Adaptations structurales et fonctionnelles aux températures extrêmes au sein de la famille des alpha-amylases chlorure-dépendantes
L’adaptation thermique des protéines extremophiles a été étudiée de manière à approfondir notre compréhension des mécanismes moléculaires qui en sont responsables. Dans ce but, deux études ont été initiées et publiées. La première est basée sur la "mésophilisation" de l’α-amylase psychroph...
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ULiège - Université de Liège
2012
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ftorbi:oai:orbi.ulg.ac.be:2268/134382 2024-10-13T14:03:02+00:00 Adaptations structurales et fonctionnelles aux températures extrêmes au sein de la famille des alpha-amylases chlorure-dépendantes Structural and functional adaptations to extreme temperatures inside the chloride-dependent alpha-amylases family Cipolla, Alexandre Feller, Georges CIP - Centre d'Ingénierie des Protéines - ULiège 2012-10-24 110 https://orbi.uliege.be/handle/2268/134382 https://orbi.uliege.be/bitstream/2268/134382/1/Thesis%20ACipolla-complete.pdf fr fre ULiège - Université de Liège https://orbi.uliege.be/handle/2268/134382 info:hdl:2268/134382 open access http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 info:eu-repo/semantics/openAccess Extremophile Enzyme Biochimie Life sciences Biochemistry biophysics & molecular biology Sciences du vivant biophysique & biologie moléculaire doctoral thesis http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 info:eu-repo/semantics/doctoralThesis 2012 ftorbi 2024-09-27T07:01:42Z L’adaptation thermique des protéines extremophiles a été étudiée de manière à approfondir notre compréhension des mécanismes moléculaires qui en sont responsables. Dans ce but, deux études ont été initiées et publiées. La première est basée sur la "mésophilisation" de l’α-amylase psychrophile AHA, issue de la bactérie Antarctique Pseudoalteromonas haloplanktis. L’ajout d’interactions faibles et d’un pont disulfure présents chez son homologue mésophile PPA de Sus scrofa et absents chez AHA ont permis de construire deux mutants multiples stabilisés, Mut5 et Mut5CC. Ces quatre enzymes ont été étudiées sur base de leur stabilité, de leur activité et de la perméabilité de leur structure protéique. L’étude des cinétiques de renaturation/dénaturation d’AHA, Mut5 et Mut5CC a permis de déterminer l’origine cinétique du gain de stabilité liée à l’ajout d’interactions faibles et du pont disulfure chez AHA. Il en résulte que Mut5 et Mut5CC ont effectivement été stabilisés mais en contrepartie ils ont perdu l’optimalisation de l’activité à basse température observée chez AHA. De plus, la perméabilité de leur structure protéique s’est réduite, se rapprochant de celle de PPA. L’origine du gain de stabilité est liée à une diminution des cinétiques de dépliement sans modification des cinétiques de repliement. Non seulement ces résultats démontrent l’importance du rôle des interactions faibles dans l’adaptation thermique des protéines mais de plus, ils démontrent la synergie entre celles-ci. La seconde étude a pu être développée par la découverte d’une α-amylase chlorure-dépendante thermophile TFA issue de l’actinomycète Thermobifida fusca et par la production de l’α-amylase chlorure-dépendante mésophile ectotherme DMA de Drosophila melanogaster. Ainsi avec AHA et PPA respectivement comme représentants psychrophile et mésophile homéotherme, nous pouvions couvrir l’ensemble des températures physiologiques/environnementales connues. Nous avons pu mettre en évidence le continuum des propriétés physico-chimiques observées (activité, ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Antarc* Antarctique* University of Liège: ORBi (Open Repository and Bibliography) Découverte ENVELOPE(141.558,141.558,-66.775,-66.775) |
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L’adaptation thermique des protéines extremophiles a été étudiée de manière à approfondir notre compréhension des mécanismes moléculaires qui en sont responsables. Dans ce but, deux études ont été initiées et publiées. La première est basée sur la "mésophilisation" de l’α-amylase psychrophile AHA, issue de la bactérie Antarctique Pseudoalteromonas haloplanktis. L’ajout d’interactions faibles et d’un pont disulfure présents chez son homologue mésophile PPA de Sus scrofa et absents chez AHA ont permis de construire deux mutants multiples stabilisés, Mut5 et Mut5CC. Ces quatre enzymes ont été étudiées sur base de leur stabilité, de leur activité et de la perméabilité de leur structure protéique. L’étude des cinétiques de renaturation/dénaturation d’AHA, Mut5 et Mut5CC a permis de déterminer l’origine cinétique du gain de stabilité liée à l’ajout d’interactions faibles et du pont disulfure chez AHA. Il en résulte que Mut5 et Mut5CC ont effectivement été stabilisés mais en contrepartie ils ont perdu l’optimalisation de l’activité à basse température observée chez AHA. De plus, la perméabilité de leur structure protéique s’est réduite, se rapprochant de celle de PPA. L’origine du gain de stabilité est liée à une diminution des cinétiques de dépliement sans modification des cinétiques de repliement. Non seulement ces résultats démontrent l’importance du rôle des interactions faibles dans l’adaptation thermique des protéines mais de plus, ils démontrent la synergie entre celles-ci. La seconde étude a pu être développée par la découverte d’une α-amylase chlorure-dépendante thermophile TFA issue de l’actinomycète Thermobifida fusca et par la production de l’α-amylase chlorure-dépendante mésophile ectotherme DMA de Drosophila melanogaster. Ainsi avec AHA et PPA respectivement comme représentants psychrophile et mésophile homéotherme, nous pouvions couvrir l’ensemble des températures physiologiques/environnementales connues. Nous avons pu mettre en évidence le continuum des propriétés physico-chimiques observées (activité, ... |
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