Analysis of feeding habit of small rodent by DNA metabarcoding: Seasonal change of feeding habit of Pteromys volans orii

• Main Authors: 村上, 菫, 菊池, 隼人, Oshida, Tatsuo, 押田, 龍夫
• Format: Other/Unknown Material
• Language: Japanese
• Published: 帯広畜産大学 2021
• Subjects: 489; Subarctic
• Online Access: https://obihiro.repo.nii.ac.jp/record/4788/files/09 42 村上 菊池 押田.pdf

application/pdf 季節変化が明瞭な温帯域，亜寒帯域に生息する多くの植食性哺乳類において、食性の季節変化が確認されている。タイリクモモンガPteromys volansの亜種であるエゾモモンガP. volans oriiは、北海道の森林に生息する植食性のリス科齧歯類である。本亜種の食性については、野外における直接観察、痕跡の確認、飼育下における給餌実験等に基づいた報告があるが、これらの方法では、本亜種が野外で採食する全ての資源を把握することは困難である。そこで本研究では、帯広市内の河畔林において採集された本亜種の糞サンプルを用いて、DNAメタバーコーディング法により、食性の季節変化を包括的に推定することを試みた。 さらに、これまでに帯広市内において直接観察によって報告されている本亜種の食性データとの比較を行い、DNAメタバーコーディング法の有用性を検討した。糞中に含まれる植物種を解析した結果、推定された植物は季節間で有意に異なり、本亜種の採食パターンの季節変化が示された。また、ニレ科とシラカンバについては、季節を問わず利用されており、主要な採食資源であることが明らかになった。加えて、各季節で草本植物が検出され、樹上性である本亜種が地上で採食をする可能性が示唆された。直接観察法のデータと比較した結果、DNAメタバーコーディング法ではより広範囲の採食資源を推定できることが明らかになった。しかしながら、採食された植物種の特定が難しい場合があるという欠点も示された。DNAメタバーコーディング法によって包括的に食性を推定し、直接観察によってこれを裏付けるという調査方法を確立することによって、本亜種に限らず、今後の野生動物の食性研究の効率化に繋がるであろう。 In the temperate and subarctic zones, herbivorous mammals change their feeding habits seasonally. Pteromys volans orii, a Siberian flying squirrel subspecies endemic to Hokkaido, Japan, also uses food resources seasonally. To date, the feeding habits of P. volans orii has been examined by direct observations, analysis of feeding remains, and feeding experiments in captivity. However, it is difficult to understand its complete feeding habit based on these methods. Therefore, we examined its feces using the DNA meta-barcoding technique. In 2020, we conducted the study in a riparian forest in Obihiro during periods of no snow (in spring, summer, and autumn). In addition, to evaluate the DNA meta-barcoding technique, we compared our results with those reported previously by direct observations. We found that the feeding habits of this subspecies were significantly different between seasons. The family Ulmaceae and Betula platyphylla were usually detected in the feces, suggesting that these could be the main food resources for P. volans orii. The number of species and genera detected by DNA meta-barcoding was much higher than that reported previously by direct observations; however, it was sometimes difficult to precisely identify the species or genus, because of a limited DNA ...