16S rRNS gēna vairāku un divu mainīgo reģionu mikrobioma rekonstrukcijas algoritmu iegūto rezultātu salīdzināšana

• Main Author: Liepa, Edgars
• Other Authors: Fridmanis, Dāvids, Latvijas Universitāte. Datorikas fakultāte
• Format: Master Thesis
• Language: Latvian
• Published: Latvijas Universitāte 2022
• Subjects: Datorzinātne; mikrobioms; 16s rRNS; taksonomija; filoģenētika; mikrobioloģija; Kad’; Tika; Salmo salar
• Online Access: https://dspace.lu.lv/dspace/handle/7/59996

16S rRNS marķiergēna sekvencēšana ir viena no plašāk izmantotākajām un lētākajām mikrobioma taksonomiskā profila rekonstruēšanas metodēm. Taču, īso sekvencēšanas nolasījumu dēļ, visi gēna mainīgie reģioni nevar tikt nolasīti vienlaicīgi, bet tos nolasot atsevišķi zūd katra atsevišķā reģiona sasaiste...