Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019

This review describes the current situation on highly pathogenic avian influenza virus in 2019 and predicts the possible further spread of avian influenza in Russia. In 2019 outbreaks were reported among wild birds and poultry, as well as human infections with influenza viruses of the subtypes H5Nx,...

Full description

Bibliographic Details
Published in:Ice and Snow
Main Authors: V. Marchenko Yu., N. Goncharova I., Thi Tran Nhai, Khac Trinh Sau, Ngoc Nguyen Quyen, E. Gavrilova V., R. Maksyutov A., A. Ryzhikov B., В. Марченко Ю., Н. Гончарова И., Е. Гаврилова В., Р. Максютов А., А. Рыжиков Б.
Other Authors: Исследование проводилось в рамках выполнения государственного задания гз-4/16. Филогенетический анализ проведен в рамках выполнения распоряжения правительства Российской Федерации от 13.07.2019 г. № 1536-р.
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:Russian
Published: Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe” 2020
Subjects:
Avian influenza virus
surveillance
outbreaks
H5N8
H14N7
H13Nx
Russia
вирус гриппа птиц
мониторинг
вспышки
Россия
Kamchatka
Online Access:https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1315
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-2-31-37
id ftjppdi:oai:oai.microbe.elpub.ru:article/1315
record_format openpolar
institution Open Polar
collection Problems of Particularly Dangerous Infections (E-Journal)
op_collection_id ftjppdi
language Russian
topic Avian influenza virus
surveillance
outbreaks
H5N8
H14N7
H13Nx
Russia
вирус гриппа птиц
мониторинг
вспышки
Россия
spellingShingle Avian influenza virus
surveillance
outbreaks
H5N8
H14N7
H13Nx
Russia
вирус гриппа птиц
мониторинг
вспышки
Россия
V. Marchenko Yu.
N. Goncharova I.
Thi Tran Nhai
Khac Trinh Sau
Ngoc Nguyen Quyen
E. Gavrilova V.
R. Maksyutov A.
A. Ryzhikov B.
В. Марченко Ю.
Н. Гончарова И.
Е. Гаврилова В.
Р. Максютов А.
А. Рыжиков Б.
Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019
topic_facet Avian influenza virus
surveillance
outbreaks
H5N8
H14N7
H13Nx
Russia
вирус гриппа птиц
мониторинг
вспышки
Россия
description This review describes the current situation on highly pathogenic avian influenza virus in 2019 and predicts the possible further spread of avian influenza in Russia. In 2019 outbreaks were reported among wild birds and poultry, as well as human infections with influenza viruses of the subtypes H5Nx, H7N9 and H9N2 in several countries. In 2019, only two outbreaks of highly pathogenic avian influenza H5N8 in Russia occurred. Both outbreaks were recorded in January at poultry farm in the Rostov Region. In addition, in May 2019 avian influenza virus of H14N7 subtype was isolated from a wild bird during the avian influenza virus surveillance in Tomsk Region. In June 2019, a strain of H13N2 subtype was isolated in the territory of Kamchatka Region, then, in August 2019, an influenza virus of H13N6 subtype was isolated in the Saratov Region. It was revealed that some strains of avian influenza virus isolated in Russia have a high degree of identity with strains circulating in South-East Asia. This was shown by the phylogenetic analysis of A/ H5Nx influenza viruses previously isolated in the Saratov Region and the Socialist Republic of Vietnam during the avian influenza virus surveillance. Thus, it was demonstrated again that the territory of Russia plays a key geographical role in the global spread of avian influenza virus. В данной статье рассмотрена современная ситуация по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в 2019 г. и сделан прогноз возможного дальнейшего распространения вирусов на территории России. В 2019 г. в мире отмечена циркуляция различных вариантов вируса, имеющих важное эпизоотологическое и эпидемиологическое значение. Зарегистрированы вспышки среди диких и домашних птиц, а также случаи заражения человека вирусами гриппа подтипов A/H5Nx, A/H7N9 и A/H9N2. В России в 2019 г. зарегистрировано только две вспышки, вызванные высокопатогенным вариантом вируса гриппа A/H5N8. Обе вспышки зафиксированы в первой и второй половине января на птицефабрике в Ростовской области. Помимо этого, в ходе мониторинга вируса гриппа птиц на территории Томской области в мае 2019 г. от дикой птицы выделен штамм вируса гриппа A/H14N7. В июне на территории Камчатского края выделен штамм подтипа A/H13N2, затем в августе 2019 г. вирус гриппа подтипа A/H13N6 выделен на территории Саратовской области. Выявлено, что некоторые штаммы вируса гриппа, выделяемые в России, имеют высокую степень идентичности со штаммами, циркулирующими в Юго-Восточной Азии. Это показано на примере филогенетического анализа вирусов гриппа A/H5Nx, выделенных ранее на территории Саратовской области и Социалистической Республики Вьетнам. Таким образом, в очередной раз доказано, что территория России играет важную географическую роль в глобальном распространении вируса гриппа птиц.
author2 Исследование проводилось в рамках выполнения государственного задания гз-4/16. Филогенетический анализ проведен в рамках выполнения распоряжения правительства Российской Федерации от 13.07.2019 г. № 1536-р.
format Article in Journal/Newspaper
author V. Marchenko Yu.
N. Goncharova I.
Thi Tran Nhai
Khac Trinh Sau
Ngoc Nguyen Quyen
E. Gavrilova V.
R. Maksyutov A.
A. Ryzhikov B.
В. Марченко Ю.
Н. Гончарова И.
Е. Гаврилова В.
Р. Максютов А.
А. Рыжиков Б.
author_facet V. Marchenko Yu.
N. Goncharova I.
Thi Tran Nhai
Khac Trinh Sau
Ngoc Nguyen Quyen
E. Gavrilova V.
R. Maksyutov A.
A. Ryzhikov B.
В. Марченко Ю.
Н. Гончарова И.
Е. Гаврилова В.
Р. Максютов А.
А. Рыжиков Б.
author_sort V. Marchenko Yu.
title Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019
title_short Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019
title_full Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019
title_fullStr Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019
title_full_unstemmed Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019
title_sort overview of the epizootiological situation on highly pathogenic avian influenza virus in russia in 2019
publisher Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe”
publishDate 2020
url https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1315
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-2-31-37
genre Kamchatka
genre_facet Kamchatka
op_source Problems of Particularly Dangerous Infections; № 2 (2020); 31-37
Проблемы особо опасных инфекций; № 2 (2020); 31-37
2658-719X
0370-1069
10.21055/0370-1069-2020-2
op_relation https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1315/1108
Shaw M.L., Palese P. Orthomyxoviridae. In: Knipe D.M., Howley P.M., editors. Fields Virology. 6th ed. Philadelphia: Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins; 2013. P. 1151–85.
Manrubia S.C., Escarmis C., Domingo E., Lazaro E. High mutation rates, bottlenecks, and robustness of RNA viral quasispecies. Gene. 2005; 347:273–82.
Turner P.E. Searching for the advantages of virus sex. Orig. Life Evol. Biosph. 2003; 33:95–108. DOI:10.1023/A:1023973015054.
Kawaoka Y., Chambers T.M., Sladen W.L., Webster R.G. Is the gene pool of influenza viruses in shorebirds and gulls different from that in wild ducks? Virology. 1988; 163(1):247–50.
Slemons R.D., Johnson D.C., Osborn J.S., Hayes F. Type-A influenza viruses isolated from wild free-flying ducks in California. Avian Diseases. 1974; 18(1):119–24. PMID: 4205344.
Suarez D.L. Evolution of avian influenza viruses. Vet. Microbiol. 2000; 74(1–2):15–27. DOI:10.1016/s0378-1135(00)00161-9.
Tong S., Li Y., Rivailler P., Conrardy C., Castillo D.A.A., Chen L.M., Recuenco S., Ellison J.A., Davis C.T., York I.A., Turmelle A.S., Moran D., Rogers S., Shi M., Tao Y., Weil M.R., Tang K., Rowe L.A., Sammons S., Xu X., Frace M., Lindblade K.A., Cox N.J., Anderson L.J., Rupprecht C.E., Donis R.O. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2012; 109(11):4269–74. DOI:10.1073/pnas.1116200109.
Tong S., Zhu X., Li Y., Shi M., Zhang J., Bourgeois M., Yang H., Chen X., Recuenco S., Gomez J., Chen L.-M., Johnson A., Tao Y., Dreyfus C., Yu W., McBride R., Carney P.J., Gilbert A.T., Chang J., Guo Z., Davis C.T., Paulson J.C., Stevens J., Rupprecht C.E., Holmes E.C., Wilson I.A., Donis R.O. New World bats harbor diverse influenza A viruses. PLoS Pathog. 2013; 9:e1003657. DOI:10.1371/journal.ppat.1003657.
Webster R.G., Bean W.J., Gorman O.T., Chambers T.M., Kawaoka Y. Evolution and ecology of influenza A viruses. Microbiol. Rev. 1992; 56(1):152–79. PMID: 1579108. PMCID: PMC372859.
Olsen B., Munster V.J., Wallensten A., Waldenstrцm J., Osterhaus A.D.M.E., Fouchier R.A.M. Global patterns of influenza A virus in wild birds. Science. 2006; 312(5772):384–8. DOI:10.1126/science.1122438.
Easterday B.C., Trainer D.O., Tůmová B., Pereira H.G. Evidence of infection with influenza viruses in migratory waterfowl. Nature. 1968; 219(5153):523–4. DOI:10.1038/219523a0.
Kuiken T. Is low pathogenic avian influenza virus virulent for wild waterbirds? Proc. Biol. Sci. 2013; 280(1763):20130990. DOI:10.1098/rspb.2013.0990.
Jourdain E., Gunnarsson G., Wahlgren J., Latorre-Margalef N., Brцjer C., Sahlin S., Svensson L., Waldenstrцm J., Lundkvist A., Olsen B. Influenza virus in a natural host, the mallard: experimental infection data. PLoS ONE. 2010; 5(1):e8935. DOI:10.1371/journal.pone.0008935.
Runstadler J., Hill N., Hussein I.T.M., Puryear W., Keogh M. Connecting the study of wild influenza with the potential for pandemic disease. Infect. Genet. Evol. 2013; 17:162–87. DOI:10.1016/j.meegid.2013.02.020.
Lam T.T., Ip H.S., Ghedin E., Wentworth D.E., Halpin R.A., Stockwell T.B., Spiro D.J., Dusek R.J., Bortner J.B., Hoskins J., Bales B.D., Yparraguirre D.R., Holmes E.C. Migratory flyway and geographical distance are barriers to the gene flow of influenza virus among North American birds. Ecol. Lett. 2012; 15(1):24–33. DOI:10.1111/j.1461-0248.2011.01703.x.
Bahl J., Vijaykrishna D., Holmes E.C., Smith G.J.D., Guan Y. Gene flow and competitive exclusion of avian influenza A virus in natural reservoir hosts. Virology. 2009; 390(2):289–97. DOI:10.1016/j.virol.2009.05.002.
Gonzбlez-Reiche A.S., Morales-Betoulle M.E., Alvarez D., Betoulle J.L., Mьller M.L., Sosa S.M., Perez D.R. Influenza A viruses from wild birds in Guatemala belong to the North American lineage. PLoS ONE. 2012; 7(3):e32873. DOI:10.1371/journal.pone.0032873.
Bahl J., Pham T.T., Hill N.J., Hussein I.T.M., Ma E.J., Easterday B.C., Halpin R.A., Stockwell T.B., Wentworth D.E., Kayali G., Krauss S., Schultz-Cherry S., Webster R.G., Webby R.J., Swartz M.D., Smith G.J.D., Runstadler J.A. Ecosystem interactions underlie the spread of avian influenza A viruses with pandemic potential. PLoS Pathog. 2016; 12(5):e1005620. DOI:10.1371/journal.ppat.1005620.
Chen H., Smith G.J.D., Li K.S., Wang J., Fan X.H., Rayner J.M., Vijaykrishna D., Zhang J.X., Zhang L.J., Guo C.T., Cheung C.L., Xu K.M., Duan L., Huang K., Qin K., Leung Y.H.C., Wu W.L., Lu H.R., Chen Y., Xia N.S., Naipospos T.S.P., Yuen K.Y., Hassan S.S., Bahri S., Nguyen T.D., Webster R.G., Peiris J.S.M., Guan Y. Establishment of multiple sublineages of H5N1 influenza virus in Asia: implications for pandemic control. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006; 103(8):2845–50. DOI:10.1073/pnas.0511120103.
Gauthier-Clerc M., Lebarbenchon C., Thomas F. Recent expansion of highly pathogenic avian influenza H5N1: a critical review. Ibis. 2007; 149(2):202–14. DOI:10.1111/j.1474-919X.2007.00699.x.
Lu L., Leigh Brown A.J., Lycett S.J. Quantifying predictors for the spatial diffusion of avian influenza virus in China. BMC Evol. Biol. 2017; 17(1):16. DOI:10.1186/s12862-016-0845-3.
Kilpatrick A.M., Chmura A.A., Gibbons D.W., Fleischer R.C., Marra P.P., Daszak P. Predicting the global spread of H5N1 avian influenza. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006; 103(51):19368–73. DOI:10.1073/pnas.0609227103.
World Health Organization (WHO). Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and candidate vaccine viruses developed for potential use in human vaccines. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/201909_zoonotic_vaccinevirusupdate.pdf?ua=1.
World Health Organization (WHO). Influenza at the human-animal interface Summary and assessment, 10 April to 10 May 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/Influenza_Summary_IRA_HA_interface_10_05_2019.pdf.
World organization for animal health (OIE). Update on highly pathogenic avian influenza in animals (type H5 and H7), 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2019/.
Molini U.,Aikukutu G., Roux J.P., Kemper J., Ntahonshikira C., Marruchella G., Khaiseb S., Cattoli G., Dundon W.G. Avian Influenza H5N8 Outbreak in African Penguins (Spheniscus demersus), Namibia, 2019. J. Wildl. Dis. 2020; 56(1):214–8. DOI:10.7589/2019-03-067.
European Food Safety Authority, European Centre for Disease Prevention and Control, European Reference Laboratory for Avian Influenza, Adlhoch C., Fusaro A., Kuiken T., Smietanka K., Staubach C., Guajardo M., Baldinelli F. Avian influenza overview August – November 2019. EFSA Journal. 2019; 17(12):e05988. DOI:10.2903/j.efsa.2019.5988.
European Food Safety Authority, European Centre for Disease Prevention and Control, European Reference Laboratory for Avian Influenza, Adlhoch C., Brouwer A., Kuiken T., Miteva A., Mulatti P., Smietanka K., Staubach C., Gogin A., Guajardo M., Baldinelli F. Avian influenza overview November 2018 – February 2019. EFSA Journal. 2019; 17(3):e5664. DOI:10.2903/j.efsa.2019.5664.
World Health Organization (WHO). Cumulative number of confirmed human cases of avian influenza A(H5N1) reported to WHO. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/2020_01_20_tableH5N1.pdf?ua=1.
World Health Organization (WHO), 2019. Influenza at the human-animal interface Summary and assessment, 13 February to 9 April 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/influenza_Summary_IRA_HA_interface_09_04_2019.pdf.
World Health Organization (WHO), 2019. Avian Influenza Weekly Update Number 713. WHO, Geneva. 3 pp. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/279855/AI-20191101.pdf?sequence=43&isAllowed=y.
Qiu Y., Sun R., Hou G., Yu X., Li Y., Li J., Zhang Q., Zou F., Liu H., Jiang W. Novel reassortant H7N2 originating from the H7N9 highly pathogenic avian influenza viruses in China, 2019. J. Infect. 2019; 79(5):462–70. DOI:10.1016/j.jinf.2019.08.016.
Sun H., Lin J., Liu Z., Yu Y., Wu M., Li S., Liu Y., Feng Y., Wu Y., Li M., Jiao P., Luo K., Liao M. Genetic, Molecular, and Pathogenic Characterization of the H9N2 Avian Influenza Viruses Currently Circulating in South China. Viruses. 2019; 11(11):1040. DOI:10.3390/v11111040.
Yu Z., Cheng K., Gao Y. Poultry Infection with Influenza Viruses of Wild Bird Origin, China, 2016. Emerg. Infect. Dis. 2018; 24(7):1375–7. DOI:10.3201/eid2407.171220.
Lycett S.J., Duchatel F., Digard P. A brief history of bird flu. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2019; 374(1775):20180257. DOI:10.1098/rstb.2018.0257.
World organization for animal health (OIE). Update on highly pathogenic avian influenza in animals (type H5 and H7), 2020. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2020/.
https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1315
doi:10.21055/0370-1069-2020-2-31-37
op_rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
op_rightsnorm CC-BY
op_doi https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-2-31-37
https://doi.org/10.1023/A:1023973015054
https://doi.org/10.1016/s0378-1135(00)00161-9
https://doi.org/10.1073/pnas.1116200109
https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003657
https://doi.org/10.1126/sc
container_title Ice and Snow
container_volume 52
container_issue 2
container_start_page 59
_version_ 1766051826346491904
spelling ftjppdi:oai:oai.microbe.elpub.ru:article/1315 2023-05-15T16:59:32+02:00 Overview of the Epizootiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2019 Обзор эпизоотологической ситуации по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в России в 2019 г. V. Marchenko Yu. N. Goncharova I. Thi Tran Nhai Khac Trinh Sau Ngoc Nguyen Quyen E. Gavrilova V. R. Maksyutov A. A. Ryzhikov B. В. Марченко Ю. Н. Гончарова И. Е. Гаврилова В. Р. Максютов А. А. Рыжиков Б. Исследование проводилось в рамках выполнения государственного задания гз-4/16. Филогенетический анализ проведен в рамках выполнения распоряжения правительства Российской Федерации от 13.07.2019 г. № 1536-р. 2020-07-11 application/pdf https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1315 https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-2-31-37 rus rus Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe” https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1315/1108 Shaw M.L., Palese P. Orthomyxoviridae. In: Knipe D.M., Howley P.M., editors. Fields Virology. 6th ed. Philadelphia: Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins; 2013. P. 1151–85. Manrubia S.C., Escarmis C., Domingo E., Lazaro E. High mutation rates, bottlenecks, and robustness of RNA viral quasispecies. Gene. 2005; 347:273–82. Turner P.E. Searching for the advantages of virus sex. Orig. Life Evol. Biosph. 2003; 33:95–108. DOI:10.1023/A:1023973015054. Kawaoka Y., Chambers T.M., Sladen W.L., Webster R.G. Is the gene pool of influenza viruses in shorebirds and gulls different from that in wild ducks? Virology. 1988; 163(1):247–50. Slemons R.D., Johnson D.C., Osborn J.S., Hayes F. Type-A influenza viruses isolated from wild free-flying ducks in California. Avian Diseases. 1974; 18(1):119–24. PMID: 4205344. Suarez D.L. Evolution of avian influenza viruses. Vet. Microbiol. 2000; 74(1–2):15–27. DOI:10.1016/s0378-1135(00)00161-9. Tong S., Li Y., Rivailler P., Conrardy C., Castillo D.A.A., Chen L.M., Recuenco S., Ellison J.A., Davis C.T., York I.A., Turmelle A.S., Moran D., Rogers S., Shi M., Tao Y., Weil M.R., Tang K., Rowe L.A., Sammons S., Xu X., Frace M., Lindblade K.A., Cox N.J., Anderson L.J., Rupprecht C.E., Donis R.O. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2012; 109(11):4269–74. DOI:10.1073/pnas.1116200109. Tong S., Zhu X., Li Y., Shi M., Zhang J., Bourgeois M., Yang H., Chen X., Recuenco S., Gomez J., Chen L.-M., Johnson A., Tao Y., Dreyfus C., Yu W., McBride R., Carney P.J., Gilbert A.T., Chang J., Guo Z., Davis C.T., Paulson J.C., Stevens J., Rupprecht C.E., Holmes E.C., Wilson I.A., Donis R.O. New World bats harbor diverse influenza A viruses. PLoS Pathog. 2013; 9:e1003657. DOI:10.1371/journal.ppat.1003657. Webster R.G., Bean W.J., Gorman O.T., Chambers T.M., Kawaoka Y. Evolution and ecology of influenza A viruses. Microbiol. Rev. 1992; 56(1):152–79. PMID: 1579108. PMCID: PMC372859. Olsen B., Munster V.J., Wallensten A., Waldenstrцm J., Osterhaus A.D.M.E., Fouchier R.A.M. Global patterns of influenza A virus in wild birds. Science. 2006; 312(5772):384–8. DOI:10.1126/science.1122438. Easterday B.C., Trainer D.O., Tůmová B., Pereira H.G. Evidence of infection with influenza viruses in migratory waterfowl. Nature. 1968; 219(5153):523–4. DOI:10.1038/219523a0. Kuiken T. Is low pathogenic avian influenza virus virulent for wild waterbirds? Proc. Biol. Sci. 2013; 280(1763):20130990. DOI:10.1098/rspb.2013.0990. Jourdain E., Gunnarsson G., Wahlgren J., Latorre-Margalef N., Brцjer C., Sahlin S., Svensson L., Waldenstrцm J., Lundkvist A., Olsen B. Influenza virus in a natural host, the mallard: experimental infection data. PLoS ONE. 2010; 5(1):e8935. DOI:10.1371/journal.pone.0008935. Runstadler J., Hill N., Hussein I.T.M., Puryear W., Keogh M. Connecting the study of wild influenza with the potential for pandemic disease. Infect. Genet. Evol. 2013; 17:162–87. DOI:10.1016/j.meegid.2013.02.020. Lam T.T., Ip H.S., Ghedin E., Wentworth D.E., Halpin R.A., Stockwell T.B., Spiro D.J., Dusek R.J., Bortner J.B., Hoskins J., Bales B.D., Yparraguirre D.R., Holmes E.C. Migratory flyway and geographical distance are barriers to the gene flow of influenza virus among North American birds. Ecol. Lett. 2012; 15(1):24–33. DOI:10.1111/j.1461-0248.2011.01703.x. Bahl J., Vijaykrishna D., Holmes E.C., Smith G.J.D., Guan Y. Gene flow and competitive exclusion of avian influenza A virus in natural reservoir hosts. Virology. 2009; 390(2):289–97. DOI:10.1016/j.virol.2009.05.002. Gonzбlez-Reiche A.S., Morales-Betoulle M.E., Alvarez D., Betoulle J.L., Mьller M.L., Sosa S.M., Perez D.R. Influenza A viruses from wild birds in Guatemala belong to the North American lineage. PLoS ONE. 2012; 7(3):e32873. DOI:10.1371/journal.pone.0032873. Bahl J., Pham T.T., Hill N.J., Hussein I.T.M., Ma E.J., Easterday B.C., Halpin R.A., Stockwell T.B., Wentworth D.E., Kayali G., Krauss S., Schultz-Cherry S., Webster R.G., Webby R.J., Swartz M.D., Smith G.J.D., Runstadler J.A. Ecosystem interactions underlie the spread of avian influenza A viruses with pandemic potential. PLoS Pathog. 2016; 12(5):e1005620. DOI:10.1371/journal.ppat.1005620. Chen H., Smith G.J.D., Li K.S., Wang J., Fan X.H., Rayner J.M., Vijaykrishna D., Zhang J.X., Zhang L.J., Guo C.T., Cheung C.L., Xu K.M., Duan L., Huang K., Qin K., Leung Y.H.C., Wu W.L., Lu H.R., Chen Y., Xia N.S., Naipospos T.S.P., Yuen K.Y., Hassan S.S., Bahri S., Nguyen T.D., Webster R.G., Peiris J.S.M., Guan Y. Establishment of multiple sublineages of H5N1 influenza virus in Asia: implications for pandemic control. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006; 103(8):2845–50. DOI:10.1073/pnas.0511120103. Gauthier-Clerc M., Lebarbenchon C., Thomas F. Recent expansion of highly pathogenic avian influenza H5N1: a critical review. Ibis. 2007; 149(2):202–14. DOI:10.1111/j.1474-919X.2007.00699.x. Lu L., Leigh Brown A.J., Lycett S.J. Quantifying predictors for the spatial diffusion of avian influenza virus in China. BMC Evol. Biol. 2017; 17(1):16. DOI:10.1186/s12862-016-0845-3. Kilpatrick A.M., Chmura A.A., Gibbons D.W., Fleischer R.C., Marra P.P., Daszak P. Predicting the global spread of H5N1 avian influenza. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006; 103(51):19368–73. DOI:10.1073/pnas.0609227103. World Health Organization (WHO). Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and candidate vaccine viruses developed for potential use in human vaccines. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/201909_zoonotic_vaccinevirusupdate.pdf?ua=1. World Health Organization (WHO). Influenza at the human-animal interface Summary and assessment, 10 April to 10 May 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/Influenza_Summary_IRA_HA_interface_10_05_2019.pdf. World organization for animal health (OIE). Update on highly pathogenic avian influenza in animals (type H5 and H7), 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2019/. Molini U.,Aikukutu G., Roux J.P., Kemper J., Ntahonshikira C., Marruchella G., Khaiseb S., Cattoli G., Dundon W.G. Avian Influenza H5N8 Outbreak in African Penguins (Spheniscus demersus), Namibia, 2019. J. Wildl. Dis. 2020; 56(1):214–8. DOI:10.7589/2019-03-067. European Food Safety Authority, European Centre for Disease Prevention and Control, European Reference Laboratory for Avian Influenza, Adlhoch C., Fusaro A., Kuiken T., Smietanka K., Staubach C., Guajardo M., Baldinelli F. Avian influenza overview August – November 2019. EFSA Journal. 2019; 17(12):e05988. DOI:10.2903/j.efsa.2019.5988. European Food Safety Authority, European Centre for Disease Prevention and Control, European Reference Laboratory for Avian Influenza, Adlhoch C., Brouwer A., Kuiken T., Miteva A., Mulatti P., Smietanka K., Staubach C., Gogin A., Guajardo M., Baldinelli F. Avian influenza overview November 2018 – February 2019. EFSA Journal. 2019; 17(3):e5664. DOI:10.2903/j.efsa.2019.5664. World Health Organization (WHO). Cumulative number of confirmed human cases of avian influenza A(H5N1) reported to WHO. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/2020_01_20_tableH5N1.pdf?ua=1. World Health Organization (WHO), 2019. Influenza at the human-animal interface Summary and assessment, 13 February to 9 April 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/influenza_Summary_IRA_HA_interface_09_04_2019.pdf. World Health Organization (WHO), 2019. Avian Influenza Weekly Update Number 713. WHO, Geneva. 3 pp. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/279855/AI-20191101.pdf?sequence=43&isAllowed=y. Qiu Y., Sun R., Hou G., Yu X., Li Y., Li J., Zhang Q., Zou F., Liu H., Jiang W. Novel reassortant H7N2 originating from the H7N9 highly pathogenic avian influenza viruses in China, 2019. J. Infect. 2019; 79(5):462–70. DOI:10.1016/j.jinf.2019.08.016. Sun H., Lin J., Liu Z., Yu Y., Wu M., Li S., Liu Y., Feng Y., Wu Y., Li M., Jiao P., Luo K., Liao M. Genetic, Molecular, and Pathogenic Characterization of the H9N2 Avian Influenza Viruses Currently Circulating in South China. Viruses. 2019; 11(11):1040. DOI:10.3390/v11111040. Yu Z., Cheng K., Gao Y. Poultry Infection with Influenza Viruses of Wild Bird Origin, China, 2016. Emerg. Infect. Dis. 2018; 24(7):1375–7. DOI:10.3201/eid2407.171220. Lycett S.J., Duchatel F., Digard P. A brief history of bird flu. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2019; 374(1775):20180257. DOI:10.1098/rstb.2018.0257. World organization for animal health (OIE). Update on highly pathogenic avian influenza in animals (type H5 and H7), 2020. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2020/. https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1315 doi:10.21055/0370-1069-2020-2-31-37 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). CC-BY Problems of Particularly Dangerous Infections; № 2 (2020); 31-37 Проблемы особо опасных инфекций; № 2 (2020); 31-37 2658-719X 0370-1069 10.21055/0370-1069-2020-2 Avian influenza virus surveillance outbreaks H5N8 H14N7 H13Nx Russia вирус гриппа птиц мониторинг вспышки Россия info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2020 ftjppdi https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-2-31-37 https://doi.org/10.1023/A:1023973015054 https://doi.org/10.1016/s0378-1135(00)00161-9 https://doi.org/10.1073/pnas.1116200109 https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003657 https://doi.org/10.1126/sc 2020-08-22T19:06:15Z This review describes the current situation on highly pathogenic avian influenza virus in 2019 and predicts the possible further spread of avian influenza in Russia. In 2019 outbreaks were reported among wild birds and poultry, as well as human infections with influenza viruses of the subtypes H5Nx, H7N9 and H9N2 in several countries. In 2019, only two outbreaks of highly pathogenic avian influenza H5N8 in Russia occurred. Both outbreaks were recorded in January at poultry farm in the Rostov Region. In addition, in May 2019 avian influenza virus of H14N7 subtype was isolated from a wild bird during the avian influenza virus surveillance in Tomsk Region. In June 2019, a strain of H13N2 subtype was isolated in the territory of Kamchatka Region, then, in August 2019, an influenza virus of H13N6 subtype was isolated in the Saratov Region. It was revealed that some strains of avian influenza virus isolated in Russia have a high degree of identity with strains circulating in South-East Asia. This was shown by the phylogenetic analysis of A/ H5Nx influenza viruses previously isolated in the Saratov Region and the Socialist Republic of Vietnam during the avian influenza virus surveillance. Thus, it was demonstrated again that the territory of Russia plays a key geographical role in the global spread of avian influenza virus. В данной статье рассмотрена современная ситуация по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в 2019 г. и сделан прогноз возможного дальнейшего распространения вирусов на территории России. В 2019 г. в мире отмечена циркуляция различных вариантов вируса, имеющих важное эпизоотологическое и эпидемиологическое значение. Зарегистрированы вспышки среди диких и домашних птиц, а также случаи заражения человека вирусами гриппа подтипов A/H5Nx, A/H7N9 и A/H9N2. В России в 2019 г. зарегистрировано только две вспышки, вызванные высокопатогенным вариантом вируса гриппа A/H5N8. Обе вспышки зафиксированы в первой и второй половине января на птицефабрике в Ростовской области. Помимо этого, в ходе мониторинга вируса гриппа птиц на территории Томской области в мае 2019 г. от дикой птицы выделен штамм вируса гриппа A/H14N7. В июне на территории Камчатского края выделен штамм подтипа A/H13N2, затем в августе 2019 г. вирус гриппа подтипа A/H13N6 выделен на территории Саратовской области. Выявлено, что некоторые штаммы вируса гриппа, выделяемые в России, имеют высокую степень идентичности со штаммами, циркулирующими в Юго-Восточной Азии. Это показано на примере филогенетического анализа вирусов гриппа A/H5Nx, выделенных ранее на территории Саратовской области и Социалистической Республики Вьетнам. Таким образом, в очередной раз доказано, что территория России играет важную географическую роль в глобальном распространении вируса гриппа птиц. Article in Journal/Newspaper Kamchatka Problems of Particularly Dangerous Infections (E-Journal) Ice and Snow 52 2 59

Similar Items