Karakterizacija gena iz porodice p53 u dagnji Mytilus galloprovincialis

• Main Author: Baričević, Ana
• Other Authors: Štifanić, Mauro
• Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
• Language: Croatian
• Published: Sveučilište u Zagrebu. Prirodoslovno-matematički fakultet. Geološki odsjek. 2015
• Subjects: PRIRODNE ZNANOSTI. Interdisciplinarne prirodne znanosti. Znanost o moru; NATURAL SCIENCES. Interdisciplinary Natural Sciences. Marine Science; Geologija. Meteorologija. Hidrologija; Geology. Meteorology. Hydrology; info:eu-repo/classification/udc/55(043.3); Opća genetika. Opća citogenetika; General genetics. General cytogenetics; info:eu-repo/classification/udc/575(043.3); Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost; Biological sciences. Physical anthropology. Biodiversity; info:eu-repo/classification/udc/57(043.3); Mollusca; Mytilus; ortolog; p53; p63; p73; genom; anotacija gena; orthologue; genome; annotation; Crassostrea gigas
• Online Access: https://dr.nsk.hr/islandora/object/pmf:251; https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:451913; https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/pmf:251; https://repozitorij.unizg.hr/islandora/object/pmf:251/datastream/PDF

Geni porodice p53 (p53, p63 i p73) imaju uloge u važnim staničnim procesima kao što su zastoj staničnog ciklusa, apoptoza i procesi diferencijacije. U ovom radu identificirana su i karakterizirana četiri nepotpuna kodirajuća slijeda porodice p53 (cDNA1-4) i prvi poznati cjeloviti genomski slijed homologa porodice p53 mediteranske dagnje Mytilus galloprovincialis. Struktura gena homologa porodice p53 mediteranske dagnje najsličnija je genu p63 kralješnjaka te potvrđuje p63 kao ishodišni gen porodice p53 i jedini gen prisutan kod beskralješnjaka. Gen p63 dagnje M. galloprovincialis obuhvaća 20620 pb i organiziran je u 15 egzona povezanih sa 14 introna. Analiza je utvrdila da četiri nova kodirajuća slijeda mediteranske dagnje (cDNA1-4) kodiraju proteinske izoforme TAp63 ili TAp63 te su i svi drugi poznati sljedovi porodice p53 mekušaca identificirani kao gen p63 ili njegove ekspresijske izoforme. Očuvana struktura gena p63 koljena Mollusca utvrđena je usporedbom strukture gena p63 mediteranske dagnje sa ostalim ortolozima, pronađenim u sekvenciranim genomima mekušaca Aplysia californica, Lottia gigantea, Crassostrea gigas i Biomphalaria glabrata. Analize su također utvrdile moguće pogreške anotacija gena p63 u sekvenciranim genomima te je time istaknuta vrijednost korištenja sravnjenja poznatih (referentnih) kodirajućih sljedova s novosekvenciranim genomskim sljedovima za pouzdanu anotaciju sekvenciranih genoma. P53 gene family members (p53, p63 and p73) are involved in crucial cellular functions such as cell-cycle arrest, apoptosis and development. In this study four partial p53 family cDNAs (cDNA1-4) and the first complete genomic sequence of the p53 family homologue in the mollusc Mediterranean mussel Mytilus galloprovincialis were identified and characterized. Results indicate gene structure of M.galloprovincialis p53 family homologue to be most similar to vertebrate p63 gene, considering p63 as the ancestral gene of the p53 family as well as the only gene of the family present in non-chordate metazoan ...