The effect of organic load on the rearing water and biofilter biofilm microbiota across the freshwater and brackish water phases in RAS with Atlantic salmon (Salmo salar)

• Main Author: Stenhaug, Stian Ringbakken
• Other Authors: Bakke, Ingrid, Fredriksen, Simen
• Format: Master Thesis
• Language: English
• Published: NTNU 2023
• Subjects: Atlantic salmon; Salmo salar
• Online Access: https://hdl.handle.net/11250/3096231

Oppdrett av Atlantisk laks opplever for tiden betydelig vekst innenfor landbaserte resirkulerende akvakultursystemer, spesielt for smoltproduksjon. Biofilteret i RAS spiller en avgjørende rolle i å opprettholde ideell vannkvalitet og fiskehelse gjennom aktiviteten til mikroorganismer. Imidlertid vet vi lite om hvordan biofilterfunksjonen og de mikrobielle samfunnene forbundet med RAS vann og biofilterbiofilm påvirkes av organisk belastning. Denne avhandlingen hadde som mål å undersøke ferskvanns- og brakkvannsfasen i RAS for Atlantisk laks og effekten av høy organisk belastning på de mikrobielle samfunnene i biofilterbiofilm og oppdrettsvann. For å oppnå dette ble seks identiske RAS undersøkt, hvorav tre RAS ble drevet under forhold med høy organisk belastning og tre RAS ble drevet under forhold med lav organisk belastning. Daglige målinger av vannkvalitet, inkludert nitrogenholdige stoffer, ble utført. Deretter ble totalt 206 prøver fra biofilteret og RAS vannet analysert ved bruk av mikrobiell samfunnsanalyse ved Illumina-sekvensering av variable V3-V4 regioner av 16S rRNA-genampliconer, etterfulgt av databehandling og statistiske analyser. Biofilterbiofilmen og suspendert vann mikrobiota viste betydelige forskjeller mellom RAS drevet med høy organisk belastning og RAS drevet med lav organisk belastning i brakkvannsfasen, noe som tyder på at organisk belastning spilte en rolle i utformingen av biofilmens mikrobiota. Generelt ble de dominerende ordener som karakteriserte den mikrobiell samfunnsstruktur i RAS vannprøvene klassifisert som Rhodobacterales, Flavobacteriales, Burkholderiales og Cytophagales. Den mikrobielle sammensetningen i biofilmbærere av både RAS operert med høy organisk belastning og RAS operert med lav organisk belastning var hovedsakelig preget av ordener Rhodobacterales, Flavobacteriales, Saprospirales og Burkholderiales. I tillegg utforsket denne studien forskjellene i mikrobiell sammensetning mellom 0,2 µm og 8 µm filtrerte vannprøver, og avslørte betydelige forskjeller i disse mikrobielle ...