2024-01-23T23:37:36Z International audience Article in Journal/Newspaper Arctic Arctic Ocean HAL Sorbonne Université Arctic Arctic Ocean Nature Microbiology 6 12 1561 1574