Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring

Örverusamfélagið í Skarðshver, flæðarmálshvers sem staðsettur er á vestanverðu Vatnsnesi, var rannsakað með tilliti til fjölda ræktanlegra örvera við mismunandi hitastig á bilinu 60-70°C og hugsanlegrar tilvistar kítínmeltandi örvera. Efnagreining á jarðhitavökva hversins gaf til kynna að Skarðshver...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Sigurður Davíðsson 1998-
Other Authors: Háskóli Íslands
Format: Thesis
Language:English
Published: 2020
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/1946/35890
id ftskemman:oai:skemman.is:1946/35890
record_format openpolar
spelling ftskemman:oai:skemman.is:1946/35890 2023-05-15T16:52:23+02:00 Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring Sigurður Davíðsson 1998- Háskóli Íslands 2020-06 application/pdf http://hdl.handle.net/1946/35890 en eng http://hdl.handle.net/1946/35890 Líffræði Hverir Örverur Thesis Bachelor's 2020 ftskemman 2022-12-11T06:52:42Z Örverusamfélagið í Skarðshver, flæðarmálshvers sem staðsettur er á vestanverðu Vatnsnesi, var rannsakað með tilliti til fjölda ræktanlegra örvera við mismunandi hitastig á bilinu 60-70°C og hugsanlegrar tilvistar kítínmeltandi örvera. Efnagreining á jarðhitavökva hversins gaf til kynna að Skarðshver sé basískur ferskvatnshver sem blandist við sjó og myndi ísalt umhverfi við jarðhitauppspretturnar. Alls voru 95 bakteríustofnar tegundagreindir í verkefninu. Raðgreining á hluta 16S rRNA gena þeirra leiddi í ljós að þeir tilheyra 13 tegundum baktería af 7 mismunandi ættkvíslum. Á meðal þeirra var Thermus igniterrae sem hefur ekki verið einangruð úr sjó áður. Tegundafjölbreytni greindist hærri á sýnatökustað við 61,5°C en 72,8°C. Auðgun gaf til kynna að kítínmeltandi örverur finnist í hvernum. Í heildina varpa niðurstöður þessa verkefnis ljósi á þá rannsóknarmöguleika sem eru fyrir hendi í flæðarmálshvernum Skarðshver. The microbial community at Skarðshver, an intertidal hot spring located on the Vatnsnes peninsula in the north-west of Iceland, was examined by determining the number of culturable bacteria at temperature points between 60-70°C and performing an enrichment for potentially chitinolytic microorganisms. Chemical analysis of the geothermal water at Skarðshver indicated that it is an alkaline freshwater geothermal hot spring that mixes with seawater to form a brackish environment around the outflows. A total of 95 strains of bacteria were identified in the project. Analysis of partial 16S rRNA genes revealed that the strains belonged to 13 species pertaining to 7 separate genera. One of the isolated strains, Thermus igniterrae, has not been isolated in a marine environment before. The results indicated a higher degree of diversity at the sampling site measuring 61.5°C than 72.8°C. Chitin enrichments suggested the growth of chitinolytic microorganisms within the hot spring. Overall, the results of this project highlight further research potential at the Skarðshver intertidal hot springs. Thesis Iceland Skemman (Iceland) Varpa ENVELOPE(11.284,11.284,64.505,64.505)
institution Open Polar
collection Skemman (Iceland)
op_collection_id ftskemman
language English
topic Líffræði
Hverir
Örverur
spellingShingle Líffræði
Hverir
Örverur
Sigurður Davíðsson 1998-
Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring
topic_facet Líffræði
Hverir
Örverur
description Örverusamfélagið í Skarðshver, flæðarmálshvers sem staðsettur er á vestanverðu Vatnsnesi, var rannsakað með tilliti til fjölda ræktanlegra örvera við mismunandi hitastig á bilinu 60-70°C og hugsanlegrar tilvistar kítínmeltandi örvera. Efnagreining á jarðhitavökva hversins gaf til kynna að Skarðshver sé basískur ferskvatnshver sem blandist við sjó og myndi ísalt umhverfi við jarðhitauppspretturnar. Alls voru 95 bakteríustofnar tegundagreindir í verkefninu. Raðgreining á hluta 16S rRNA gena þeirra leiddi í ljós að þeir tilheyra 13 tegundum baktería af 7 mismunandi ættkvíslum. Á meðal þeirra var Thermus igniterrae sem hefur ekki verið einangruð úr sjó áður. Tegundafjölbreytni greindist hærri á sýnatökustað við 61,5°C en 72,8°C. Auðgun gaf til kynna að kítínmeltandi örverur finnist í hvernum. Í heildina varpa niðurstöður þessa verkefnis ljósi á þá rannsóknarmöguleika sem eru fyrir hendi í flæðarmálshvernum Skarðshver. The microbial community at Skarðshver, an intertidal hot spring located on the Vatnsnes peninsula in the north-west of Iceland, was examined by determining the number of culturable bacteria at temperature points between 60-70°C and performing an enrichment for potentially chitinolytic microorganisms. Chemical analysis of the geothermal water at Skarðshver indicated that it is an alkaline freshwater geothermal hot spring that mixes with seawater to form a brackish environment around the outflows. A total of 95 strains of bacteria were identified in the project. Analysis of partial 16S rRNA genes revealed that the strains belonged to 13 species pertaining to 7 separate genera. One of the isolated strains, Thermus igniterrae, has not been isolated in a marine environment before. The results indicated a higher degree of diversity at the sampling site measuring 61.5°C than 72.8°C. Chitin enrichments suggested the growth of chitinolytic microorganisms within the hot spring. Overall, the results of this project highlight further research potential at the Skarðshver intertidal hot springs.
author2 Háskóli Íslands
format Thesis
author Sigurður Davíðsson 1998-
author_facet Sigurður Davíðsson 1998-
author_sort Sigurður Davíðsson 1998-
title Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring
title_short Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring
title_full Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring
title_fullStr Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring
title_full_unstemmed Isolation of bacterial strains from the Skarðshver intertidal hot spring
title_sort isolation of bacterial strains from the skarðshver intertidal hot spring
publishDate 2020
url http://hdl.handle.net/1946/35890
long_lat ENVELOPE(11.284,11.284,64.505,64.505)
geographic Varpa
geographic_facet Varpa
genre Iceland
genre_facet Iceland
op_relation http://hdl.handle.net/1946/35890
_version_ 1766042614574874624