Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph

Den arktiske morfen til Sphagnum squarrosum skiller seg fra den typiske Boreale morfen og har morfologiske likheter med S. teres som er nært beslektet og kan ligne på S. squarrosum når den vokser under spesifikke forhold. Tidligere studier har ikke funnet genetisk struktur i S. squarrosum og den ark...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Nilsen, Nellie Henriette
Other Authors: Hassel, Kristian, Stenøien, Hans K., Meleshko, Olena, Flatberg, Kjell Ivar, Kyrkjeeide, Magni O.
Format: Master Thesis
Language:English
Published: NTNU 2021
Subjects:
Online Access:https://hdl.handle.net/11250/2831562
id ftntnutrondheimi:oai:ntnuopen.ntnu.no:11250/2831562
record_format openpolar
spelling ftntnutrondheimi:oai:ntnuopen.ntnu.no:11250/2831562 2023-05-15T14:45:38+02:00 Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph Nilsen, Nellie Henriette Hassel, Kristian Stenøien, Hans K. Meleshko, Olena Flatberg, Kjell Ivar Kyrkjeeide, Magni O. 2021 application/pdf https://hdl.handle.net/11250/2831562 eng eng NTNU no.ntnu:inspera:79416900:50806581 https://hdl.handle.net/11250/2831562 Master thesis 2021 ftntnutrondheimi 2021-12-01T23:36:14Z Den arktiske morfen til Sphagnum squarrosum skiller seg fra den typiske Boreale morfen og har morfologiske likheter med S. teres som er nært beslektet og kan ligne på S. squarrosum når den vokser under spesifikke forhold. Tidligere studier har ikke funnet genetisk struktur i S. squarrosum og den arktiske morfen har aldri vært undersøkt i sammenheng med artsavgrensning. Jeg hadde som mål å oppklare den taksonomiske statusen til den arktiske morfen av S. squarrosum og dens fylogenetiske forhold til S. teres og S. tundrae som vokser sammen med den på Svalbard. Det ble utført RADseq analyse av 61 prøver av de tre studieartene fra Svalbard, Norge, Finland, Estland, Færøyene, Grønland, og Russland. Datasettet ble analysert med STRUCTURE, RAxML, PCA og FST verdiene ble estimert. Jeg fastslo at den arktiske morfen tilhører S. squarrosum, men jeg fant mer geografisk struktur i S. squarrosum enn tidligere studier har oppdaget. Individene av S. squarrosum fra Svalbard, og de arktiske områdene av Grønland og Norge er genetisk mer lik hverandre enn prøver sør for den arktiske sirkelen. Prøver sør for den arktiske sirkelen dannet to grupper, den ene inneholdt individer fra Færøyene og Sør-Norge, mens den andre inneholdt individene fra alle de gjenværende lokalitetene. Den genetiske gruppen bestående av prøvene fra Færøyene og Sør-Norge var mest genetisk distinkt blant prøvene av S. squarrosum og kan være i ferd med å bli en egen art. The Arctic morph of Sphagnum squarrosum differs from the typical Boreal morph and has morphological similarities with Sphagnum teres which is closely related and may resemble S. squarrosum when growing in certain conditions. While previous studies have detected no genetic structure in Sphagnum squarrosum, the Arctic morph has never been explored in the context of species delimitation. I aimed to clarify the taxonomic status of the Arctic morph of S. squarrosum and its phylogenetic relationship with S. teres and S. tundrae with which it co-occurs at Svalbard. RADseq analysis was applied to 61 samples of the three study species from Svalbard, Norway, Finland, Estonia, Faroe Islands, Greenland, and Russia. The dataset was then analysed with STRUCTURE, RAxML, PCA, and FST was calculated. I found that the Arctic morph belongs within S. squarrosum, but I also found more spatial structure in the S. squarrosum than discovered in previous studies. The specimens of S. squarrosum from Svalbard, Arctic Greenland, and Arctic Norway are genetically more similar to each other than to samples south of the Arctic circle. Samples south of the Arctic circle formed two groups, one containing samples from Faroe Islands and South Norway, while the other encompassed samples from all the remaining locations. The genetic group containing the samples from Southern Norway and Faroe Islands was the most genetically dissimilar among the S. squarrosum samples and could be under emerging speciation. Master Thesis Arctic Arktis* Faroe Islands Færøyene Greenland Grønland Svalbard NTNU Open Archive (Norwegian University of Science and Technology) Arctic Faroe Islands Greenland Norway Russland Svalbard
institution Open Polar
collection NTNU Open Archive (Norwegian University of Science and Technology)
op_collection_id ftntnutrondheimi
language English
description Den arktiske morfen til Sphagnum squarrosum skiller seg fra den typiske Boreale morfen og har morfologiske likheter med S. teres som er nært beslektet og kan ligne på S. squarrosum når den vokser under spesifikke forhold. Tidligere studier har ikke funnet genetisk struktur i S. squarrosum og den arktiske morfen har aldri vært undersøkt i sammenheng med artsavgrensning. Jeg hadde som mål å oppklare den taksonomiske statusen til den arktiske morfen av S. squarrosum og dens fylogenetiske forhold til S. teres og S. tundrae som vokser sammen med den på Svalbard. Det ble utført RADseq analyse av 61 prøver av de tre studieartene fra Svalbard, Norge, Finland, Estland, Færøyene, Grønland, og Russland. Datasettet ble analysert med STRUCTURE, RAxML, PCA og FST verdiene ble estimert. Jeg fastslo at den arktiske morfen tilhører S. squarrosum, men jeg fant mer geografisk struktur i S. squarrosum enn tidligere studier har oppdaget. Individene av S. squarrosum fra Svalbard, og de arktiske områdene av Grønland og Norge er genetisk mer lik hverandre enn prøver sør for den arktiske sirkelen. Prøver sør for den arktiske sirkelen dannet to grupper, den ene inneholdt individer fra Færøyene og Sør-Norge, mens den andre inneholdt individene fra alle de gjenværende lokalitetene. Den genetiske gruppen bestående av prøvene fra Færøyene og Sør-Norge var mest genetisk distinkt blant prøvene av S. squarrosum og kan være i ferd med å bli en egen art. The Arctic morph of Sphagnum squarrosum differs from the typical Boreal morph and has morphological similarities with Sphagnum teres which is closely related and may resemble S. squarrosum when growing in certain conditions. While previous studies have detected no genetic structure in Sphagnum squarrosum, the Arctic morph has never been explored in the context of species delimitation. I aimed to clarify the taxonomic status of the Arctic morph of S. squarrosum and its phylogenetic relationship with S. teres and S. tundrae with which it co-occurs at Svalbard. RADseq analysis was applied to 61 samples of the three study species from Svalbard, Norway, Finland, Estonia, Faroe Islands, Greenland, and Russia. The dataset was then analysed with STRUCTURE, RAxML, PCA, and FST was calculated. I found that the Arctic morph belongs within S. squarrosum, but I also found more spatial structure in the S. squarrosum than discovered in previous studies. The specimens of S. squarrosum from Svalbard, Arctic Greenland, and Arctic Norway are genetically more similar to each other than to samples south of the Arctic circle. Samples south of the Arctic circle formed two groups, one containing samples from Faroe Islands and South Norway, while the other encompassed samples from all the remaining locations. The genetic group containing the samples from Southern Norway and Faroe Islands was the most genetically dissimilar among the S. squarrosum samples and could be under emerging speciation.
author2 Hassel, Kristian
Stenøien, Hans K.
Meleshko, Olena
Flatberg, Kjell Ivar
Kyrkjeeide, Magni O.
format Master Thesis
author Nilsen, Nellie Henriette
spellingShingle Nilsen, Nellie Henriette
Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph
author_facet Nilsen, Nellie Henriette
author_sort Nilsen, Nellie Henriette
title Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph
title_short Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph
title_full Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph
title_fullStr Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph
title_full_unstemmed Spatial genetic structure in Northern European Sphagnum squarrosum Crome in relation to its Arctic morph
title_sort spatial genetic structure in northern european sphagnum squarrosum crome in relation to its arctic morph
publisher NTNU
publishDate 2021
url https://hdl.handle.net/11250/2831562
geographic Arctic
Faroe Islands
Greenland
Norway
Russland
Svalbard
geographic_facet Arctic
Faroe Islands
Greenland
Norway
Russland
Svalbard
genre Arctic
Arktis*
Faroe Islands
Færøyene
Greenland
Grønland
Svalbard
genre_facet Arctic
Arktis*
Faroe Islands
Færøyene
Greenland
Grønland
Svalbard
op_relation no.ntnu:inspera:79416900:50806581
https://hdl.handle.net/11250/2831562
_version_ 1766317020443312128