“Effect of inbreeding on egg size and clutch size in an insular house sparrow metapopulation in northern Norway”

• Main Author: Gholami, Fatemeh
• Other Authors: Jensen, Henrik, Ringsby, Thor Harald, Kvalnes, Thomas, Burnett, Hamish Andrew
• Format: Master Thesis
• Language: English
• Published: NTNU 2023
• Subjects: Eggene; Norway; Nord-Norge; Northern Norway
• Online Access: https://hdl.handle.net/11250/3091478

Innavlsdepresjon er en av de største truslene mot overlevelsen til små, isolerte bestander. For å få en fullstendig forståelse av innavlens innvirkning på populasjonens levedyktighet er det nødvendig å kvantifisere innavlsdepresjon (ID) i mors investering, siden det kan påvirke overlevelsen til den påfølgende generasjonen ved å redusere avkommets helse og overlevelse. I denne studien undersøkte jeg hvordan innavl hos mor påvirker størrelsen på unger og egg for å forstå konsekvensene av innavl på reproduksjonsevnen i en metapopulasjon av gråspurv på Helgelandskysten i Nord-Norge. Jeg brukte individuelle genomdata på 118 000 SNP-er til å bestemme innavlskoeffisienter for mødre. Ved å analysere homozygote SNPs identifiserte jeg homozygote deler av genomet og estimerte individuelle innavlskoeffisienter (F) ved å kvantifisere andelen av genomet som består av homozygote sekvenser (FROH). Gjennomsnittlig eggvolum, totalt eggvolum og kullstørrelse ble brukt som indikatorer for mors investeringer. Lineære mixed-effects-modeller (LME) ble tilpasset for å undersøke effekten av innavl hos mor på eggstørrelse. Generaliserte lineære mixed-effects-modeller (GLMM) ble tilpasset for å undersøke hvordan individuell variasjon i innavl hos mor påvirket kullstørrelse. Resultatene viste ingen signifikante sammenhenger mellom mødrenes innavlskoeffisient og den gjennomsnittlige eller totale størrelsen på eggene i et kull, eller kullstørrelsen. Disse resultatene tyder på at andre faktorer kan ha tilslørt de forventede negative effektene av innavl. Det var for eksempel en økning i den årlige størrelsen på bestandene av voksne individer i løpet av studieperioden, noe som tyder på en mulig forbedring av habitatkvaliteten og på at miljøforholdene kan ha tilslørt eventuelle negative effekter av innavl på mødrenes investeringer. Disse funnene understreker behovet for å ta hensyn til ulike prosesser og faktorer når man vurderer effekten av innavl, og understreker behovet for flere studier for å avklare hvordan genetiske og miljømessige ...