Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània

We examined the genetic population structure of the european hake (Merluccius merluccius) using electrophoretically detectable population markers in 35 protein loci. Samples were collected from 7 locations in the Atlantic Ocean and Mediterranean Sea. Six loci were polymorphic using the 0.05 criterio...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Vila i Gispert, Anna, Pla Zanuy, Carles
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:Catalan
Published: Institut d'Estudis Catalans. Institució Catalana d'Història Natural 1997
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10256/9421
id ftmdx:oai:www.mdx.cat:10503/60560
record_format openpolar
institution Open Polar
collection MDX (Learning Materials Online)
op_collection_id ftmdx
language Catalan
topic Lluç -- Genètica
Hake -- Genetics
Electroforesi
Electrophoresis
Polimorfisme genètic
Genetic polymorphisms
spellingShingle Lluç -- Genètica
Hake -- Genetics
Electroforesi
Electrophoresis
Polimorfisme genètic
Genetic polymorphisms
Vila i Gispert, Anna
Pla Zanuy, Carles
Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània
topic_facet Lluç -- Genètica
Hake -- Genetics
Electroforesi
Electrophoresis
Polimorfisme genètic
Genetic polymorphisms
description We examined the genetic population structure of the european hake (Merluccius merluccius) using electrophoretically detectable population markers in 35 protein loci. Samples were collected from 7 locations in the Atlantic Ocean and Mediterranean Sea. Six loci were polymorphic using the 0.05 criterion of polymorphism. Sample heterozigosities ranged from 0.052 to 0.072 and averaged 0.0625. In this study, significant allele frequency differences were detected between Atlantic and Mediterranean populations in three polymorphic loci: GAPDH-1*, GPI-2* and SOD-1*. Two major genetic groups were considered: a North-Atlantic stock and the Mediterranean stock. The Nei genetic distance, D, (based on 33 loci) between samples from these two groups ranged from 0.002 to 0.006. Genetic differenciation between these areas appears to reflect the barrier effect of Strait of Gibraltar. On average over loci, 96.92 % of the total gene diversity was contained within samples, 0.23 % expressed differences among locations within areas, and 2.64 % differences between regions. A review of morphological variation together with the genetic data presented here suggest that the populations of hake from these areas are subdivided into two different stocks: the North-Atlantic stock and the Mediterranean stock. The most conservative approach to the management of these stocks is to consider the Atlantic and Mediterranean stocks independently from one another L'anàlisi electroforètica de mostres pertanyents a Port de la Selva, Palamós, Blanes, Sant Carles de la Ràpita, Gandia, Huelva i Donostia ha permès de detectar 35 loci electroforètics dels quals 16 presenten variabilitat genètica i 6 són polimòrfics: GAPDH-1*, GPI-1*, GPI-2*, G3PDH* SOD-1* i CAT*. El grau de diferenciació genètica trobat per aquests loci a les diverses localitats mostrejades indica que existeixen diferències significatives entre les poblacions mediterrànies i atlàntiques de lluç, per la qual cosa podem afirmar que aquestes poblacions formen part de dos estocs diferents. Aquesta diferenciació creiem que és deguda a la barrera ecològica que representa l'estret de Gibraltar, que redueix considerablement el flux de gens entre ambdues zones. La variabilitat genètica, mesurada quant a nivell d'heterozigositat, indica que cap de les dues poblacions de lluç, mediterrani i atlàntic, han sofert recents «colls d'ampolla», és a dir, no han patit canvis dràstics quant a grandària i estructura de la població, tot i la sobreexplotació a la qual estan sotmeses. Dels loci polimòrfics, GAPDH-1*, GPI-2* i SOD 1*, presenten variabilitat genètica partint de factors geogràfics i poden ésser utilitzats com a marcadors genètics, ja que el seu comportament diferencial permet d'identificar i separar captures pertanyents a l'Atlàntic i a la Mediterrània. Quant al locus GPI-2* també presenta una va riant al·lèlica lenta, GPI-2* (*90) només en les poblacions atlàntiques, per la qual cosa podem considerar també aquest al·lel com un possible marcador genètic que permetria de separar captures d'ambdues zones. El valor de distància genètica trobat entre les localitats atlàntiques i les mediterrànies no permet de parlar d'espècies diferents de lluç. L'anàlisi de la diversitat genètica mostra que el percentatge més elevat de variació genètica es troba en els individus dins les poblacions, i entre les àrees mediterrània i atlàntica, per la qual cual deduïm que dins d'aquestes àrees existeix un flux de gens que redueix considerablement la diferenciació genètica entre les diverses localitats mostrejades. La menor diferenciació genètica existent entre les localitats atlàntiques mostrejades en comparació amb les mediterrànies pot ésser explicada a partir de majors grandàries poblacionals i/o majors taxes de migració en la població atlàntica de lluç. Aquest resultat és de gran interès per a la futura gestió i conservació d’aquest recurs biològic a les zones estudiades
format Article in Journal/Newspaper
author Vila i Gispert, Anna
Pla Zanuy, Carles
author_facet Vila i Gispert, Anna
Pla Zanuy, Carles
author_sort Vila i Gispert, Anna
title Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània
title_short Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània
title_full Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània
title_fullStr Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània
title_full_unstemmed Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània
title_sort genetic variation in the european hake, merluccius merluccius. description of protein loci and genetic divergence between atlantic and mediterranean populations = anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, merluccius merluccius. descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània
publisher Institut d'Estudis Catalans. Institució Catalana d'Història Natural
publishDate 1997
url http://hdl.handle.net/10256/9421
long_lat ENVELOPE(15.612,15.612,66.797,66.797)
geographic Hake
geographic_facet Hake
genre North Atlantic
genre_facet North Atlantic
op_relation Reproducció digital del document publicat a: http://revistes.iec.cat/index.php/BICHN/article/view/8918/75451
Butlletí de la Institució Catalana d'Història Natural, 1997, núm. 65, p. 47-65
Articles publicats (D-CCAA)
1133-6889 (versió paper)
2013-3987 (versió electrònica)
006449
http://hdl.handle.net/10256/9421
op_rights Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Spain
info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/
op_rightsnorm CC-BY-NC-ND
_version_ 1766135018311122944
spelling ftmdx:oai:www.mdx.cat:10503/60560 2023-05-15T17:35:45+02:00 Genetic variation in the European hake, Merluccius merluccius. Description of protein loci and genetic divergence between Atlantic and Mediterranean populations = Anàlisi de la variabilitat genètica en el lluç europeu, Merluccius merluccius. Descripció dels loci electroforètics i divergència genètica entre les poblacions atlàntica i mediterrània Vila i Gispert, Anna Pla Zanuy, Carles 1997 application/pdf http://hdl.handle.net/10256/9421 cat cat Institut d'Estudis Catalans. Institució Catalana d'Història Natural Reproducció digital del document publicat a: http://revistes.iec.cat/index.php/BICHN/article/view/8918/75451 Butlletí de la Institució Catalana d'Història Natural, 1997, núm. 65, p. 47-65 Articles publicats (D-CCAA) 1133-6889 (versió paper) 2013-3987 (versió electrònica) 006449 http://hdl.handle.net/10256/9421 Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Spain info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ CC-BY-NC-ND Lluç -- Genètica Hake -- Genetics Electroforesi Electrophoresis Polimorfisme genètic Genetic polymorphisms info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 1997 ftmdx 2019-05-23T16:30:49Z We examined the genetic population structure of the european hake (Merluccius merluccius) using electrophoretically detectable population markers in 35 protein loci. Samples were collected from 7 locations in the Atlantic Ocean and Mediterranean Sea. Six loci were polymorphic using the 0.05 criterion of polymorphism. Sample heterozigosities ranged from 0.052 to 0.072 and averaged 0.0625. In this study, significant allele frequency differences were detected between Atlantic and Mediterranean populations in three polymorphic loci: GAPDH-1*, GPI-2* and SOD-1*. Two major genetic groups were considered: a North-Atlantic stock and the Mediterranean stock. The Nei genetic distance, D, (based on 33 loci) between samples from these two groups ranged from 0.002 to 0.006. Genetic differenciation between these areas appears to reflect the barrier effect of Strait of Gibraltar. On average over loci, 96.92 % of the total gene diversity was contained within samples, 0.23 % expressed differences among locations within areas, and 2.64 % differences between regions. A review of morphological variation together with the genetic data presented here suggest that the populations of hake from these areas are subdivided into two different stocks: the North-Atlantic stock and the Mediterranean stock. The most conservative approach to the management of these stocks is to consider the Atlantic and Mediterranean stocks independently from one another L'anàlisi electroforètica de mostres pertanyents a Port de la Selva, Palamós, Blanes, Sant Carles de la Ràpita, Gandia, Huelva i Donostia ha permès de detectar 35 loci electroforètics dels quals 16 presenten variabilitat genètica i 6 són polimòrfics: GAPDH-1*, GPI-1*, GPI-2*, G3PDH* SOD-1* i CAT*. El grau de diferenciació genètica trobat per aquests loci a les diverses localitats mostrejades indica que existeixen diferències significatives entre les poblacions mediterrànies i atlàntiques de lluç, per la qual cosa podem afirmar que aquestes poblacions formen part de dos estocs diferents. Aquesta diferenciació creiem que és deguda a la barrera ecològica que representa l'estret de Gibraltar, que redueix considerablement el flux de gens entre ambdues zones. La variabilitat genètica, mesurada quant a nivell d'heterozigositat, indica que cap de les dues poblacions de lluç, mediterrani i atlàntic, han sofert recents «colls d'ampolla», és a dir, no han patit canvis dràstics quant a grandària i estructura de la població, tot i la sobreexplotació a la qual estan sotmeses. Dels loci polimòrfics, GAPDH-1*, GPI-2* i SOD 1*, presenten variabilitat genètica partint de factors geogràfics i poden ésser utilitzats com a marcadors genètics, ja que el seu comportament diferencial permet d'identificar i separar captures pertanyents a l'Atlàntic i a la Mediterrània. Quant al locus GPI-2* també presenta una va riant al·lèlica lenta, GPI-2* (*90) només en les poblacions atlàntiques, per la qual cosa podem considerar també aquest al·lel com un possible marcador genètic que permetria de separar captures d'ambdues zones. El valor de distància genètica trobat entre les localitats atlàntiques i les mediterrànies no permet de parlar d'espècies diferents de lluç. L'anàlisi de la diversitat genètica mostra que el percentatge més elevat de variació genètica es troba en els individus dins les poblacions, i entre les àrees mediterrània i atlàntica, per la qual cual deduïm que dins d'aquestes àrees existeix un flux de gens que redueix considerablement la diferenciació genètica entre les diverses localitats mostrejades. La menor diferenciació genètica existent entre les localitats atlàntiques mostrejades en comparació amb les mediterrànies pot ésser explicada a partir de majors grandàries poblacionals i/o majors taxes de migració en la població atlàntica de lluç. Aquest resultat és de gran interès per a la futura gestió i conservació d’aquest recurs biològic a les zones estudiades Article in Journal/Newspaper North Atlantic MDX (Learning Materials Online) Hake ENVELOPE(15.612,15.612,66.797,66.797)