Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa
Umjetna selekcija koja se provodi na psima (Canis lupus familiaris) predstavlja jedan od najzanimljivijih primjera selekcije, kako zbog velikog broja jedinki tako i zbog širok spektra varijacija unutar specifičnih morfoloških i bihevioralnih karakteristika pojedine pasmine. U ovom istraživanju koriš...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Format: | Master Thesis |
Language: | Croatian |
Published: |
Sveučilište u Zagrebu. Agronomski fakultet. Opće stočarstvo.
2021
|
Subjects: | |
Online Access: | https://zir.nsk.hr/islandora/object/agr:2262 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:518213 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262/datastream/PDF |
id |
ftnulzagrebzir:oai:zir.nsk.hr:agr_2262 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftnulzagrebzir:oai:zir.nsk.hr:agr_2262 2023-08-27T04:08:52+02:00 Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa Identifying signatures of positive selection in shepherd dogs´ genome Glavaš, Vjeran Čubrić Čurik, Vlatka 2021-09-10 application/pdf https://zir.nsk.hr/islandora/object/agr:2262 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:518213 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262/datastream/PDF hrv hrv Sveučilište u Zagrebu. Agronomski fakultet. Opće stočarstvo. University of Zagreb. Faculty of Agriculture. Department of Animal Science I. https://zir.nsk.hr/islandora/object/agr:2262 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:518213 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262/datastream/PDF http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/ info:eu-repo/semantics/openAccess selekcija iHS eROHi varijacije geni Selection Variations Genes BIOTEHNIČKE ZNANOSTI. Poljoprivreda (agronomija) BIOTECHNICAL SCIENCES. Agronomy info:eu-repo/semantics/masterThesis text 2021 ftnulzagrebzir 2023-08-03T17:40:11Z Umjetna selekcija koja se provodi na psima (Canis lupus familiaris) predstavlja jedan od najzanimljivijih primjera selekcije, kako zbog velikog broja jedinki tako i zbog širok spektra varijacija unutar specifičnih morfoloških i bihevioralnih karakteristika pojedine pasmine. U ovom istraživanju korišteni su genomski podaci 123 jedinke pastirskih pasmina pasa s ukupno 107.403 SNP-ova na kojima su provedene iHS i eROHi analize u svrhu otkrivanja signala pozitivne selekcije. Metode su se temeljile na otkrivanju genomskih varijacija unutar jedne velike meta-populacije od 11 različitih pastirskih pasmina pasa. Provedeno istraživanje obuhvatilo je i identifikaciju gena kao i proučavanje njihove funkcionalnosti unutar psećeg organizma. Uspješno je identificirano 29 regija pod selekcijom s pripadajućih 462 gena koji utječu na ekspresiju važnih morfoloških i bihevioralnih karakteristika. Artificial selection in dogs (Canis lupus familiaris) is one of the most interesting examples of selection, both because of the large number of individuals and the wide range of variation within the specific morphological and behavioral characteristics of each breed. In this study, genomic data from 123 individuals of shepherd dog breeds with a total of 107,403 SNPs was used, on which iHS and eROHi analyzes were performed to detect positive selection signals. The methods were based on the detection of genomic variation within a large meta-population of 11 different shepherd dog breeds. The studies performed included both the identification of genes and the study of their functionality within the canine organism. Twenty-nine regions that are under positive selection were identified as well as 462 genes that play a crucial role in development of certain morphological and behavioral characteristics. Master Thesis Canis lupus Croatian Digital Theses Repository (National and University Library in Zagreb) Pasa ENVELOPE(26.733,26.733,67.850,67.850) |
institution |
Open Polar |
collection |
Croatian Digital Theses Repository (National and University Library in Zagreb) |
op_collection_id |
ftnulzagrebzir |
language |
Croatian |
topic |
selekcija iHS eROHi varijacije geni Selection Variations Genes BIOTEHNIČKE ZNANOSTI. Poljoprivreda (agronomija) BIOTECHNICAL SCIENCES. Agronomy |
spellingShingle |
selekcija iHS eROHi varijacije geni Selection Variations Genes BIOTEHNIČKE ZNANOSTI. Poljoprivreda (agronomija) BIOTECHNICAL SCIENCES. Agronomy Glavaš, Vjeran Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa |
topic_facet |
selekcija iHS eROHi varijacije geni Selection Variations Genes BIOTEHNIČKE ZNANOSTI. Poljoprivreda (agronomija) BIOTECHNICAL SCIENCES. Agronomy |
description |
Umjetna selekcija koja se provodi na psima (Canis lupus familiaris) predstavlja jedan od najzanimljivijih primjera selekcije, kako zbog velikog broja jedinki tako i zbog širok spektra varijacija unutar specifičnih morfoloških i bihevioralnih karakteristika pojedine pasmine. U ovom istraživanju korišteni su genomski podaci 123 jedinke pastirskih pasmina pasa s ukupno 107.403 SNP-ova na kojima su provedene iHS i eROHi analize u svrhu otkrivanja signala pozitivne selekcije. Metode su se temeljile na otkrivanju genomskih varijacija unutar jedne velike meta-populacije od 11 različitih pastirskih pasmina pasa. Provedeno istraživanje obuhvatilo je i identifikaciju gena kao i proučavanje njihove funkcionalnosti unutar psećeg organizma. Uspješno je identificirano 29 regija pod selekcijom s pripadajućih 462 gena koji utječu na ekspresiju važnih morfoloških i bihevioralnih karakteristika. Artificial selection in dogs (Canis lupus familiaris) is one of the most interesting examples of selection, both because of the large number of individuals and the wide range of variation within the specific morphological and behavioral characteristics of each breed. In this study, genomic data from 123 individuals of shepherd dog breeds with a total of 107,403 SNPs was used, on which iHS and eROHi analyzes were performed to detect positive selection signals. The methods were based on the detection of genomic variation within a large meta-population of 11 different shepherd dog breeds. The studies performed included both the identification of genes and the study of their functionality within the canine organism. Twenty-nine regions that are under positive selection were identified as well as 462 genes that play a crucial role in development of certain morphological and behavioral characteristics. |
author2 |
Čubrić Čurik, Vlatka |
format |
Master Thesis |
author |
Glavaš, Vjeran |
author_facet |
Glavaš, Vjeran |
author_sort |
Glavaš, Vjeran |
title |
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa |
title_short |
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa |
title_full |
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa |
title_fullStr |
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa |
title_full_unstemmed |
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa |
title_sort |
identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu pastirskih pasa |
publisher |
Sveučilište u Zagrebu. Agronomski fakultet. Opće stočarstvo. |
publishDate |
2021 |
url |
https://zir.nsk.hr/islandora/object/agr:2262 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:518213 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262/datastream/PDF |
long_lat |
ENVELOPE(26.733,26.733,67.850,67.850) |
geographic |
Pasa |
geographic_facet |
Pasa |
genre |
Canis lupus |
genre_facet |
Canis lupus |
op_relation |
https://zir.nsk.hr/islandora/object/agr:2262 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:518213 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262 https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/agr:2262/datastream/PDF |
op_rights |
http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/ info:eu-repo/semantics/openAccess |
_version_ |
1775349800123760640 |