Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia

Identified are the occurrence, serotypic and genotypic variations of Hepatitis B virus isolates (HBV) among the Novosibirsk region inhabitants (n=2000), native population of the Alarsk District of the Irkutsk Region (n=487) and Shuryshkarsk Township of the Yamalo-Nenets Autonomous District (n=657)....

Full description

Bibliographic Details
Published in:Problems of Particularly Dangerous Infections
Main Authors: G. V. Kochneva, V. A. Manuylov, I. G. Netesova, E. V. Chub, R. B. Bayandin, G. F. Sivolobova, A. A. Grazhdantseva, S. V. Netesov, Г. В. Кочнева, В. А. Мануйлов, И. Г. Нетесова, Е. В. Чуб, Р. Б. Баяндин, Г. Ф. Сиволобова, А. А. Гражданцева, С. В. Нетесов
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:Russian
Published: Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe” 2011
Subjects:
Online Access:https://journal.microbe.ru/jour/article/view/675
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-3(109)-31-35
id ftjppdi:oai:oai.microbe.elpub.ru:article/675
record_format openpolar
institution Open Polar
collection Problems of Particularly Dangerous Infections
op_collection_id ftjppdi
language Russian
topic Siberia
sub-genotype
subtype
HBsAg
hepatitis B virus
spellingShingle Siberia
sub-genotype
subtype
HBsAg
hepatitis B virus
G. V. Kochneva
V. A. Manuylov
I. G. Netesova
E. V. Chub
R. B. Bayandin
G. F. Sivolobova
A. A. Grazhdantseva
S. V. Netesov
Г. В. Кочнева
В. А. Мануйлов
И. Г. Нетесова
Е. В. Чуб
Р. Б. Баяндин
Г. Ф. Сиволобова
А. А. Гражданцева
С. В. Нетесов
Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia
topic_facet Siberia
sub-genotype
subtype
HBsAg
hepatitis B virus
description Identified are the occurrence, serotypic and genotypic variations of Hepatitis B virus isolates (HBV) among the Novosibirsk region inhabitants (n=2000), native population of the Alarsk District of the Irkutsk Region (n=487) and Shuryshkarsk Township of the Yamalo-Nenets Autonomous District (n=657). Occurrence rate of hepatitis В surface antigen (HBsAg) among different groups of the Novosibirsk Region population varied within the limits of 3,6-35,0 %. It was 8,2 % in Alarsk District, and 3,2 % in Shuryshkarsk Township. HBV isolates of D genotype (92-97 %) prevail among the population of Siberia; few are the cases of A (1,7 %) and C (1,2-8 %) genotypes. The identified varying occurrence of HBV sub-genotypes and HBsAg subtypes in two aboriginal groups of Siberia (D3 sub-genotype and ayw2 subtype - in the Alarsk District, D2 and ayw3 - in Shuryshkarsk Township) suggests the existence of, at least, two isolated HBV virus populations, circulating among different groups of Siberia native population . Определена встречаемость, серотипическое и генотипическое разнообразие изолятов вируса гепатита В (ВГВ) в Новосибирской области (n=2000), среди представителей коренного населения Аларского района Иркутской области (n=487) и Шурышкарского района (Ямало-Ненецкий АО) (n=657). Частота выявления HBsAg среди представителей разных групп населения Новосибирской области варьировала в пределах 3,6-35,0 %, в Аларском районе составила 8,2 %, в Шурышкарском - 3,2 %. У населения Сибири преобладают изоляты генотипа D ВГВ (92-97 %), в небольших количествах встречаются генотипы А (1,7 %) и С (1,2-8 %). Выявленная различная встречаемость субгенотипов ВГВ и субтипов HBsAg в двух группах аборигенов Сибири (в Аларском районе - субгенотип D3 и субтип ayw2, в Шурышкарском районе - D2 и ayw3) позволяет предположить существование, по крайней мере, двух обособленных вирусных популяций ВГВ, циркулирующих среди разных групп коренного населения Сибири.
format Article in Journal/Newspaper
author G. V. Kochneva
V. A. Manuylov
I. G. Netesova
E. V. Chub
R. B. Bayandin
G. F. Sivolobova
A. A. Grazhdantseva
S. V. Netesov
Г. В. Кочнева
В. А. Мануйлов
И. Г. Нетесова
Е. В. Чуб
Р. Б. Баяндин
Г. Ф. Сиволобова
А. А. Гражданцева
С. В. Нетесов
author_facet G. V. Kochneva
V. A. Manuylov
I. G. Netesova
E. V. Chub
R. B. Bayandin
G. F. Sivolobova
A. A. Grazhdantseva
S. V. Netesov
Г. В. Кочнева
В. А. Мануйлов
И. Г. Нетесова
Е. В. Чуб
Р. Б. Баяндин
Г. Ф. Сиволобова
А. А. Гражданцева
С. В. Нетесов
author_sort G. V. Kochneva
title Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia
title_short Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia
title_full Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia
title_fullStr Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia
title_full_unstemmed Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia
title_sort genotypes and subtypes of hepatitis b virus isolates in the territory of siberia
publisher Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe”
publishDate 2011
url https://journal.microbe.ru/jour/article/view/675
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-3(109)-31-35
genre nenets
Yamalo Nenets
Ненец*
Siberia
genre_facet nenets
Yamalo Nenets
Ненец*
Siberia
op_source Problems of Particularly Dangerous Infections; № 3(109); 31-35
Проблемы особо опасных инфекций; № 3(109); 31-35
2658-719X
0370-1069
10.21055/0370-1069-2011-3(109)
op_relation https://journal.microbe.ru/jour/article/view/675/632
Баженов А.И., Коноплева М. В., Фельдшерова А.А. и др. Оценка чувствительности коммерческих тест-систем для иммунодетекции HBsAg по их способности выявлять HBsAg-мутанты вируса гепатита B. Журн. микробиол., эпидемиол и иммунобиол. 2008; 3:48-53.
Баяндин Р.Б., Шустов А.В., Кочнева Г.В. и др. Генотипическое разнообразие изолятов и факторы риска инфекции вирусом гепатита В у отдельных групп населения Новосибирской области. Инф. бол. 2004; 2:39-44.
Мануйлов В.А., Нетесова И.Г., Осипова Л.П. и др. Генетическая вариабельность изолятов вируса гепатита В у населения Шурышкарского района Ямало-Ненецкого Автономного Округа. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2005; 4:30-4.
Arauz-Ruiz P., Norder H., Robertson B.H., Magnius L.O. Genotype H: a new Amerindian genotype of hepatitis B virus revealed in Central America. J. Gen. Virol. 2002; 83:2059-73.
Banerjee A., Datta S., Chandra P. K. et al. Distribution of hepatitis B virus genotypes: phylogenetic analysis and virological characteristics of genotype C circulating among HBV carriers in Kolkata, Eastern India. World J. Gastroenterol. 2006; 12(37):5964-71.
Kimbi G.C., Kramvis A., Kew M.C. Distinctive sequence characteristics of subgenotype A1 isolates of hepatitis B virus from South Africa. J. Gen. Virol. 2004; 85:1211-20.
Margolis H.S., Alter M.J., Hadler S.C. Hepatitis B: evolving epidemiology and implications for control. Semin. Liver. Dis. 1991; 11:84-92.
Netesova I.G., Swenson P.D., Osipova L.P. et al. Determination of HBsAg subtypes in Western Siberian part of Russia. J. Med. Virol. 2003; 71:183-7.
Norder H., Courouce A.M., Magnius L.O. Molecular basis of hepatitis B virus serotype variations within the four major subtypes. J. Gen. Virol. 1992; 73:3141-5.
Norder H., Hammas B., Losfdahl S. et al. Comparison of the amino acid sequences of nine different serotypes of hepatitis B surface antigen and genomic classification of the corresponding hepatitis B virus strains. J. Gen. Virol. 1992; 73:1201-8.
Stuyver L., De Gendt S., Van Geyt C. et al. A new genotype of hepatitis B virus: complete genome and phylogenetic relatedness. J. Gen. Virol. 2000; 81:67-74.
Tallo T., Norder H., Tefanova V. et al. Hepatitis B virus genotype D strains from Estonia share sequence similarity with strains from Siberia and may specify ayw4. J. Med. Virol. 2004; 74:221-7.
https://journal.microbe.ru/jour/article/view/675
doi:10.21055/0370-1069-2011-3(109)-31-35
op_rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
op_doi https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-3(109)-31-3510.21055/0370-1069-2011-3(109
container_title Problems of Particularly Dangerous Infections
container_issue 3(109)
container_start_page 31
op_container_end_page 35
_version_ 1809921954436612096
spelling ftjppdi:oai:oai.microbe.elpub.ru:article/675 2024-09-09T19:52:40+00:00 Genotypes and Subtypes of Hepatitis B Virus Isolates in the Territory of Siberia Генотипы и субтипы изолятов вируса гепатита В на территории Сибири G. V. Kochneva V. A. Manuylov I. G. Netesova E. V. Chub R. B. Bayandin G. F. Sivolobova A. A. Grazhdantseva S. V. Netesov Г. В. Кочнева В. А. Мануйлов И. Г. Нетесова Е. В. Чуб Р. Б. Баяндин Г. Ф. Сиволобова А. А. Гражданцева С. В. Нетесов 2011-06-20 application/pdf https://journal.microbe.ru/jour/article/view/675 https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-3(109)-31-35 rus rus Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe” https://journal.microbe.ru/jour/article/view/675/632 Баженов А.И., Коноплева М. В., Фельдшерова А.А. и др. Оценка чувствительности коммерческих тест-систем для иммунодетекции HBsAg по их способности выявлять HBsAg-мутанты вируса гепатита B. Журн. микробиол., эпидемиол и иммунобиол. 2008; 3:48-53. Баяндин Р.Б., Шустов А.В., Кочнева Г.В. и др. Генотипическое разнообразие изолятов и факторы риска инфекции вирусом гепатита В у отдельных групп населения Новосибирской области. Инф. бол. 2004; 2:39-44. Мануйлов В.А., Нетесова И.Г., Осипова Л.П. и др. Генетическая вариабельность изолятов вируса гепатита В у населения Шурышкарского района Ямало-Ненецкого Автономного Округа. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2005; 4:30-4. Arauz-Ruiz P., Norder H., Robertson B.H., Magnius L.O. Genotype H: a new Amerindian genotype of hepatitis B virus revealed in Central America. J. Gen. Virol. 2002; 83:2059-73. Banerjee A., Datta S., Chandra P. K. et al. Distribution of hepatitis B virus genotypes: phylogenetic analysis and virological characteristics of genotype C circulating among HBV carriers in Kolkata, Eastern India. World J. Gastroenterol. 2006; 12(37):5964-71. Kimbi G.C., Kramvis A., Kew M.C. Distinctive sequence characteristics of subgenotype A1 isolates of hepatitis B virus from South Africa. J. Gen. Virol. 2004; 85:1211-20. Margolis H.S., Alter M.J., Hadler S.C. Hepatitis B: evolving epidemiology and implications for control. Semin. Liver. Dis. 1991; 11:84-92. Netesova I.G., Swenson P.D., Osipova L.P. et al. Determination of HBsAg subtypes in Western Siberian part of Russia. J. Med. Virol. 2003; 71:183-7. Norder H., Courouce A.M., Magnius L.O. Molecular basis of hepatitis B virus serotype variations within the four major subtypes. J. Gen. Virol. 1992; 73:3141-5. Norder H., Hammas B., Losfdahl S. et al. Comparison of the amino acid sequences of nine different serotypes of hepatitis B surface antigen and genomic classification of the corresponding hepatitis B virus strains. J. Gen. Virol. 1992; 73:1201-8. Stuyver L., De Gendt S., Van Geyt C. et al. A new genotype of hepatitis B virus: complete genome and phylogenetic relatedness. J. Gen. Virol. 2000; 81:67-74. Tallo T., Norder H., Tefanova V. et al. Hepatitis B virus genotype D strains from Estonia share sequence similarity with strains from Siberia and may specify ayw4. J. Med. Virol. 2004; 74:221-7. https://journal.microbe.ru/jour/article/view/675 doi:10.21055/0370-1069-2011-3(109)-31-35 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). Problems of Particularly Dangerous Infections; № 3(109); 31-35 Проблемы особо опасных инфекций; № 3(109); 31-35 2658-719X 0370-1069 10.21055/0370-1069-2011-3(109) Siberia sub-genotype subtype HBsAg hepatitis B virus info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2011 ftjppdi https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-3(109)-31-3510.21055/0370-1069-2011-3(109 2024-06-20T03:20:52Z Identified are the occurrence, serotypic and genotypic variations of Hepatitis B virus isolates (HBV) among the Novosibirsk region inhabitants (n=2000), native population of the Alarsk District of the Irkutsk Region (n=487) and Shuryshkarsk Township of the Yamalo-Nenets Autonomous District (n=657). Occurrence rate of hepatitis В surface antigen (HBsAg) among different groups of the Novosibirsk Region population varied within the limits of 3,6-35,0 %. It was 8,2 % in Alarsk District, and 3,2 % in Shuryshkarsk Township. HBV isolates of D genotype (92-97 %) prevail among the population of Siberia; few are the cases of A (1,7 %) and C (1,2-8 %) genotypes. The identified varying occurrence of HBV sub-genotypes and HBsAg subtypes in two aboriginal groups of Siberia (D3 sub-genotype and ayw2 subtype - in the Alarsk District, D2 and ayw3 - in Shuryshkarsk Township) suggests the existence of, at least, two isolated HBV virus populations, circulating among different groups of Siberia native population . Определена встречаемость, серотипическое и генотипическое разнообразие изолятов вируса гепатита В (ВГВ) в Новосибирской области (n=2000), среди представителей коренного населения Аларского района Иркутской области (n=487) и Шурышкарского района (Ямало-Ненецкий АО) (n=657). Частота выявления HBsAg среди представителей разных групп населения Новосибирской области варьировала в пределах 3,6-35,0 %, в Аларском районе составила 8,2 %, в Шурышкарском - 3,2 %. У населения Сибири преобладают изоляты генотипа D ВГВ (92-97 %), в небольших количествах встречаются генотипы А (1,7 %) и С (1,2-8 %). Выявленная различная встречаемость субгенотипов ВГВ и субтипов HBsAg в двух группах аборигенов Сибири (в Аларском районе - субгенотип D3 и субтип ayw2, в Шурышкарском районе - D2 и ayw3) позволяет предположить существование, по крайней мере, двух обособленных вирусных популяций ВГВ, циркулирующих среди разных групп коренного населения Сибири. Article in Journal/Newspaper nenets Yamalo Nenets Ненец* Siberia Problems of Particularly Dangerous Infections Problems of Particularly Dangerous Infections 3(109) 31 35