Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera
Dinarska populacija euroazijskog risa (Lynx lynx) razvila se reintrodukcijom šest jedinki koje su 1973. godine naseljene iz slovackih Karpata u Sloveniju, odakle se populacija proširila u Hrvatsku te Bosnu i Hercegovinu. Danas se smatra da je u Hrvatskoj prisutno najviše 40 do 60 jedinki, te da su u...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | , |
Format: | Master Thesis |
Language: | Croatian |
Published: |
Sveučilište u Zagrebu. Veterinarski fakultet. Zavod za biologiju.
2015
|
Subjects: | |
Online Access: | https://zir.nsk.hr/islandora/object/vef:34 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:178:656447 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34/datastream/PDF |
id |
ftnulzagrebzir:oai:zir.nsk.hr:vef_34 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftnulzagrebzir:oai:zir.nsk.hr:vef_34 2024-01-14T10:11:29+01:00 Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera Kinshipanalysis of Eurasian Lynx /Lynx lynx) Dinaric Populationusing Microsatellite Markers Đurčević, Martina Gomerčić, Tomislav Sindičić, Magda 2015-01-30 application/pdf https://zir.nsk.hr/islandora/object/vef:34 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:178:656447 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34/datastream/PDF hrv hrv Sveučilište u Zagrebu. Veterinarski fakultet. Zavod za biologiju. University of Zagreb. Faculty of Veterinary Medicine. Department of Biology. https://zir.nsk.hr/islandora/object/vef:34 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:178:656447 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34/datastream/PDF http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/ info:eu-repo/semantics/restrictedAccess BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO. Veterinarska medicina. Temeljne i pretkliničke veterinarske znanosti BIOMEDICINE AND HEALTHCARE. Veterinary Medicine. Basic and Preclinical Veterinary Sciences euroazijski ris Lynx lynx mikrosateliti srodnost genska raznolikost Eurasian lynx microsatellites kinship genetic diversity info:eu-repo/semantics/masterThesis text 2015 ftnulzagrebzir 2023-12-15T00:04:27Z Dinarska populacija euroazijskog risa (Lynx lynx) razvila se reintrodukcijom šest jedinki koje su 1973. godine naseljene iz slovackih Karpata u Sloveniju, odakle se populacija proširila u Hrvatsku te Bosnu i Hercegovinu. Danas se smatra da je u Hrvatskoj prisutno najviše 40 do 60 jedinki, te da su uzroci ugroženosti populacije krivolov, nedostatak plijena i niska genska raznolikost uzrokovana parenjem u srodstvu. Istraživanja su dokazala nisku raznolikost alela mikrosatelitnih lokusa kod Dinarske populacije, te je cilj ovog rada bio utvrditi koji od dostupnih kompjuterskih programa je najprikladniji za analizu srodnosti kod Dinarske populacije risa. Analiza roditeljstva je metoda kojom se odreduje roditelj pojedinca ili skupine pojedinaca koristeci genetske informacije kombinirane s razlicitim statistickim metodama. U istraživanju sam koristila genotipove 19 mikrosatelitskih lokusa 91 jedinke risova iz Dinarske populacije, te sam upotrebom tri racunalna programa analizirala potencijalne roditelje za 29 životinja ciji uzorci su prikupljeni u razdoblju od 2000. do 2010. godine. Utvrdila sam da su programi GIMLET i CERVUS zbog niske raznolikosti alela neprikladni za upotrebu kod Dinarske populacije, dok su programom COLONY dobiveni rezultati s najvecom pouzdanošcu, te sam na temelju tih rezultata uspjela izraditi precizno i pouzdano obiteljsko stablo dinarske populacije risova. Eurasian lynx (Lynx lynx) Dinaric population was founded in 1973 by reintroduction of six animals from Slovak Carpathians to Slovenia, where from animals spread to Croatia and Bosnia and Herzegovina. Today it is considered that lynx population in Croatia has a maximum of 40 to 60 individuals. Population is threatened by poaching, lack of prey and low genetic diversity due to inbreeding. The goal of this research was to investigate which software is the most suitable for kinship analysis of the Dinaric lynx, as population has low microsatellite variability. Kinship analysis determines parents of an individual or group of individuals using ... Master Thesis Lynx Lynx lynx lynx Croatian Digital Theses Repository (National and University Library in Zagreb) Niska ENVELOPE(25.283,25.283,66.183,66.183) |
institution |
Open Polar |
collection |
Croatian Digital Theses Repository (National and University Library in Zagreb) |
op_collection_id |
ftnulzagrebzir |
language |
Croatian |
topic |
BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO. Veterinarska medicina. Temeljne i pretkliničke veterinarske znanosti BIOMEDICINE AND HEALTHCARE. Veterinary Medicine. Basic and Preclinical Veterinary Sciences euroazijski ris Lynx lynx mikrosateliti srodnost genska raznolikost Eurasian lynx microsatellites kinship genetic diversity |
spellingShingle |
BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO. Veterinarska medicina. Temeljne i pretkliničke veterinarske znanosti BIOMEDICINE AND HEALTHCARE. Veterinary Medicine. Basic and Preclinical Veterinary Sciences euroazijski ris Lynx lynx mikrosateliti srodnost genska raznolikost Eurasian lynx microsatellites kinship genetic diversity Đurčević, Martina Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera |
topic_facet |
BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO. Veterinarska medicina. Temeljne i pretkliničke veterinarske znanosti BIOMEDICINE AND HEALTHCARE. Veterinary Medicine. Basic and Preclinical Veterinary Sciences euroazijski ris Lynx lynx mikrosateliti srodnost genska raznolikost Eurasian lynx microsatellites kinship genetic diversity |
description |
Dinarska populacija euroazijskog risa (Lynx lynx) razvila se reintrodukcijom šest jedinki koje su 1973. godine naseljene iz slovackih Karpata u Sloveniju, odakle se populacija proširila u Hrvatsku te Bosnu i Hercegovinu. Danas se smatra da je u Hrvatskoj prisutno najviše 40 do 60 jedinki, te da su uzroci ugroženosti populacije krivolov, nedostatak plijena i niska genska raznolikost uzrokovana parenjem u srodstvu. Istraživanja su dokazala nisku raznolikost alela mikrosatelitnih lokusa kod Dinarske populacije, te je cilj ovog rada bio utvrditi koji od dostupnih kompjuterskih programa je najprikladniji za analizu srodnosti kod Dinarske populacije risa. Analiza roditeljstva je metoda kojom se odreduje roditelj pojedinca ili skupine pojedinaca koristeci genetske informacije kombinirane s razlicitim statistickim metodama. U istraživanju sam koristila genotipove 19 mikrosatelitskih lokusa 91 jedinke risova iz Dinarske populacije, te sam upotrebom tri racunalna programa analizirala potencijalne roditelje za 29 životinja ciji uzorci su prikupljeni u razdoblju od 2000. do 2010. godine. Utvrdila sam da su programi GIMLET i CERVUS zbog niske raznolikosti alela neprikladni za upotrebu kod Dinarske populacije, dok su programom COLONY dobiveni rezultati s najvecom pouzdanošcu, te sam na temelju tih rezultata uspjela izraditi precizno i pouzdano obiteljsko stablo dinarske populacije risova. Eurasian lynx (Lynx lynx) Dinaric population was founded in 1973 by reintroduction of six animals from Slovak Carpathians to Slovenia, where from animals spread to Croatia and Bosnia and Herzegovina. Today it is considered that lynx population in Croatia has a maximum of 40 to 60 individuals. Population is threatened by poaching, lack of prey and low genetic diversity due to inbreeding. The goal of this research was to investigate which software is the most suitable for kinship analysis of the Dinaric lynx, as population has low microsatellite variability. Kinship analysis determines parents of an individual or group of individuals using ... |
author2 |
Gomerčić, Tomislav Sindičić, Magda |
format |
Master Thesis |
author |
Đurčević, Martina |
author_facet |
Đurčević, Martina |
author_sort |
Đurčević, Martina |
title |
Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera |
title_short |
Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera |
title_full |
Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera |
title_fullStr |
Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera |
title_full_unstemmed |
Analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (Lynx Lynx) pomoću mikrosatelitskih markera |
title_sort |
analiza srodnosti dinarske populacije euroazijskog risa (lynx lynx) pomoću mikrosatelitskih markera |
publisher |
Sveučilište u Zagrebu. Veterinarski fakultet. Zavod za biologiju. |
publishDate |
2015 |
url |
https://zir.nsk.hr/islandora/object/vef:34 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:178:656447 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34/datastream/PDF |
long_lat |
ENVELOPE(25.283,25.283,66.183,66.183) |
geographic |
Niska |
geographic_facet |
Niska |
genre |
Lynx Lynx lynx lynx |
genre_facet |
Lynx Lynx lynx lynx |
op_relation |
https://zir.nsk.hr/islandora/object/vef:34 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:178:656447 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/vef:34/datastream/PDF |
op_rights |
http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/ info:eu-repo/semantics/restrictedAccess |
_version_ |
1788066384069001216 |