DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION

A 1D lower trophic level pelagic ecosystem model, NAGEM, was developed to investigate processes moderating productivity, algal community structure and resulting carbon export at BATS, ESTOC and PAP time-series stations in the North Atlantic. At each site, the relative effects of community structure,...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Yumruktepe, Veli Çağlar
Other Authors: Salihoğlu , Barış, Department of Oceanography
Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
Language:unknown
Published: Middle East Technical University 2017
Subjects:
PAP
Online Access:https://hdl.handle.net/11511/95097
id ftmetuankair:oai:https://open.metu.edu.tr:11511/95097
record_format openpolar
institution Open Polar
collection OpenMETU (Middle East Technical University)
op_collection_id ftmetuankair
language unknown
topic Carbon export
BATS
ESTOC
PAP
model algorithms
detritus feding
bacterial remineralization
subtropical gyre
the North Atlantic
Arbis Subjects::Natural Sciences
spellingShingle Carbon export
BATS
ESTOC
PAP
model algorithms
detritus feding
bacterial remineralization
subtropical gyre
the North Atlantic
Arbis Subjects::Natural Sciences
Yumruktepe, Veli Çağlar
DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION
topic_facet Carbon export
BATS
ESTOC
PAP
model algorithms
detritus feding
bacterial remineralization
subtropical gyre
the North Atlantic
Arbis Subjects::Natural Sciences
description A 1D lower trophic level pelagic ecosystem model, NAGEM, was developed to investigate processes moderating productivity, algal community structure and resulting carbon export at BATS, ESTOC and PAP time-series stations in the North Atlantic. At each site, the relative effects of community structure, sinking rates, physical and biological aggregation, mineral ballasting and diel vertical migration on carbon export were explored. Simulated carbon export rates were evaluated using in situ sediment trap data collected at the 3 time series stations and model algorithms were modified in order to best represent observed differences in export rates between stations. The observed 3-4 fold difference in carbon export between BATS and ESTOC is partially explained by differences in hydrographic conditions. The deeper and more prolonged vertical mixing at BATS results in efficient particle transport, whereas slower particle sinking at ESTOC results in a relatively higher remineralization pressure. This work highlighted the benefits of adequately describing plankton community structure in models to define the magnitude and structure of particle export and nutrient decoupling. Modelled carbon export was highly sensitive to changes in particle sinking rates, although these changes did not introduce variability in export. Temporal and spatial variability was achieved when specific sinking rates were assigned to detritus from each community. This resulted in relatively higher export efficiency at the PAP site due to the presence of larger plankton. Further improvements to model performance were achieved through adjusting aggregation, mineral ballasting, community specific remineralization rates and diel vertical migration of zooplankton. Kuzey Atlantik’te bulunan BATS, ESTOC ve PAP zaman serisi istasyonlarındaki üretimi, tür dağılımını ve gerçekleşen karbon dikey gönderimlerini yöneten prosesleri incelemek amacıyla NAGEM 1D alt trofik pelajik ekosistem modeli geliştirilmiştir. Her bir istasyon için tür dağılımının, parçacık çökme hızlarının, fiziksel ve biyolojik yığışımın, mineral balastın ve günlük dikey göçün karbon gönderimine etkileri araştırılmıştır. Simüle edilen karbon gönderimleri, istasyonlarda bulunan veri setleri ile karşılaştırılmış, ve model algoritmaları istasyonlardaki değişkenlikleri temsil edecek şekilde uyarlanmıştır. BATS ve ESTOC istasyonlarındaki 3-4 kat karbon gönderimi farkı, kısmi olarak istasyonlardaki farklı fiziki yapılar ile açıklanabilmektedir. BATS’taki görece daha derin ve uzun süreli dikey karışım verimli gönderime neden olmakta olup, ESTOC’taki yavaş çökelme mekanizmaları parçacıkların daha fazla ayrışma baskısı altında kalmasına neden olmaktadır. Model, tür dağılımının parçacık gönderiminin miktarına ve yapısına, inorganik besin tuzları bağlaşımının kesilmesinin tür dağılımına etkisini vurgulamıştır. Simüle edilen karbon gönderiminin parçacık hızlarındaki değişimlere çok hassas olduğu belirlenmiş olduğu halde sonuçlarda değişebilirlik düşük seviyelerde kalmıştır. Zamansal değişebilirlik, parçacık çökme hızlarının tür dağılımı etkileşimi ile gerçekleştirilebilmiştir. Tür dağılımı etkileşimleri sayesinde modelde zamansal ve bölgesel değişebilirlik elde edilmiş olup, görece büyük fitoplankton türlerini barındırabilen PAP istasyonunda artan parçacık gönderimine neden olmuştur. Parçacık yığışımı, mineral balast etkisi, tür dağılımı etkileşimi içeren ayrışma mekanizmaları ve günlük dikey göç, modelin gözlemelere daha iyi uymasını sağlamıştır. Ph.D. - Doctoral Program
author2 Salihoğlu , Barış
Department of Oceanography
format Doctoral or Postdoctoral Thesis
author Yumruktepe, Veli Çağlar
author_facet Yumruktepe, Veli Çağlar
author_sort Yumruktepe, Veli Çağlar
title DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION
title_short DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION
title_full DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION
title_fullStr DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION
title_full_unstemmed DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION
title_sort development and application of new model algorithms of the biological carbon pump in the north atlantic: a study on particle export, sinking and decomposition
publisher Middle East Technical University
publishDate 2017
url https://hdl.handle.net/11511/95097
geographic Atlantik
geographic_facet Atlantik
genre North Atlantic
genre_facet North Atlantic
op_relation https://hdl.handle.net/11511/95097
op_rights Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
op_rightsnorm CC-BY-NC-ND
_version_ 1766130311065763840
spelling ftmetuankair:oai:https://open.metu.edu.tr:11511/95097 2023-05-15T17:32:16+02:00 DEVELOPMENT AND APPLICATION OF NEW MODEL ALGORITHMS OF THE BIOLOGICAL CARBON PUMP IN THE NORTH ATLANTIC: A STUDY ON PARTICLE EXPORT, SINKING AND DECOMPOSITION BİYOLOJİK KARBON POMPASI MODEL ALGORİTMALARININ GELİŞTİRİLMESİ VE KUZEY ATLANTİK BASENİNE UYARLANMASI: PARÇACIK GÖNDERİMİ, ÇÖKMESİ VE AYRIŞMASI ÜZERİNE Yumruktepe, Veli Çağlar Salihoğlu , Barış Department of Oceanography 2017-1-24 151 application/pdf https://hdl.handle.net/11511/95097 unknown Middle East Technical University https://hdl.handle.net/11511/95097 Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ CC-BY-NC-ND Carbon export BATS ESTOC PAP model algorithms detritus feding bacterial remineralization subtropical gyre the North Atlantic Arbis Subjects::Natural Sciences Ph.D. Thesis 2017 ftmetuankair 2022-01-06T17:38:23Z A 1D lower trophic level pelagic ecosystem model, NAGEM, was developed to investigate processes moderating productivity, algal community structure and resulting carbon export at BATS, ESTOC and PAP time-series stations in the North Atlantic. At each site, the relative effects of community structure, sinking rates, physical and biological aggregation, mineral ballasting and diel vertical migration on carbon export were explored. Simulated carbon export rates were evaluated using in situ sediment trap data collected at the 3 time series stations and model algorithms were modified in order to best represent observed differences in export rates between stations. The observed 3-4 fold difference in carbon export between BATS and ESTOC is partially explained by differences in hydrographic conditions. The deeper and more prolonged vertical mixing at BATS results in efficient particle transport, whereas slower particle sinking at ESTOC results in a relatively higher remineralization pressure. This work highlighted the benefits of adequately describing plankton community structure in models to define the magnitude and structure of particle export and nutrient decoupling. Modelled carbon export was highly sensitive to changes in particle sinking rates, although these changes did not introduce variability in export. Temporal and spatial variability was achieved when specific sinking rates were assigned to detritus from each community. This resulted in relatively higher export efficiency at the PAP site due to the presence of larger plankton. Further improvements to model performance were achieved through adjusting aggregation, mineral ballasting, community specific remineralization rates and diel vertical migration of zooplankton. Kuzey Atlantik’te bulunan BATS, ESTOC ve PAP zaman serisi istasyonlarındaki üretimi, tür dağılımını ve gerçekleşen karbon dikey gönderimlerini yöneten prosesleri incelemek amacıyla NAGEM 1D alt trofik pelajik ekosistem modeli geliştirilmiştir. Her bir istasyon için tür dağılımının, parçacık çökme hızlarının, fiziksel ve biyolojik yığışımın, mineral balastın ve günlük dikey göçün karbon gönderimine etkileri araştırılmıştır. Simüle edilen karbon gönderimleri, istasyonlarda bulunan veri setleri ile karşılaştırılmış, ve model algoritmaları istasyonlardaki değişkenlikleri temsil edecek şekilde uyarlanmıştır. BATS ve ESTOC istasyonlarındaki 3-4 kat karbon gönderimi farkı, kısmi olarak istasyonlardaki farklı fiziki yapılar ile açıklanabilmektedir. BATS’taki görece daha derin ve uzun süreli dikey karışım verimli gönderime neden olmakta olup, ESTOC’taki yavaş çökelme mekanizmaları parçacıkların daha fazla ayrışma baskısı altında kalmasına neden olmaktadır. Model, tür dağılımının parçacık gönderiminin miktarına ve yapısına, inorganik besin tuzları bağlaşımının kesilmesinin tür dağılımına etkisini vurgulamıştır. Simüle edilen karbon gönderiminin parçacık hızlarındaki değişimlere çok hassas olduğu belirlenmiş olduğu halde sonuçlarda değişebilirlik düşük seviyelerde kalmıştır. Zamansal değişebilirlik, parçacık çökme hızlarının tür dağılımı etkileşimi ile gerçekleştirilebilmiştir. Tür dağılımı etkileşimleri sayesinde modelde zamansal ve bölgesel değişebilirlik elde edilmiş olup, görece büyük fitoplankton türlerini barındırabilen PAP istasyonunda artan parçacık gönderimine neden olmuştur. Parçacık yığışımı, mineral balast etkisi, tür dağılımı etkileşimi içeren ayrışma mekanizmaları ve günlük dikey göç, modelin gözlemelere daha iyi uymasını sağlamıştır. Ph.D. - Doctoral Program Doctoral or Postdoctoral Thesis North Atlantic OpenMETU (Middle East Technical University) Atlantik