The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection
Norsk sammendrag Bakterier finnes overalt rundt oss og på hver plante, menneske eller overflate. Disse bakteriene kaller vi for «mikrobiomen», før eksempel kaller vi bakteriene som bor i tarmen vår vår «tarm mikrobiom». Denne avhandlingen jobbet med mikrobiomen av nyklekt laks og undersøkte hvor den...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | , , |
Format: | Doctoral or Postdoctoral Thesis |
Language: | English |
Published: |
NTNU
2023
|
Subjects: | |
Online Access: | https://hdl.handle.net/11250/3098957 |
id |
ftntnutrondheimi:oai:ntnuopen.ntnu.no:11250/3098957 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftntnutrondheimi:oai:ntnuopen.ntnu.no:11250/3098957 2023-11-12T04:14:45+01:00 The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection Fiedler, Alexander Willi Bakke, Ingrid Vadstein, Olav Almaas, Eivind 2023 application/pdf https://hdl.handle.net/11250/3098957 eng eng NTNU Doctoral theses at NTNU;2023:349 Paper 1: Fiedler, Alexander Willi; Drågen, Martha K. R.; Degré Lorentsen, Eirik; Vadstein, Olav; Bakke, Ingrid. The stability and composition of the gut and skin microbiota of Atlantic salmon throughout the yolk sac stage. Frontiers in Microbiology 2023 ;Volum 14. s. - This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (CC BY). Paper 2: Gundersen, Madeleine S.; Fiedler, Alexander Willi; Bakke, Ingrid; Vadstein, Olav. The impact of phage treatment on bacterial community structure is negligible compared to antibiotics. This paper is under review for publication and is therefore not included. Paper 3: Fiedler, Alexander Willi; Gundersen, Madeleine S.; Vo, Toan P.; Almaas, Eivind; Vadstein, Olav; Bakke, Ingrid. Phage therapy minimally affects the water microbiota in an Atlantic salmon (Salmo salar) rearing system while still preventing infection. This paper is under review for publication and is therefore not included. urn:isbn:978-82-326-7397-1 urn:issn:2703-8084 https://hdl.handle.net/11250/3098957 VDP::Matematikk og Naturvitenskap: 400 Doctoral thesis 2023 ftntnutrondheimi 2023-11-01T23:46:54Z Norsk sammendrag Bakterier finnes overalt rundt oss og på hver plante, menneske eller overflate. Disse bakteriene kaller vi for «mikrobiomen», før eksempel kaller vi bakteriene som bor i tarmen vår vår «tarm mikrobiom». Denne avhandlingen jobbet med mikrobiomen av nyklekt laks og undersøkte hvor denne mikrobiomen kommer fra, hva som påvirker den og hvordan den kan beskytte fisken mot sykdom. For å undersøke dette ble det brukt bakteriefrie fisk, som er fisk der alle bakteriene ble fjernet på labben. Ved bruk av disse kunne vi vise at mikrobiomen beskyttet fiskene mot en sykdomsfremkallende patogen og er dermed svært viktig for fiskens velferd. Videre ble det undersøkt hvordan man kan beskytte denne verdifulle mikrobiomen mot forstyrrelser, som før eksempel bruk av antibiotika. Antibiotika skader de fleste bakterier og dermed også de «gode» bakteriene som er en naturlig del av mikrobiomen. Det ble derfor undersøkt hvordan man kan finne alternativer for antibiotika som ikke er skadelig for mikrobiomen. En av disse alternativene er (bacterio)fag terapi. Fager er virus som bare dreper bakterier, men er ufarlig for mennesker. Disse fagene er veldig spesifikke og infiserer dermed bare patogene bakterier, som er de som gjør fiskene syke. I denne PhDen ble det faktisk vist at fag terapi funker like godt som antibiotika terapi for å beskytte fiskene, men er ikke skadelig for mikrobiomen. Denne avhandlingen viser dermed at mikrobiomen til laks er svært viktig for å beskytte fisken mot sykdom og at vi burde bruke fag terapi når fiskene blir syke istedenfor klassisk antibiotika terapi. Disse funnene ble gjort for laks, men er også høgst relevant for menneskene, siden også vi har en mikrobiom som beskytter oss mot sykdom. Også vi burde begynne å bruke mindre antibiotika som skader den verdifulle mikrobiomen vår og burde tenke på alternativer, som fag terapi. English summary Bacteria are everywhere and colonize every plant, animal, or surface. We call these bacterial communities the “microbiome”. For example, we refer to ... Doctoral or Postdoctoral Thesis Atlantic salmon NTNU Open Archive (Norwegian University of Science and Technology) |
institution |
Open Polar |
collection |
NTNU Open Archive (Norwegian University of Science and Technology) |
op_collection_id |
ftntnutrondheimi |
language |
English |
topic |
VDP::Matematikk og Naturvitenskap: 400 |
spellingShingle |
VDP::Matematikk og Naturvitenskap: 400 Fiedler, Alexander Willi The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection |
topic_facet |
VDP::Matematikk og Naturvitenskap: 400 |
description |
Norsk sammendrag Bakterier finnes overalt rundt oss og på hver plante, menneske eller overflate. Disse bakteriene kaller vi for «mikrobiomen», før eksempel kaller vi bakteriene som bor i tarmen vår vår «tarm mikrobiom». Denne avhandlingen jobbet med mikrobiomen av nyklekt laks og undersøkte hvor denne mikrobiomen kommer fra, hva som påvirker den og hvordan den kan beskytte fisken mot sykdom. For å undersøke dette ble det brukt bakteriefrie fisk, som er fisk der alle bakteriene ble fjernet på labben. Ved bruk av disse kunne vi vise at mikrobiomen beskyttet fiskene mot en sykdomsfremkallende patogen og er dermed svært viktig for fiskens velferd. Videre ble det undersøkt hvordan man kan beskytte denne verdifulle mikrobiomen mot forstyrrelser, som før eksempel bruk av antibiotika. Antibiotika skader de fleste bakterier og dermed også de «gode» bakteriene som er en naturlig del av mikrobiomen. Det ble derfor undersøkt hvordan man kan finne alternativer for antibiotika som ikke er skadelig for mikrobiomen. En av disse alternativene er (bacterio)fag terapi. Fager er virus som bare dreper bakterier, men er ufarlig for mennesker. Disse fagene er veldig spesifikke og infiserer dermed bare patogene bakterier, som er de som gjør fiskene syke. I denne PhDen ble det faktisk vist at fag terapi funker like godt som antibiotika terapi for å beskytte fiskene, men er ikke skadelig for mikrobiomen. Denne avhandlingen viser dermed at mikrobiomen til laks er svært viktig for å beskytte fisken mot sykdom og at vi burde bruke fag terapi når fiskene blir syke istedenfor klassisk antibiotika terapi. Disse funnene ble gjort for laks, men er også høgst relevant for menneskene, siden også vi har en mikrobiom som beskytter oss mot sykdom. Også vi burde begynne å bruke mindre antibiotika som skader den verdifulle mikrobiomen vår og burde tenke på alternativer, som fag terapi. English summary Bacteria are everywhere and colonize every plant, animal, or surface. We call these bacterial communities the “microbiome”. For example, we refer to ... |
author2 |
Bakke, Ingrid Vadstein, Olav Almaas, Eivind |
format |
Doctoral or Postdoctoral Thesis |
author |
Fiedler, Alexander Willi |
author_facet |
Fiedler, Alexander Willi |
author_sort |
Fiedler, Alexander Willi |
title |
The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection |
title_short |
The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection |
title_full |
The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection |
title_fullStr |
The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection |
title_full_unstemmed |
The microbiota of yolk sac fry of Atlantic salmon: Development, disturbances, and role in host protection |
title_sort |
microbiota of yolk sac fry of atlantic salmon: development, disturbances, and role in host protection |
publisher |
NTNU |
publishDate |
2023 |
url |
https://hdl.handle.net/11250/3098957 |
genre |
Atlantic salmon |
genre_facet |
Atlantic salmon |
op_relation |
Doctoral theses at NTNU;2023:349 Paper 1: Fiedler, Alexander Willi; Drågen, Martha K. R.; Degré Lorentsen, Eirik; Vadstein, Olav; Bakke, Ingrid. The stability and composition of the gut and skin microbiota of Atlantic salmon throughout the yolk sac stage. Frontiers in Microbiology 2023 ;Volum 14. s. - This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (CC BY). Paper 2: Gundersen, Madeleine S.; Fiedler, Alexander Willi; Bakke, Ingrid; Vadstein, Olav. The impact of phage treatment on bacterial community structure is negligible compared to antibiotics. This paper is under review for publication and is therefore not included. Paper 3: Fiedler, Alexander Willi; Gundersen, Madeleine S.; Vo, Toan P.; Almaas, Eivind; Vadstein, Olav; Bakke, Ingrid. Phage therapy minimally affects the water microbiota in an Atlantic salmon (Salmo salar) rearing system while still preventing infection. This paper is under review for publication and is therefore not included. urn:isbn:978-82-326-7397-1 urn:issn:2703-8084 https://hdl.handle.net/11250/3098957 |
_version_ |
1782332314025459712 |