Исследование разнообразия ДНК бактериальных сообществ в нефтезагрязненных почвах

• Main Authors: Астанин, А. И., Наумова, Н. Б., Загребельный, С. Н.
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: Russian
• Published: Новосибирский государственный университет 2012
• Subjects: разнообразие бактериальной ДНК; денатурирующий градиентный гель-электрофорез; почва; нефтяное загрязнение; khanty; Siberia
• Online Access: http://lib.nsu.ru:8081/xmlui/handle/nsu/5062

Soil bacterial community diversity in oil- and slam-contaminated soil substrates sampled around oil-producing wells in West Siberia (Tyumen region, Khanty-Mansy Autonomous district, Russia) was studied by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of 16S rDNA amplified with eubacterial primers 341F and 907R. Even the most polluted soil with oil products content ranging as high as 50–100 mg per gram of soil were shown to contain at least 15 dominant bacterial species. Overall, the number of amplicon bands, i. e. bacterial species, revealed in the studied soil substrates did not correlate with the oil pollution rate, and no band was found to be similarly dominant in the samples. No sample displayed a unique DNA banding pattern, i. e. a completely unique structure of bacterial community dominants, as each component was present in at least one other soil sample. The study reiterates the urgency of soil biodiversity research as deeper insight into soil biodiversity is a prerequisite for sustaining ecosystem and human health. С помощью метода денатурирующего градиентного гель-электрофореза амплифицированных фрагментов 16S рДНК эубактерий (праймеры 341F и 907R) оценили генетическое разнообразие бактериального сообщества в образцах почвосубстратов, отобранных на территории нефтяных скважин Западной Сибири (Тюменская область, Ханты-Мансийский автономный округ) и загрязненных нефтью и буровыми отходами. Даже в крайне загрязненных почвах, содержащих 50–100 мг нефтепродуктов в грамме, обнаружено по меньшей мере 15 доминантных видов бактерий. В целом по всем изученным образцам количество выявленных полос ДНК не коррелировало с уровнем загрязнения анализируемого субстрата. Также не обнаружено одинакового для всех исследованных образцов доминантного штамма. Не выявлено ни одного образца с абсолютно уникальным составом бактериального сообщества; всегда присутствовали компоненты, характерные, как минимум, еще для одного образца. Проведенные исследования еще более подчеркнули актуальность детального изучения биоразнообразия почвенных экосистем нашей страны, так как понимание закономерностей формирования его состава и структуры сообществ почвенных микроорганизмов является необходимым для поддержания здоровья окружающей среды и населения.