Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju
Bleikjustofnar Þingvallavatns hafa verið mikið rannsakaðir sökum aðgreiningar þeirra m.t.t. lögunar, vistfræði og hegðunarmynstra þeirra. Fjórir stofnar eru í vatninu; tveir botnlægir stofnar, einn svifætu stofn og sá fjórði er fiskæta. Botnlægu fiskarnir hafa styttri trjónu og styttri neðri kjálka...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Format: | Thesis |
Language: | English |
Published: |
2016
|
Subjects: | |
Online Access: | http://hdl.handle.net/1946/24734 |
id |
ftskemman:oai:skemman.is:1946/24734 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftskemman:oai:skemman.is:1946/24734 2023-05-15T14:30:09+02:00 Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju Validation of a miR-199a target site on ets2 3’UTR in Arctic charr Ásrún María Óttarsdóttir 1992- Háskóli Íslands 2016-06 application/pdf http://hdl.handle.net/1946/24734 en eng http://hdl.handle.net/1946/24734 Lífefna- og sameindalíffræði Bleikja Þingvallavatn Vistfræði Thesis Bachelor's 2016 ftskemman 2022-12-11T06:54:04Z Bleikjustofnar Þingvallavatns hafa verið mikið rannsakaðir sökum aðgreiningar þeirra m.t.t. lögunar, vistfræði og hegðunarmynstra þeirra. Fjórir stofnar eru í vatninu; tveir botnlægir stofnar, einn svifætu stofn og sá fjórði er fiskæta. Botnlægu fiskarnir hafa styttri trjónu og styttri neðri kjálka meðan hinir tveir stofnarnir hafa lengri trjónu og neðri kjálka að svipaðri lengd og sá efri. Í tilraunum með víxlæxlun og stjórn á umhverfi fiskanna, hefur verið sýnt fram á að erfðir spila hlutverk í hvortveggja mismun á lögun fiskssins og hegðun hans m.t.t. fæðuöflunar. Tjáningarmynstur miRNA er mismunandi milli stofna og lagt hefur verið til að það sé drifkraftur í kvíslun stofna. Vitað er að eitt þessara miRNA er miR-199a sem m.a. hefur áhrif á beinmyndun. Rannsókn á genatjáningu var framkvæmd með hliðsjón af höfuðkúpu myndun (Ahi et al. 2014) sem greindi frá Ets2, ásamt öðrum eftirmyndunarþáttum, sem mögulegum stýrlum þessa gena kerfis. ets2 sýndi einnig öfuga tjáningu við miR-199a og mögulegt tengi set á 3’UTR röð sinni fyrir miR-199a bindingu. Til þessa að meta hvort að miR-199a hefur tengi set á ets2 og hvort að þau eigi samskipti innan frumunnar klónaði ég ets2 3’UTR röðina inn í lúsiferasa klöguskjóðu genaferju. Þar að auki hannaði ég neikvæð viðmið með því að framkalla QuikChange stökkbreytingu og hóf að undirbua lúsiferasa próf. The Arctic charr morphs in Lake Thingvallavatn, Iceland, have been subject to much research due to their distinct morphological, ecological and behavioural differences. Four morphs reside in the lake; two benthivorous morphs, a planktivorous morph and a piscivorous morph. The benthivorous morphs have a short snout and shorter lower jaw while the other two morphs have longer snouts and lower jaws close in length to the upper jaw. Through experiments with crossbreeding and controlling of the environment of the fish, it has been shown that genetics play a role in both the differences in morphology and in feeding behaviour. miRNA expression patterns in particular, differ between the ... Thesis Arctic charr Arctic Iceland Þingvallavatn Skemman (Iceland) Arctic Stjórn ENVELOPE(-18.041,-18.041,63.810,63.810) Þingvallavatn ENVELOPE(-21.150,-21.150,64.183,64.183) |
institution |
Open Polar |
collection |
Skemman (Iceland) |
op_collection_id |
ftskemman |
language |
English |
topic |
Lífefna- og sameindalíffræði Bleikja Þingvallavatn Vistfræði |
spellingShingle |
Lífefna- og sameindalíffræði Bleikja Þingvallavatn Vistfræði Ásrún María Óttarsdóttir 1992- Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju |
topic_facet |
Lífefna- og sameindalíffræði Bleikja Þingvallavatn Vistfræði |
description |
Bleikjustofnar Þingvallavatns hafa verið mikið rannsakaðir sökum aðgreiningar þeirra m.t.t. lögunar, vistfræði og hegðunarmynstra þeirra. Fjórir stofnar eru í vatninu; tveir botnlægir stofnar, einn svifætu stofn og sá fjórði er fiskæta. Botnlægu fiskarnir hafa styttri trjónu og styttri neðri kjálka meðan hinir tveir stofnarnir hafa lengri trjónu og neðri kjálka að svipaðri lengd og sá efri. Í tilraunum með víxlæxlun og stjórn á umhverfi fiskanna, hefur verið sýnt fram á að erfðir spila hlutverk í hvortveggja mismun á lögun fiskssins og hegðun hans m.t.t. fæðuöflunar. Tjáningarmynstur miRNA er mismunandi milli stofna og lagt hefur verið til að það sé drifkraftur í kvíslun stofna. Vitað er að eitt þessara miRNA er miR-199a sem m.a. hefur áhrif á beinmyndun. Rannsókn á genatjáningu var framkvæmd með hliðsjón af höfuðkúpu myndun (Ahi et al. 2014) sem greindi frá Ets2, ásamt öðrum eftirmyndunarþáttum, sem mögulegum stýrlum þessa gena kerfis. ets2 sýndi einnig öfuga tjáningu við miR-199a og mögulegt tengi set á 3’UTR röð sinni fyrir miR-199a bindingu. Til þessa að meta hvort að miR-199a hefur tengi set á ets2 og hvort að þau eigi samskipti innan frumunnar klónaði ég ets2 3’UTR röðina inn í lúsiferasa klöguskjóðu genaferju. Þar að auki hannaði ég neikvæð viðmið með því að framkalla QuikChange stökkbreytingu og hóf að undirbua lúsiferasa próf. The Arctic charr morphs in Lake Thingvallavatn, Iceland, have been subject to much research due to their distinct morphological, ecological and behavioural differences. Four morphs reside in the lake; two benthivorous morphs, a planktivorous morph and a piscivorous morph. The benthivorous morphs have a short snout and shorter lower jaw while the other two morphs have longer snouts and lower jaws close in length to the upper jaw. Through experiments with crossbreeding and controlling of the environment of the fish, it has been shown that genetics play a role in both the differences in morphology and in feeding behaviour. miRNA expression patterns in particular, differ between the ... |
author2 |
Háskóli Íslands |
format |
Thesis |
author |
Ásrún María Óttarsdóttir 1992- |
author_facet |
Ásrún María Óttarsdóttir 1992- |
author_sort |
Ásrún María Óttarsdóttir 1992- |
title |
Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju |
title_short |
Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju |
title_full |
Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju |
title_fullStr |
Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju |
title_full_unstemmed |
Sannprófun miR-199a marksets á ets2 3’UTR í bleikju |
title_sort |
sannprófun mir-199a marksets á ets2 3’utr í bleikju |
publishDate |
2016 |
url |
http://hdl.handle.net/1946/24734 |
long_lat |
ENVELOPE(-18.041,-18.041,63.810,63.810) ENVELOPE(-21.150,-21.150,64.183,64.183) |
geographic |
Arctic Stjórn Þingvallavatn |
geographic_facet |
Arctic Stjórn Þingvallavatn |
genre |
Arctic charr Arctic Iceland Þingvallavatn |
genre_facet |
Arctic charr Arctic Iceland Þingvallavatn |
op_relation |
http://hdl.handle.net/1946/24734 |
_version_ |
1766304053472526336 |