A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS

In the European Alpine System sensu Ozenda (1985), i.e. Alps, Carpathians, Pyrenees, Apennines, Dinarides, Balkans, four species of Saussurea (Asteraceae) occur: S. alpina, S. discolor (= S. lapathifolia), S. porcii, and S. pygmaea. In this talk, preliminary results on European species of Saussurea...

Full description

Bibliographic Details
Published in:Visnyk of Lviv University. Biological series
Main Author: Pochynok, T.
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:English
Published: Ivan Franko National University of Lviv 2018
Subjects:
Online Access:http://publications.lnu.edu.ua/bulletins/index.php/biology/article/view/9265
https://doi.org/10.30970/vlubs.2018.78.14
id ftlvivunivojs:oai:ojs.www1.lnu.edu.ua:article/9265
record_format openpolar
institution Open Polar
collection Periodicals of Lviv University
op_collection_id ftlvivunivojs
language English
description In the European Alpine System sensu Ozenda (1985), i.e. Alps, Carpathians, Pyrenees, Apennines, Dinarides, Balkans, four species of Saussurea (Asteraceae) occur: S. alpina, S. discolor (= S. lapathifolia), S. porcii, and S. pygmaea. In this talk, preliminary results on European species of Saussurea sect. Saussurea (Lipschitz 1979), i.e. S. alpina, S. discolor and S. porcii will be presented. Due to an assumed adaptive radiation of Saussurea s. lat. during Miocene, a genus of about 450 species with its greatest diversity in Siberia, Central Asia, the Himalaya, and the Qinghai-Xizang Plateau, the phylogenetic resolution with classical molecular markers like ITS, trnL-F and psbA-trnH is insufficient for neither robust phylogeny, nor species delimitation (Wang & al. 2009). For clarifying the evolution of European mountain species of Saussurea, the molecular fingerprinting method AFLP was used. The focus was put on S. alpina (Arctic-alpine element, 2x and 4x), S. discolor (European Alpine System, 2x) and the rare and enigmatic Eastern Carpathian endemic S. porcii (Kobiv & al. 2007, Matis & al. 2014). Whereas S. porcii is clearly separated from the other species what is in line with morphology and its presumed close relationship to the predominantly Siberian S. parviflora (= S. serrata), S. alpina and S. discolor reveal more complex evolutionary patterns. Hybridization between S. alpina and S. discolor was so far only speculated (Gremli 1870, Lipschitz 1976). Hybrids could now be proven with AFLPs for the Eastern Alps, where both species occur in parapatry on schists. The clear morphological, ecological and genetic separation of the Western Alpine S. alpina subsp. depressa (2x) from subsp. alpina (2x) could already be shown by Kreuzer & al. (2014). Recently, S. depressa is even accepted on the species level in Flora Gallica (Tison & Foucault 2014). According to the AFLP data, populations of S. alpina from the Arctic, the Alps and the Carpathians cluster together. Contrary to Alpine ones, Carpathian populations show higher divergence from each other what is likely due to the fact that the Carpathians where only locally glaciated, not exceeding 1% of their total area (Ronikier 2011). This could favor rather a Pleistocene migration Altai – Ural – Carpathians – Alps, where the Carpathians acted as a stepping stone, than migration through the Arctic (Gnader-Thimm 1963, Mráz & Ronikier 2016). The Eastern Alpine-Carpathian S. alpina subsp. macrophylla as accepted in Flora Europaea (Lipschitz 1976) or Flora Alpina (Aeschimann et al. 2004) or other infraspecific taxa of S. alpina reported from the Carpathians (Nyárády 1940, 1964) are not supported by molecular data. The Eastern Carpathian population of S. discolor from Chorny Dil (Ukraine) is clearly separated from those from the Alps. Thus Carpathian S. discolor could represent a unique phylogeographic group, a pattern known from several other high-mountain plants (Ronikier 2011). Within the Alps, the investigated population of S. discolor from Rax (Northeastern calcareous Alps) is more divergent from other from the Alps and shows significantly higher rarity. This corresponds well the other phylogeographic studies on high mountain plants of this refugial area (Schönswetter & al. 2005, Essl & Rabitsch 2009). Ongoing research on Saussurea includes the extension of sampling, sequencing of highly variable cpDNA markers from herbarium specimens, population genetics with RAD-Seq, ploidy level estimation with flow cytometry, chromosome counts (the chromosome number for S. porcii is not known!) and morphological analyses. The first genome size measurement for the genus Saussurea could be inferred with Ukrainian material of Saussurea porcii from Mt. Hnetiesa: 1C= 2,60 pg, which is higher than in the sister genus Jurinea, J. mollis: 1C = 1,80 pg (Susanna & Garcia-Jacas 2009, Siljak-Yakovlev & al. 2010). У Європейскій альпійській системі за визначенням Ozenda (1985), включаючи Альпи, Карпати, Піренеї, Апенніни, Динарські Альпи, Балкани, трапляються чотири види роду Saussurea (Asteraceae): S. alpina, S. discolor (= S. lapathifolia), S. porcii та S. pygmaea. У доповіді представлені попередні результати по європейських видах роду Saussurea sect. Saussurea (Lipschitz 1979), а саме S. alpina, S. discolor і S. porcii. Відповідно до імовірної адаптивної радіації в міоцені роду Saussurea s. lat., який налічує понад 450 видів з найбільшим різноманіттям у Сибіру, Центральній Азії, Гімалаях та Цинхай-Тибетському плато (Qinghai-Xizang), філогенетична резолюція за допомогою класичних молекулярних маркерів, а саме: ITS, trnL-F, psbA-trnH, недостатня як для достовірної філогенії, так і для розмежування видів (Wang & al. 2009). Для з’ясування еволюції видів Saussurea у європейських горах було застосовано молекулярний метод фінгерпринту AFLP з фокусом на таких видах, як S. alpina (аркто-альпійський елемент, ди- і тетраплоїд), S. discolor (Європейска альпійська система, диплоїд) та рідкісний і загадковий східно-карпатський ендемік S. porcii (Kobiv & al. 2007, Matis & al. 2014). Тим часом, як S. porcii чітко відмежований від інших видів, що є у відповідності з його морфологією та імовірним близьким спорідненим зв’язком до переважно сибірського виду S. parviflora (= S. serrata), все ж S. alpina і S. discolor проявляють більш комплексну еволюційну модель. Про гібридизацію між S. alpina та S. discolor досі лише спекулювали (Gremli 1870, Lipschitz 1976). Але за допомогою AFLP не вдалося підтвердити гібриди для Східних Альп, де обидва види трапляються на сланцях парапатрично. Чітке морфологічне, екологічне та генетичне розмежування S. alpina subsp. depressa (2x) із Західних Альп від subsp. alpina (2x) вдалося показати Kreuzer & al. (2014). Більше того, нещодавно S. depressa прийнято в ранзі виду у Flora Gallica (Tison & Foucault 2014). Згідно з даними AFLP популяції S. alpina з Арктики, Альп і Карпат згруповані в один кластер. Напротивагу альпійським карпатські популяції показують вищу дивергентність між собою, що, імовірно, спричинене лише локальним зледенінням в Карпатах, яке не перевищувало 1% їх загальної території (Ronikier 2011). Це могло швидше слугувати для плейстоценової міграції Алтай–Урал–Карпати–Альпи, де Карпати відігравали роль містка (stepping stone), ніж для міграції крізь Арктику (Gnader-Thimm 1963, Mráz & Ronikier 2016). Східно-альпійсько-карпатський вид S. alpina subsp. macrophylla, прийнятий у Flora Europaea (Lipschitz 1976) чи Flora Alpina (Aeschimann et al. 2004), або інші внутрішньовидові таксони S. alpina, наведені з Карпат (Nyárády 1940, 1964), не підтримані молекулярними даними. Популяція S. discolor із Східних Карпат на Чорному Долі (Україна) чітко відмежована від тих, що в Альпах. Хоча S. discolor з Карпат могла би представляти унікальну філогеографічну групу – модель, відома для деяких інших високогірних рослин (Ronikier 2011). В Альпах досліджувана популяція S. discolor з масиву Ракс (північно-східні вапнякові Альпи) є більш дивергентною, порівняно з іншими альпійськими, та має достовірно вищі показники рідкісності. Це узгоджується з філогеографічними дослідженнями інших високогірних рослин цієї території-рефугіума (Schönswetter & al. 2005, Essl & Rabitsch 2009). Дослідження роду Saussurea, яке досі триває, включає розширення вибірки, секвенування високомінливих маркерів пластидної ДНК з гербарних зразків, популяційну генетику з RAD-Seq, визначення рівня плоїдності за допомогою проточної цитометрії, кількості хромосом (число хромосом для S. porcii невідоме!) і морфологічний аналіз. Вперше розмір геному для роду Saussurea визначено на основі українських зразків Saussurea porcii з г. Гнєтєса: 1C= 2,60 пг, який є вищим, порівняно з сестринським родом Jurinea, J. mollis: 1C = 1,80 пг (Susanna & Garcia-Jacas 2009, Siljak-Yakovlev & al. 2010).
format Article in Journal/Newspaper
author Pochynok, T.
spellingShingle Pochynok, T.
A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS
author_facet Pochynok, T.
author_sort Pochynok, T.
title A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS
title_short A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS
title_full A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS
title_fullStr A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS
title_full_unstemmed A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS
title_sort molecular glance on the genus saussurea (asteraceae) in the european alpine system: a report on work in progress
publisher Ivan Franko National University of Lviv
publishDate 2018
url http://publications.lnu.edu.ua/bulletins/index.php/biology/article/view/9265
https://doi.org/10.30970/vlubs.2018.78.14
long_lat ENVELOPE(16.633,16.633,-71.983,-71.983)
geographic Arctic
Yakovlev
geographic_facet Arctic
Yakovlev
genre Arctic
Siberia
genre_facet Arctic
Siberia
op_source Visnyk of Lviv University. Biological series; № 78 (2018): Випуск 78; 70-72
Вісник Львівського університету. Серія біологічна; № 78 (2018): Випуск 78; 70-72
2075-5236
0206-5657
10.30970/vlubs.2018.78
op_relation http://publications.lnu.edu.ua/bulletins/index.php/biology/article/view/9265/9251
http://publications.lnu.edu.ua/bulletins/index.php/biology/article/view/9265
doi:10.30970/vlubs.2018.78.14
op_rights Copyright (c) 2018 Вісник Львівського університету. Серія біологічна
op_doi https://doi.org/10.30970/vlubs.2018.78.14
https://doi.org/10.30970/vlubs.2018.78
container_title Visnyk of Lviv University. Biological series
container_issue 78
container_start_page 70
op_container_end_page 72
_version_ 1766347328217677824
spelling ftlvivunivojs:oai:ojs.www1.lnu.edu.ua:article/9265 2023-05-15T15:17:02+02:00 A MOLECULAR GLANCE ON THE GENUS SAUSSUREA (ASTERACEAE) IN THE EUROPEAN ALPINE SYSTEM: A REPORT ON WORK IN PROGRESS МОЛЕКУЛЯРНИЙ ОГЛЯД РОДУ SAUSSUREA (ASTERACEAE) У ЄВРОПЕЙСЬКІЙ АЛЬПІЙСЬКІЙ СИСТЕМІ: ЗВІТ ІЗ НЕЗАВЕРШЕНОЇ РОБОТИ Pochynok, T. 2018-12-01 application/pdf http://publications.lnu.edu.ua/bulletins/index.php/biology/article/view/9265 https://doi.org/10.30970/vlubs.2018.78.14 eng eng Ivan Franko National University of Lviv http://publications.lnu.edu.ua/bulletins/index.php/biology/article/view/9265/9251 http://publications.lnu.edu.ua/bulletins/index.php/biology/article/view/9265 doi:10.30970/vlubs.2018.78.14 Copyright (c) 2018 Вісник Львівського університету. Серія біологічна Visnyk of Lviv University. Biological series; № 78 (2018): Випуск 78; 70-72 Вісник Львівського університету. Серія біологічна; № 78 (2018): Випуск 78; 70-72 2075-5236 0206-5657 10.30970/vlubs.2018.78 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2018 ftlvivunivojs https://doi.org/10.30970/vlubs.2018.78.14 https://doi.org/10.30970/vlubs.2018.78 2021-09-12T20:04:59Z In the European Alpine System sensu Ozenda (1985), i.e. Alps, Carpathians, Pyrenees, Apennines, Dinarides, Balkans, four species of Saussurea (Asteraceae) occur: S. alpina, S. discolor (= S. lapathifolia), S. porcii, and S. pygmaea. In this talk, preliminary results on European species of Saussurea sect. Saussurea (Lipschitz 1979), i.e. S. alpina, S. discolor and S. porcii will be presented. Due to an assumed adaptive radiation of Saussurea s. lat. during Miocene, a genus of about 450 species with its greatest diversity in Siberia, Central Asia, the Himalaya, and the Qinghai-Xizang Plateau, the phylogenetic resolution with classical molecular markers like ITS, trnL-F and psbA-trnH is insufficient for neither robust phylogeny, nor species delimitation (Wang & al. 2009). For clarifying the evolution of European mountain species of Saussurea, the molecular fingerprinting method AFLP was used. The focus was put on S. alpina (Arctic-alpine element, 2x and 4x), S. discolor (European Alpine System, 2x) and the rare and enigmatic Eastern Carpathian endemic S. porcii (Kobiv & al. 2007, Matis & al. 2014). Whereas S. porcii is clearly separated from the other species what is in line with morphology and its presumed close relationship to the predominantly Siberian S. parviflora (= S. serrata), S. alpina and S. discolor reveal more complex evolutionary patterns. Hybridization between S. alpina and S. discolor was so far only speculated (Gremli 1870, Lipschitz 1976). Hybrids could now be proven with AFLPs for the Eastern Alps, where both species occur in parapatry on schists. The clear morphological, ecological and genetic separation of the Western Alpine S. alpina subsp. depressa (2x) from subsp. alpina (2x) could already be shown by Kreuzer & al. (2014). Recently, S. depressa is even accepted on the species level in Flora Gallica (Tison & Foucault 2014). According to the AFLP data, populations of S. alpina from the Arctic, the Alps and the Carpathians cluster together. Contrary to Alpine ones, Carpathian populations show higher divergence from each other what is likely due to the fact that the Carpathians where only locally glaciated, not exceeding 1% of their total area (Ronikier 2011). This could favor rather a Pleistocene migration Altai – Ural – Carpathians – Alps, where the Carpathians acted as a stepping stone, than migration through the Arctic (Gnader-Thimm 1963, Mráz & Ronikier 2016). The Eastern Alpine-Carpathian S. alpina subsp. macrophylla as accepted in Flora Europaea (Lipschitz 1976) or Flora Alpina (Aeschimann et al. 2004) or other infraspecific taxa of S. alpina reported from the Carpathians (Nyárády 1940, 1964) are not supported by molecular data. The Eastern Carpathian population of S. discolor from Chorny Dil (Ukraine) is clearly separated from those from the Alps. Thus Carpathian S. discolor could represent a unique phylogeographic group, a pattern known from several other high-mountain plants (Ronikier 2011). Within the Alps, the investigated population of S. discolor from Rax (Northeastern calcareous Alps) is more divergent from other from the Alps and shows significantly higher rarity. This corresponds well the other phylogeographic studies on high mountain plants of this refugial area (Schönswetter & al. 2005, Essl & Rabitsch 2009). Ongoing research on Saussurea includes the extension of sampling, sequencing of highly variable cpDNA markers from herbarium specimens, population genetics with RAD-Seq, ploidy level estimation with flow cytometry, chromosome counts (the chromosome number for S. porcii is not known!) and morphological analyses. The first genome size measurement for the genus Saussurea could be inferred with Ukrainian material of Saussurea porcii from Mt. Hnetiesa: 1C= 2,60 pg, which is higher than in the sister genus Jurinea, J. mollis: 1C = 1,80 pg (Susanna & Garcia-Jacas 2009, Siljak-Yakovlev & al. 2010). У Європейскій альпійській системі за визначенням Ozenda (1985), включаючи Альпи, Карпати, Піренеї, Апенніни, Динарські Альпи, Балкани, трапляються чотири види роду Saussurea (Asteraceae): S. alpina, S. discolor (= S. lapathifolia), S. porcii та S. pygmaea. У доповіді представлені попередні результати по європейських видах роду Saussurea sect. Saussurea (Lipschitz 1979), а саме S. alpina, S. discolor і S. porcii. Відповідно до імовірної адаптивної радіації в міоцені роду Saussurea s. lat., який налічує понад 450 видів з найбільшим різноманіттям у Сибіру, Центральній Азії, Гімалаях та Цинхай-Тибетському плато (Qinghai-Xizang), філогенетична резолюція за допомогою класичних молекулярних маркерів, а саме: ITS, trnL-F, psbA-trnH, недостатня як для достовірної філогенії, так і для розмежування видів (Wang & al. 2009). Для з’ясування еволюції видів Saussurea у європейських горах було застосовано молекулярний метод фінгерпринту AFLP з фокусом на таких видах, як S. alpina (аркто-альпійський елемент, ди- і тетраплоїд), S. discolor (Європейска альпійська система, диплоїд) та рідкісний і загадковий східно-карпатський ендемік S. porcii (Kobiv & al. 2007, Matis & al. 2014). Тим часом, як S. porcii чітко відмежований від інших видів, що є у відповідності з його морфологією та імовірним близьким спорідненим зв’язком до переважно сибірського виду S. parviflora (= S. serrata), все ж S. alpina і S. discolor проявляють більш комплексну еволюційну модель. Про гібридизацію між S. alpina та S. discolor досі лише спекулювали (Gremli 1870, Lipschitz 1976). Але за допомогою AFLP не вдалося підтвердити гібриди для Східних Альп, де обидва види трапляються на сланцях парапатрично. Чітке морфологічне, екологічне та генетичне розмежування S. alpina subsp. depressa (2x) із Західних Альп від subsp. alpina (2x) вдалося показати Kreuzer & al. (2014). Більше того, нещодавно S. depressa прийнято в ранзі виду у Flora Gallica (Tison & Foucault 2014). Згідно з даними AFLP популяції S. alpina з Арктики, Альп і Карпат згруповані в один кластер. Напротивагу альпійським карпатські популяції показують вищу дивергентність між собою, що, імовірно, спричинене лише локальним зледенінням в Карпатах, яке не перевищувало 1% їх загальної території (Ronikier 2011). Це могло швидше слугувати для плейстоценової міграції Алтай–Урал–Карпати–Альпи, де Карпати відігравали роль містка (stepping stone), ніж для міграції крізь Арктику (Gnader-Thimm 1963, Mráz & Ronikier 2016). Східно-альпійсько-карпатський вид S. alpina subsp. macrophylla, прийнятий у Flora Europaea (Lipschitz 1976) чи Flora Alpina (Aeschimann et al. 2004), або інші внутрішньовидові таксони S. alpina, наведені з Карпат (Nyárády 1940, 1964), не підтримані молекулярними даними. Популяція S. discolor із Східних Карпат на Чорному Долі (Україна) чітко відмежована від тих, що в Альпах. Хоча S. discolor з Карпат могла би представляти унікальну філогеографічну групу – модель, відома для деяких інших високогірних рослин (Ronikier 2011). В Альпах досліджувана популяція S. discolor з масиву Ракс (північно-східні вапнякові Альпи) є більш дивергентною, порівняно з іншими альпійськими, та має достовірно вищі показники рідкісності. Це узгоджується з філогеографічними дослідженнями інших високогірних рослин цієї території-рефугіума (Schönswetter & al. 2005, Essl & Rabitsch 2009). Дослідження роду Saussurea, яке досі триває, включає розширення вибірки, секвенування високомінливих маркерів пластидної ДНК з гербарних зразків, популяційну генетику з RAD-Seq, визначення рівня плоїдності за допомогою проточної цитометрії, кількості хромосом (число хромосом для S. porcii невідоме!) і морфологічний аналіз. Вперше розмір геному для роду Saussurea визначено на основі українських зразків Saussurea porcii з г. Гнєтєса: 1C= 2,60 пг, який є вищим, порівняно з сестринським родом Jurinea, J. mollis: 1C = 1,80 пг (Susanna & Garcia-Jacas 2009, Siljak-Yakovlev & al. 2010). Article in Journal/Newspaper Arctic Siberia Periodicals of Lviv University Arctic Yakovlev ENVELOPE(16.633,16.633,-71.983,-71.983) Visnyk of Lviv University. Biological series 78 70 72