Edad, filogenia y ciclo de vida: Factores que moldean la composición de la microbiota intestinal en la foca de puerto (Phoca vitulina richardii)

• Main Author: ARLETTE MARIMAR PACHECO SANDOVAL
• Other Authors: María Asunción Lago Lestón, Yolanda Schramm Urrutia
• Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
• Language: Spanish
• Published: CICESE 2022
• Subjects: info:eu-repo/classification/autor/foca de puerto del Pacífico; microbiota del intestino; pinnípedos; centinela ambiental; info:eu-repo/classification/autor/Pacific harbor seal; gut microbiota; pinnipeds; environmental sentinel; info:eu-repo/classification/cti/2; info:eu-repo/classification/cti/24; info:eu-repo/classification/cti/2401; info:eu-repo/classification/cti/240105; Alta; Foca; Focas; Pacific; harbor seal; Phoca vitulina
• Online Access: http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3757

Los microorganismos desempeñan un papel fundamental en la fisiología y la salud de los animales. A pesar de su importancia, la información sobre la microbiota de los mamíferos marinos es escasa. Conocer los factores naturales que influyen en la composición y función de la microbiota es crucial para entender la influencia de los microorganismos en los animales. Mediante la secuenciación del gen 16S ARNr (V4), este estudio evaluó el efecto del ciclo anual, el sexo, la edad y la filogenia en la microbiota intestinal de las focas de puerto del Pacífico (Phoca vitulina richardii). Se colectaron muestras fecales de focas y otros pinnípedos que habitan en México y se utilizó RStudio para realizar análisis de diversidad, abundancia diferencial e inferencias funcionales. Con respecto al efecto del ciclo anual, los cambios en la composición y función de la microbiota se relacionaron con diferencias en requerimientos energéticos y periodos de ayuno. Los microorganismos responden a cambios en el metabolismo energético y proporcionan nutrientes fundamentales en periodos de escasa alimentación. Estos hallazgos resaltan la importancia de la microbiota en la fisiología de las focas de puerto. El sexo tiene un impacto mínimo en la composición microbiana del intestino debido al bajo dimorfismo sexual y a la alta variabilidad intrasexual de las focas. La influencia de la localidad en la microbiota, se relacionó con cambios en el consumo de presas y a una exposición a diferentes fuentes microbianas. La principal causa de las variaciones microbianas relacionadas con la edad fueron las diferencias en la dieta. A medida que las focas crecen, el grupo núcleo se reduce y la diversidad microbiana aumenta. Las hembras adultas y las crías tuvieron mayores similitudes microbianas que los machos adultos con crías. De acuerdo al estudio de las funciones de la microbiota, las crías estaban transitando de una dieta basada en leche a una sólida. Además, las vías metabólicas relacionadas con una drástica pérdida de peso y masa corporal, indicaron ...