Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk

Fossøy, F., Thaulow, J., Anglès d'Auriac, M., Brandsegg, H., Sivertsgård, R., Mo, T.A., Sandlund, O.T. & Hesthagen T. 2018. Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk. NINA Rapport 1586. Norsk institutt for naturforskning. Denne rappor...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Fossøy, Frode, Thaulow, Jens, d'Auriac, Marc Anglès, Brandsegg, Hege, Sivertsgård, Rolf, Mo, Tor Atle, Sandlund, Odd Terje, Hesthagen, Trygve
Format: Report
Language:Norwegian Bokmål
Published: Norsk Institutt for Naturforskning (NINA) 2018
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/11250/2575873
id ftninstnf:oai:brage.nina.no:11250/2575873
record_format openpolar
spelling ftninstnf:oai:brage.nina.no:11250/2575873 2023-05-15T18:03:45+02:00 Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk Fossøy, Frode Thaulow, Jens d'Auriac, Marc Anglès Brandsegg, Hege Sivertsgård, Rolf Mo, Tor Atle Sandlund, Odd Terje Hesthagen, Trygve 2018 application/octet-stream http://hdl.handle.net/11250/2575873 nob nob Norsk Institutt for Naturforskning (NINA) NINA Rapport;1586 urn:isbn:978-82-426-3325-5 urn:issn:1504-3312 http://hdl.handle.net/11250/2575873 © Norsk institutt for naturforskning Publikasjonen kan siteres fritt med kildeangivelse 46 + vedlegg Ferskvannsfisk Fremmede arter Miljø-DNA Artsspesifikke markører Research report 2018 ftninstnf 2021-12-23T07:17:06Z Fossøy, F., Thaulow, J., Anglès d'Auriac, M., Brandsegg, H., Sivertsgård, R., Mo, T.A., Sandlund, O.T. & Hesthagen T. 2018. Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk. NINA Rapport 1586. Norsk institutt for naturforskning. Denne rapporten er en videreføring av miljø-DNA som metode for overvåking av fremmed ferskvannsfisk i norske elver og innsjøer. I dette studiet har vi gjort en utstrakt gjennomgang og test av eksisterende protokoller for å påvise fremmed ferskvannsfisk ved hjelp av miljø-DNA. Vi har så gjort en vurdering om miljø-DNA-prøver kan fungere som et supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk gjennom andre pågående prosjekter. I vår prioriteringsliste har vi indikert at gjedde, ørekyt, pukkellaks og regnbueørret bør ansees som de viktigste fremmede artene å overvåke i Norge. Vi kan bekrefte at alle disse artene har artsspesifikke protokoller som fungerer. I tillegg har vi testet protokoller og bekreftet at disse fungerer på vannprøver innsamlet i dette studiet for: abbor, bekkerøye, karpe, karuss, mort og solabbor. En test av kryssamplifisering mellom arter viste at protokollene i dette studiet mest sannsynlig er artsspesifikke. Vi testet også protokollene for mulig PCR-inhibering, og fant til dels kraftig inhibering av flere prøver. Mengden inhibitorer vil variere mye mellom lokaliteter og årstider og vi vil anbefale å teste for inhibering ved alle miljø-DNA-analyser. I dette studiet har vi sammenlignet to etablerte protokoller basert på ulike filtre og analyser. Protokollene inkluderer to svært ulike filtertyper med et 0.22 μm Sterivex-filter og et 2.0 μm glassfiberfilter. Dette gjør seg utslag i hvor store vannvolumer det er mulig å filtrere og i dette studiet har vi filtrert ca. 1 liter vann gjennom Sterivex-filteret og 10 liter vann gjennom glassfiberfilteret. Resultatene våre viser at det finere filteret fanger mer DNA per liter vann, men at det høye vann-volumet som er mulig med det grovere filteret fanger mer DNA totalt sett. Andre studier viser at dette kan være avgjørende for om man påviser en sjelden art eller ikke. Vi vil anbefale bruk av begge disse metodene. I tillegg til uttesting av protokoller inkluderer denne rapporten også fortsetting av to pågående prosjekter på fremmed ferskvannsfisk. Her undersøker vi grensen for påvisning av fisk i Bymarka i Trondheim og forsetter overvåking av en potensiell spredning av gjedde i Telemarkskanalen. Eksperimentene i Bymarka viser at vi klarer å påvise 20 fisker med en lengde på 20 cm i to naturlige innsjøer, noe vi anser som svært viktig informasjon for overvåking av fremmed ferskvannsfisk. Resultatene fra Telemarkskanalen påviser for første gang gjedde oppstrøms Kjelldal sluse ved bruk av miljø-DNA. Report Pukkellaks Gjedde Norwegian Institute for Nature Research: Brage NINA Grensen ENVELOPE(13.617,13.617,66.951,66.951) Hesthagen ENVELOPE(18.558,18.558,69.082,69.082)
institution Open Polar
collection Norwegian Institute for Nature Research: Brage NINA
op_collection_id ftninstnf
language Norwegian Bokmål
topic Ferskvannsfisk
Fremmede arter
Miljø-DNA
Artsspesifikke markører
spellingShingle Ferskvannsfisk
Fremmede arter
Miljø-DNA
Artsspesifikke markører
Fossøy, Frode
Thaulow, Jens
d'Auriac, Marc Anglès
Brandsegg, Hege
Sivertsgård, Rolf
Mo, Tor Atle
Sandlund, Odd Terje
Hesthagen, Trygve
Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk
topic_facet Ferskvannsfisk
Fremmede arter
Miljø-DNA
Artsspesifikke markører
description Fossøy, F., Thaulow, J., Anglès d'Auriac, M., Brandsegg, H., Sivertsgård, R., Mo, T.A., Sandlund, O.T. & Hesthagen T. 2018. Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk. NINA Rapport 1586. Norsk institutt for naturforskning. Denne rapporten er en videreføring av miljø-DNA som metode for overvåking av fremmed ferskvannsfisk i norske elver og innsjøer. I dette studiet har vi gjort en utstrakt gjennomgang og test av eksisterende protokoller for å påvise fremmed ferskvannsfisk ved hjelp av miljø-DNA. Vi har så gjort en vurdering om miljø-DNA-prøver kan fungere som et supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk gjennom andre pågående prosjekter. I vår prioriteringsliste har vi indikert at gjedde, ørekyt, pukkellaks og regnbueørret bør ansees som de viktigste fremmede artene å overvåke i Norge. Vi kan bekrefte at alle disse artene har artsspesifikke protokoller som fungerer. I tillegg har vi testet protokoller og bekreftet at disse fungerer på vannprøver innsamlet i dette studiet for: abbor, bekkerøye, karpe, karuss, mort og solabbor. En test av kryssamplifisering mellom arter viste at protokollene i dette studiet mest sannsynlig er artsspesifikke. Vi testet også protokollene for mulig PCR-inhibering, og fant til dels kraftig inhibering av flere prøver. Mengden inhibitorer vil variere mye mellom lokaliteter og årstider og vi vil anbefale å teste for inhibering ved alle miljø-DNA-analyser. I dette studiet har vi sammenlignet to etablerte protokoller basert på ulike filtre og analyser. Protokollene inkluderer to svært ulike filtertyper med et 0.22 μm Sterivex-filter og et 2.0 μm glassfiberfilter. Dette gjør seg utslag i hvor store vannvolumer det er mulig å filtrere og i dette studiet har vi filtrert ca. 1 liter vann gjennom Sterivex-filteret og 10 liter vann gjennom glassfiberfilteret. Resultatene våre viser at det finere filteret fanger mer DNA per liter vann, men at det høye vann-volumet som er mulig med det grovere filteret fanger mer DNA totalt sett. Andre studier viser at dette kan være avgjørende for om man påviser en sjelden art eller ikke. Vi vil anbefale bruk av begge disse metodene. I tillegg til uttesting av protokoller inkluderer denne rapporten også fortsetting av to pågående prosjekter på fremmed ferskvannsfisk. Her undersøker vi grensen for påvisning av fisk i Bymarka i Trondheim og forsetter overvåking av en potensiell spredning av gjedde i Telemarkskanalen. Eksperimentene i Bymarka viser at vi klarer å påvise 20 fisker med en lengde på 20 cm i to naturlige innsjøer, noe vi anser som svært viktig informasjon for overvåking av fremmed ferskvannsfisk. Resultatene fra Telemarkskanalen påviser for første gang gjedde oppstrøms Kjelldal sluse ved bruk av miljø-DNA.
format Report
author Fossøy, Frode
Thaulow, Jens
d'Auriac, Marc Anglès
Brandsegg, Hege
Sivertsgård, Rolf
Mo, Tor Atle
Sandlund, Odd Terje
Hesthagen, Trygve
author_facet Fossøy, Frode
Thaulow, Jens
d'Auriac, Marc Anglès
Brandsegg, Hege
Sivertsgård, Rolf
Mo, Tor Atle
Sandlund, Odd Terje
Hesthagen, Trygve
author_sort Fossøy, Frode
title Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk
title_short Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk
title_full Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk
title_fullStr Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk
title_full_unstemmed Bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk
title_sort bruk av miljø-dna som supplerende verktøy for overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk
publisher Norsk Institutt for Naturforskning (NINA)
publishDate 2018
url http://hdl.handle.net/11250/2575873
long_lat ENVELOPE(13.617,13.617,66.951,66.951)
ENVELOPE(18.558,18.558,69.082,69.082)
geographic Grensen
Hesthagen
geographic_facet Grensen
Hesthagen
genre Pukkellaks
Gjedde
genre_facet Pukkellaks
Gjedde
op_source 46 + vedlegg
op_relation NINA Rapport;1586
urn:isbn:978-82-426-3325-5
urn:issn:1504-3312
http://hdl.handle.net/11250/2575873
op_rights © Norsk institutt for naturforskning Publikasjonen kan siteres fritt med kildeangivelse
_version_ 1766174747044872192