The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia

Preeclampsia (PE) is one of the most serious hypertensive pregnancy disorders, which etiology and pathogenesis is remained poorly under- stood. Since a key role in the etiopathogenesis of PE is given to the placental tissue, the study of the gene expression variability in the pla- cental tissue and...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: V. N. Serebrova, E. A. Trifonova, A. Yu. Vorozhischeva, V. A. Stepanov, В. Н. Сереброва, Е. А. Трифонова, А. Ю. Ворожищева, В. А. Степанов
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:Russian
Published: Publishing House «Genius Media» LLC 2019
Subjects:
Online Access:https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/623
id ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/623
record_format openpolar
institution Open Polar
collection Medical Genetics
op_collection_id ftjmedgen
language Russian
topic SYDE1 gene
регуляторный однонуклеотидный полиморфный вариант (rSNP)
ген SYDE1
preeclampsia
regulatory single-nucleotide polymorphisms (rSNPs)
spellingShingle SYDE1 gene
регуляторный однонуклеотидный полиморфный вариант (rSNP)
ген SYDE1
preeclampsia
regulatory single-nucleotide polymorphisms (rSNPs)
V. N. Serebrova
E. A. Trifonova
A. Yu. Vorozhischeva
V. A. Stepanov
В. Н. Сереброва
Е. А. Трифонова
А. Ю. Ворожищева
В. А. Степанов
The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia
topic_facet SYDE1 gene
регуляторный однонуклеотидный полиморфный вариант (rSNP)
ген SYDE1
preeclampsia
regulatory single-nucleotide polymorphisms (rSNPs)
description Preeclampsia (PE) is one of the most serious hypertensive pregnancy disorders, which etiology and pathogenesis is remained poorly under- stood. Since a key role in the etiopathogenesis of PE is given to the placental tissue, the study of the gene expression variability in the pla- cental tissue and of the regulatory mechanisms of these changes is a promising approach. The purpose of this research was to characterize of the genetic architecture of PE on the basis of regulatory polymorphic variants (rSNPs) of the new SYDE1 candidate gene, identified for the first time by the results of the transcriptome analysis in placental tissue. In this work, we analyzed the two most significant rSNPs of the SYDE1 gene (rs56153523, rs8109071). The study was conducted in three ethnic groups: Buryats, Russians, Yakuts. We have detected associations of the rSNPs of SYDE1 gene with the development of preeclampsia in ethnic groups Buryat (rs56153523) and Russian (rs56153523, rs8109071). Преэклампсия (ПЭ) - одно из наиболее тяжелых гипертензивных расстройств беременности, этиология и патогенез которого оста- ются на сегодняшний день плохо изученными. Поскольку ключевая роль в этиопатогенезе ПЭ отводится плацентарной ткани, изу- чение вариабельности уровня экспрессии генов в плаценте и механизмов регуляции данных изменений являются перспективными направлениями. Цель исследования - охарактеризовать генетическую архитектуру ПЭ по системе регуляторных однонуклеотидных полиморфизмов (rSNP) нового гена-кандидата SYDE1 , выявленного впервые по результатам анализа транскриптома плацентарной ткани. В работе было изучено два наиболее значимых rSNP гена SYDE1 (rs56153523, rs8109071). Исследование проводилось в трех этнических группах: буряты, русские, якуты. Результаты проведенного исследования демонстрируют ассоциацию rSNP гена SYDE1 с развитием ПЭ в выборках бурятов (rs56153523) и русских (rs56153523, rs8109071).
format Article in Journal/Newspaper
author V. N. Serebrova
E. A. Trifonova
A. Yu. Vorozhischeva
V. A. Stepanov
В. Н. Сереброва
Е. А. Трифонова
А. Ю. Ворожищева
В. А. Степанов
author_facet V. N. Serebrova
E. A. Trifonova
A. Yu. Vorozhischeva
V. A. Stepanov
В. Н. Сереброва
Е. А. Трифонова
А. Ю. Ворожищева
В. А. Степанов
author_sort V. N. Serebrova
title The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia
title_short The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia
title_full The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia
title_fullStr The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia
title_full_unstemmed The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia
title_sort role of syde1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia
publisher Publishing House «Genius Media» LLC
publishDate 2019
url https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/623
genre Yakuts
genre_facet Yakuts
op_source Medical Genetics; Том 18, № 1 (2019); 35-38
Медицинская генетика; Том 18, № 1 (2019); 35-38
2073-7998
op_relation https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/623/399
Адамян Л.В., Артымук Н.В., Башмакова Н.В., и др. Клинические рекомендации «Гипертензивные расстройства во время беременности, в родах и послеродовом периоде. Преэклампсия. Эклампсия». М., 2016. 72 с.
Tannetta D., Sargent I. Placental disease and the maternal syndrome of preeclampsia: missing links? Curr. Hypertens. Rep. 2013;15(6): 590-599.
Boeldt D.S., Bird I.M. Vascular adaptation in pregnancy and endothelial dysfunction in preeclampsia. J. Endocrinol. 2017; 232(1): R27-R44.
Louwen F., Muschol-Steinmetz C., Reinhard J., et al. A lesson for cancer research: placental microarray gene analysis in preeclampsia. Oncotarget 2012; 3(8): 759-773.
Трифонова Е.А., Габидулина Т.В., Ершов Н.И., и др. Характеристика транскриптома плацентарной ткани у женщин с физиологической беременностью и преэклампсией. Acta Naturae 2014; 6(2): 77-90.
Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Матвеева М.Ю., и др. Поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстой кишки, в генах АРС и МLH1. Вавиловский журнал генетики и селекции 2011; 15(4): 644-652.
Jones B.L., Swallow D.M. The impact of cis-acting polymorphisms on the human phenotype. Hugo J. 2011; 5(1-4): 13-23.
Winn V.D., Gormley M., Fisher S.J. The Impact of Preeclampsia on Gene Expression at the Maternal-Fetal Interface. Pregnancy Hypertens. 2011; 1(1): 100-108.
Lo H.F., Tsai C.Y., Chen C.P., et al. Association of dysfunctional synapse defective 1 (SYDE1) with restricted fetal growth - SYDE1 regulates placental cell migration and invasion. J.Pathol. 2017; 241(3): 324-336.
Boyle A.P., Hong E.L., Hariharan M., et al. Annotation of functional variation in personal genomes using RegulomeDB. Genome Res. 2012; 22(9): 1790-1797.
Степанов В.А., Трифонова Е.А. Мультиплексное генотипирование однонуклеотидных полиморфных маркеров методом масс-спектрометрии MALDI-TOF: частоты 56 SNP в генах иммунного ответа в популяциях человека. Молекулярная биология 2013; 47(6): 976-986.
Zhuang B., Luo X., Rao H., et al. Oxidative stress-induced C/EBPβ inhibits β-catenin signaling molecule involving in the pathology of preeclampsia. Placenta 2015; 36(8): 839-46.
Radde J., Löning T., Bamberger A.M. Expression pattern of the CCAAT/enhancer-binding protein C/EBP-beta in gestational trophoblastic disease. Int. J. Gynecol. Pathol. 2004; 23(4): 373-377.
https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/623
10.25557/2073-7998.2019.01.35-38
op_rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
_version_ 1802651066260520960
spelling ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/623 2024-06-23T07:57:26+00:00 The role of SYDE1 gene regulatory sites in development predisposition to preeclampsia Роль регуляторных участков гена SYDE1 в формировании наследственной предрасположенности к преэклампсии V. N. Serebrova E. A. Trifonova A. Yu. Vorozhischeva V. A. Stepanov В. Н. Сереброва Е. А. Трифонова А. Ю. Ворожищева В. А. Степанов 2019-03-20 application/pdf https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/623 rus rus Publishing House «Genius Media» LLC https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/623/399 Адамян Л.В., Артымук Н.В., Башмакова Н.В., и др. Клинические рекомендации «Гипертензивные расстройства во время беременности, в родах и послеродовом периоде. Преэклампсия. Эклампсия». М., 2016. 72 с. Tannetta D., Sargent I. Placental disease and the maternal syndrome of preeclampsia: missing links? Curr. Hypertens. Rep. 2013;15(6): 590-599. Boeldt D.S., Bird I.M. Vascular adaptation in pregnancy and endothelial dysfunction in preeclampsia. J. Endocrinol. 2017; 232(1): R27-R44. Louwen F., Muschol-Steinmetz C., Reinhard J., et al. A lesson for cancer research: placental microarray gene analysis in preeclampsia. Oncotarget 2012; 3(8): 759-773. Трифонова Е.А., Габидулина Т.В., Ершов Н.И., и др. Характеристика транскриптома плацентарной ткани у женщин с физиологической беременностью и преэклампсией. Acta Naturae 2014; 6(2): 77-90. Антонцева Е.В., Брызгалов Л.О., Матвеева М.Ю., и др. Поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстой кишки, в генах АРС и МLH1. Вавиловский журнал генетики и селекции 2011; 15(4): 644-652. Jones B.L., Swallow D.M. The impact of cis-acting polymorphisms on the human phenotype. Hugo J. 2011; 5(1-4): 13-23. Winn V.D., Gormley M., Fisher S.J. The Impact of Preeclampsia on Gene Expression at the Maternal-Fetal Interface. Pregnancy Hypertens. 2011; 1(1): 100-108. Lo H.F., Tsai C.Y., Chen C.P., et al. Association of dysfunctional synapse defective 1 (SYDE1) with restricted fetal growth - SYDE1 regulates placental cell migration and invasion. J.Pathol. 2017; 241(3): 324-336. Boyle A.P., Hong E.L., Hariharan M., et al. Annotation of functional variation in personal genomes using RegulomeDB. Genome Res. 2012; 22(9): 1790-1797. Степанов В.А., Трифонова Е.А. Мультиплексное генотипирование однонуклеотидных полиморфных маркеров методом масс-спектрометрии MALDI-TOF: частоты 56 SNP в генах иммунного ответа в популяциях человека. Молекулярная биология 2013; 47(6): 976-986. Zhuang B., Luo X., Rao H., et al. Oxidative stress-induced C/EBPβ inhibits β-catenin signaling molecule involving in the pathology of preeclampsia. Placenta 2015; 36(8): 839-46. Radde J., Löning T., Bamberger A.M. Expression pattern of the CCAAT/enhancer-binding protein C/EBP-beta in gestational trophoblastic disease. Int. J. Gynecol. Pathol. 2004; 23(4): 373-377. https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/623 10.25557/2073-7998.2019.01.35-38 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). Medical Genetics; Том 18, № 1 (2019); 35-38 Медицинская генетика; Том 18, № 1 (2019); 35-38 2073-7998 SYDE1 gene регуляторный однонуклеотидный полиморфный вариант (rSNP) ген SYDE1 preeclampsia regulatory single-nucleotide polymorphisms (rSNPs) info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2019 ftjmedgen 2024-05-24T03:05:06Z Preeclampsia (PE) is one of the most serious hypertensive pregnancy disorders, which etiology and pathogenesis is remained poorly under- stood. Since a key role in the etiopathogenesis of PE is given to the placental tissue, the study of the gene expression variability in the pla- cental tissue and of the regulatory mechanisms of these changes is a promising approach. The purpose of this research was to characterize of the genetic architecture of PE on the basis of regulatory polymorphic variants (rSNPs) of the new SYDE1 candidate gene, identified for the first time by the results of the transcriptome analysis in placental tissue. In this work, we analyzed the two most significant rSNPs of the SYDE1 gene (rs56153523, rs8109071). The study was conducted in three ethnic groups: Buryats, Russians, Yakuts. We have detected associations of the rSNPs of SYDE1 gene with the development of preeclampsia in ethnic groups Buryat (rs56153523) and Russian (rs56153523, rs8109071). Преэклампсия (ПЭ) - одно из наиболее тяжелых гипертензивных расстройств беременности, этиология и патогенез которого оста- ются на сегодняшний день плохо изученными. Поскольку ключевая роль в этиопатогенезе ПЭ отводится плацентарной ткани, изу- чение вариабельности уровня экспрессии генов в плаценте и механизмов регуляции данных изменений являются перспективными направлениями. Цель исследования - охарактеризовать генетическую архитектуру ПЭ по системе регуляторных однонуклеотидных полиморфизмов (rSNP) нового гена-кандидата SYDE1 , выявленного впервые по результатам анализа транскриптома плацентарной ткани. В работе было изучено два наиболее значимых rSNP гена SYDE1 (rs56153523, rs8109071). Исследование проводилось в трех этнических группах: буряты, русские, якуты. Результаты проведенного исследования демонстрируют ассоциацию rSNP гена SYDE1 с развитием ПЭ в выборках бурятов (rs56153523) и русских (rs56153523, rs8109071). Article in Journal/Newspaper Yakuts Medical Genetics