Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni
Hægt er að rannsaka tegundarmyndun með því að skoða mismunandi afbrigði sömu tegundar sem eru að aðskiljast erfðafræðilega. Bleikja (Salvinus alpinus) er tegund ferskvatnsfisks sem tilheyrir ætt laxfiska (Salmonidae). Bleikjuna má finna á norrænum slóðum og til eru mörg afbrigði af fiskinum. Í Þingv...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Format: | Thesis |
Language: | Icelandic |
Published: |
2017
|
Subjects: | |
Online Access: | http://hdl.handle.net/1946/26670 |
id |
ftskemman:oai:skemman.is:1946/26670 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftskemman:oai:skemman.is:1946/26670 2023-05-15T14:30:13+02:00 Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni Genotyping arctic charr morphs in Lake Thingvallavatn Völundur Hafstað 1994- Háskóli Íslands 2017-01 application/pdf http://hdl.handle.net/1946/26670 is ice http://hdl.handle.net/1946/26670 Líffræði Bleikja Thesis Bachelor's 2017 ftskemman 2022-12-11T06:55:12Z Hægt er að rannsaka tegundarmyndun með því að skoða mismunandi afbrigði sömu tegundar sem eru að aðskiljast erfðafræðilega. Bleikja (Salvinus alpinus) er tegund ferskvatnsfisks sem tilheyrir ætt laxfiska (Salmonidae). Bleikjuna má finna á norrænum slóðum og til eru mörg afbrigði af fiskinum. Í Þingvallavatni finnast fjögur mismunandi afbrigði bleikju: murta (PL), sílableikja (PI), dvergbleikja (SB) og kuðungableikja (LB). Raðgreining á umritunarmengi hefur varpað ljósi á stakar basabreytingar sem eru einkennandi fyrir PL, SB og LB. Átta þessara breytileika voru prófaðir með KASP arfgerðargreiningu. DNA úr bleikjuafbrigðunum fjórum var einangrað og sett í 96 brunna bakka. Settar voru fram fjórar rannsóknarspurningar: 1) voru þetta raunverulegar basabreytingar sem fengust úr raðgreiningunni, 2) eru stofnarnir fjórir aðskildir, 3) eru niðurstöður KASP í samræmi við niðurstöður raðgreiningarinnar og 4) er munur á milli PI og PL afbrigðanna? Kí-kvaðrat próf á tíðni arfgerða og allela milli afbrigða gáfu til kynna að raunverulegur breytileiki var á milli afbrigðanna á þessum lókusum (P<0,05). Ætla má að þetta séu aðskildir stofnar því hver breytileiki er ekki í Hardy-Weinberg jafnvægi. Innan afbrigða eru erfðamörkin í Hardy-Weinberg jafnvægi. Athugað var hvort að samræmi væri í tíðni breytileika hjá PI og PL og marktækur munur reyndist vera á stofnunum á fjórum breytileikum (P<0,05). Tíðni breytileika er í samræmi við gögnin sem fengust úr raðgreiningu umritunarmengisins. Munurinn á tíðni þessara tveggja rannsókna hjá hverju afbrigði er normaldreifður, en marktækur munur er á þessum rannsóknum hjá PL afbrigðinu og þegar öll afbrigðin eru skoðuð saman í t-prófi. Fylgnistuðull rannsóknanna er 0,96. Þessi rannsókn staðfestir að þessi fjögur bleikjuafbrigði eru erfðafræðilega frábrugðin, sem hjálpar okkur að skilja hvernig tegundarmyndun á sér stað. By examining different morphs of the same species that are in the process of genetic separation it is possible to shed light on the process of speciation. The Arctic ... Thesis Arctic charr Arctic Skemman (Iceland) Arctic Bakka ENVELOPE(12.127,12.127,65.507,65.507) |
institution |
Open Polar |
collection |
Skemman (Iceland) |
op_collection_id |
ftskemman |
language |
Icelandic |
topic |
Líffræði Bleikja |
spellingShingle |
Líffræði Bleikja Völundur Hafstað 1994- Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni |
topic_facet |
Líffræði Bleikja |
description |
Hægt er að rannsaka tegundarmyndun með því að skoða mismunandi afbrigði sömu tegundar sem eru að aðskiljast erfðafræðilega. Bleikja (Salvinus alpinus) er tegund ferskvatnsfisks sem tilheyrir ætt laxfiska (Salmonidae). Bleikjuna má finna á norrænum slóðum og til eru mörg afbrigði af fiskinum. Í Þingvallavatni finnast fjögur mismunandi afbrigði bleikju: murta (PL), sílableikja (PI), dvergbleikja (SB) og kuðungableikja (LB). Raðgreining á umritunarmengi hefur varpað ljósi á stakar basabreytingar sem eru einkennandi fyrir PL, SB og LB. Átta þessara breytileika voru prófaðir með KASP arfgerðargreiningu. DNA úr bleikjuafbrigðunum fjórum var einangrað og sett í 96 brunna bakka. Settar voru fram fjórar rannsóknarspurningar: 1) voru þetta raunverulegar basabreytingar sem fengust úr raðgreiningunni, 2) eru stofnarnir fjórir aðskildir, 3) eru niðurstöður KASP í samræmi við niðurstöður raðgreiningarinnar og 4) er munur á milli PI og PL afbrigðanna? Kí-kvaðrat próf á tíðni arfgerða og allela milli afbrigða gáfu til kynna að raunverulegur breytileiki var á milli afbrigðanna á þessum lókusum (P<0,05). Ætla má að þetta séu aðskildir stofnar því hver breytileiki er ekki í Hardy-Weinberg jafnvægi. Innan afbrigða eru erfðamörkin í Hardy-Weinberg jafnvægi. Athugað var hvort að samræmi væri í tíðni breytileika hjá PI og PL og marktækur munur reyndist vera á stofnunum á fjórum breytileikum (P<0,05). Tíðni breytileika er í samræmi við gögnin sem fengust úr raðgreiningu umritunarmengisins. Munurinn á tíðni þessara tveggja rannsókna hjá hverju afbrigði er normaldreifður, en marktækur munur er á þessum rannsóknum hjá PL afbrigðinu og þegar öll afbrigðin eru skoðuð saman í t-prófi. Fylgnistuðull rannsóknanna er 0,96. Þessi rannsókn staðfestir að þessi fjögur bleikjuafbrigði eru erfðafræðilega frábrugðin, sem hjálpar okkur að skilja hvernig tegundarmyndun á sér stað. By examining different morphs of the same species that are in the process of genetic separation it is possible to shed light on the process of speciation. The Arctic ... |
author2 |
Háskóli Íslands |
format |
Thesis |
author |
Völundur Hafstað 1994- |
author_facet |
Völundur Hafstað 1994- |
author_sort |
Völundur Hafstað 1994- |
title |
Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni |
title_short |
Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni |
title_full |
Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni |
title_fullStr |
Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni |
title_full_unstemmed |
Arfgerðargreining bleikjuafbrigða í Þingvallavatni |
title_sort |
arfgerðargreining bleikjuafbrigða í þingvallavatni |
publishDate |
2017 |
url |
http://hdl.handle.net/1946/26670 |
long_lat |
ENVELOPE(12.127,12.127,65.507,65.507) |
geographic |
Arctic Bakka |
geographic_facet |
Arctic Bakka |
genre |
Arctic charr Arctic |
genre_facet |
Arctic charr Arctic |
op_relation |
http://hdl.handle.net/1946/26670 |
_version_ |
1766304106227433472 |