Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni

Tegundamyndun er flókið ferli og er mörgum spurningum um það ósvarað. Í tilfellum þar sem stofnar hafa aðlagast mismunandi umhverfi en teljast samt til sömu tegundar er talað um afbrigði innan tegundar sem líta má á sem millistig í tegundamyndun. Með því að skoða afbrigði er hægt að rannsaka krafta...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Þóra Margrét Bergsveinsdóttir 1992-
Other Authors: Háskóli Íslands
Format: Thesis
Language:Icelandic
Published: 2017
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/1946/26603
id ftskemman:oai:skemman.is:1946/26603
record_format openpolar
spelling ftskemman:oai:skemman.is:1946/26603 2023-05-15T14:30:13+02:00 Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni Genotyping of single nucleotide polymorphisms in four morphs of arctic charr (Salvelinus alpinus) from Lake Thingvallavatn Þóra Margrét Bergsveinsdóttir 1992- Háskóli Íslands 2017-01 application/pdf http://hdl.handle.net/1946/26603 is ice http://hdl.handle.net/1946/26603 Líffræði Bleikja Thesis Bachelor's 2017 ftskemman 2022-12-11T06:49:45Z Tegundamyndun er flókið ferli og er mörgum spurningum um það ósvarað. Í tilfellum þar sem stofnar hafa aðlagast mismunandi umhverfi en teljast samt til sömu tegundar er talað um afbrigði innan tegundar sem líta má á sem millistig í tegundamyndun. Með því að skoða afbrigði er hægt að rannsaka krafta sem hafa áhrif á fyrstu skref í tilurð tegunda. Hentugt kerfi til slíkra rannsókna er bleikjan í Þingvallavatni. Þar finnast fjögur afbrigði af bleikju (Salvelinus alpinus): Kuðungableikja, dvergbleikja, murta og sílableikja. Þar sem genatjáning í fósturþroska getur haft mikilvæg áhrif á svipgerðareiginleika hafa Jóhannes Guðbrandsson og samstarfsmenn hans rannsakað umritunarmengi í snemmfóstrum kuðungableikju, dvergbleikju og murtu og fundið fjölda stakra basabreytinga (SNPs) með mismunandi tíðni milli afbrigða. Í þessari rannsókn voru sex basabreytingar skoðaðar og tíðni þeirra metin í stofni. Vísar voru hannaðir og prófaðir á samtals 93 sýnum úr bleikjuafbrigðunum fjórum. KASP™ arfgerðagreining var framkvæmd til að afla upplýsinga um arfgerðir og tíðni samsæta fyrir hvern SNP innan hvers afbrigðis. Markmið rannsóknarinnar var að kanna i) hvort breytileikarnir væru raunverulegir, ii) hvort stofnarnir fjórir væru aðskildir og iii) hvort mun mætti finna á murtu og sílableikju. Einnig var kannað hvort iv) breytileikarnir erfðust óháð og v) hvort samband væri milli tíðni basabreytinga í stofni og í umritunarmengi. Allir breytileikarnir sem skoðaðir voru reyndust raunverulegir. Auk þess virtust stofnarnir vera aðskildir og erfðafræðilegur munur fannst á murtu og sílableikju. Flest genanna virtust erfast óháð hvort öðru sem bendir til þess að afbrigðin æxlist mjög sjaldan. Gott samband var milli tíðni í umritunarmengi og í stofni. Niðurstöðurnar voru á margan hátt áhugaverðar en í sumum tilfellum var þörf á aukinni sýnastærð fyrir áreiðanlegri niðurstöður. Speciation is a complex process about which many questions remain unanswered. Phenotypically distinct morphs can evolve within populations of what are still ... Thesis Arctic charr Arctic Salvelinus alpinus Skemman (Iceland) Arctic
institution Open Polar
collection Skemman (Iceland)
op_collection_id ftskemman
language Icelandic
topic Líffræði
Bleikja
spellingShingle Líffræði
Bleikja
Þóra Margrét Bergsveinsdóttir 1992-
Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni
topic_facet Líffræði
Bleikja
description Tegundamyndun er flókið ferli og er mörgum spurningum um það ósvarað. Í tilfellum þar sem stofnar hafa aðlagast mismunandi umhverfi en teljast samt til sömu tegundar er talað um afbrigði innan tegundar sem líta má á sem millistig í tegundamyndun. Með því að skoða afbrigði er hægt að rannsaka krafta sem hafa áhrif á fyrstu skref í tilurð tegunda. Hentugt kerfi til slíkra rannsókna er bleikjan í Þingvallavatni. Þar finnast fjögur afbrigði af bleikju (Salvelinus alpinus): Kuðungableikja, dvergbleikja, murta og sílableikja. Þar sem genatjáning í fósturþroska getur haft mikilvæg áhrif á svipgerðareiginleika hafa Jóhannes Guðbrandsson og samstarfsmenn hans rannsakað umritunarmengi í snemmfóstrum kuðungableikju, dvergbleikju og murtu og fundið fjölda stakra basabreytinga (SNPs) með mismunandi tíðni milli afbrigða. Í þessari rannsókn voru sex basabreytingar skoðaðar og tíðni þeirra metin í stofni. Vísar voru hannaðir og prófaðir á samtals 93 sýnum úr bleikjuafbrigðunum fjórum. KASP™ arfgerðagreining var framkvæmd til að afla upplýsinga um arfgerðir og tíðni samsæta fyrir hvern SNP innan hvers afbrigðis. Markmið rannsóknarinnar var að kanna i) hvort breytileikarnir væru raunverulegir, ii) hvort stofnarnir fjórir væru aðskildir og iii) hvort mun mætti finna á murtu og sílableikju. Einnig var kannað hvort iv) breytileikarnir erfðust óháð og v) hvort samband væri milli tíðni basabreytinga í stofni og í umritunarmengi. Allir breytileikarnir sem skoðaðir voru reyndust raunverulegir. Auk þess virtust stofnarnir vera aðskildir og erfðafræðilegur munur fannst á murtu og sílableikju. Flest genanna virtust erfast óháð hvort öðru sem bendir til þess að afbrigðin æxlist mjög sjaldan. Gott samband var milli tíðni í umritunarmengi og í stofni. Niðurstöðurnar voru á margan hátt áhugaverðar en í sumum tilfellum var þörf á aukinni sýnastærð fyrir áreiðanlegri niðurstöður. Speciation is a complex process about which many questions remain unanswered. Phenotypically distinct morphs can evolve within populations of what are still ...
author2 Háskóli Íslands
format Thesis
author Þóra Margrét Bergsveinsdóttir 1992-
author_facet Þóra Margrét Bergsveinsdóttir 1992-
author_sort Þóra Margrét Bergsveinsdóttir 1992-
title Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni
title_short Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni
title_full Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni
title_fullStr Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni
title_full_unstemmed Arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (Salvelinus alpinus) í Þingvallavatni
title_sort arfgerðagreiningar á stökum basabreytingum í fjórum afbrigðum bleikju (salvelinus alpinus) í þingvallavatni
publishDate 2017
url http://hdl.handle.net/1946/26603
geographic Arctic
geographic_facet Arctic
genre Arctic charr
Arctic
Salvelinus alpinus
genre_facet Arctic charr
Arctic
Salvelinus alpinus
op_relation http://hdl.handle.net/1946/26603
_version_ 1766304107673419776