VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA

Genetic diversity of SNP markers of Interleukin 4 alpha and Interleukin 4 receptor genes was investigated in 4 populations of native Siberian ethnic groups (Buryat, Yakut, Ket and Khant). In the populations under study, except Khants, the close spectrum of allele frequencies and similar level of exp...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: V. Stepanov A., E. Trifonova A., K. Simonova V., A. Cherednichenko A., В. Степанов А., Е. Трифонова А., К. Симонова В., А. Чередниченко А.
Other Authors: Работа частично финансировалась ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техни¬ки» (госконтракт №11.519.11.2036), ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» (соглашение №8042), Российским Фондом фундаментальных исследований (грант №12-04-00595a).
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:Russian
Published: Publishing House «Genius Media» LLC 2015
Subjects:
Online Access:https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/49
https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-4-38-40
id ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/49
record_format openpolar
institution Open Polar
collection Medical Genetics (E-Journal)
op_collection_id ftjmedgen
language Russian
topic genetic diversity
native Siberian populations
interleukins
генетическое разнообразие
коренные народы Сибири
интерлейкины
spellingShingle genetic diversity
native Siberian populations
interleukins
генетическое разнообразие
коренные народы Сибири
интерлейкины
V. Stepanov A.
E. Trifonova A.
K. Simonova V.
A. Cherednichenko A.
В. Степанов А.
Е. Трифонова А.
К. Симонова В.
А. Чередниченко А.
VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA
topic_facet genetic diversity
native Siberian populations
interleukins
генетическое разнообразие
коренные народы Сибири
интерлейкины
description Genetic diversity of SNP markers of Interleukin 4 alpha and Interleukin 4 receptor genes was investigated in 4 populations of native Siberian ethnic groups (Buryat, Yakut, Ket and Khant). In the populations under study, except Khants, the close spectrum of allele frequencies and similar level of expected heterozygosity were revealed and low level of genetic differentiation was found. Исследовано генетическое разнообразие популяций четырёх этнических групп коренного населения Сибири (буряты, якуты, кеты, ханты) по SNP-маркёрам генов интерлейкина 4 и α-цепи рецептора интерлейкина 4. В исследованных популяциях, за исключением хантов, выявлен близкий спектр частот аллелей, сходный уровень ожидаемой гетерозиготности и показана низкая степень генетической дифференциации популяций.
author2 Работа частично финансировалась ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техни¬ки» (госконтракт №11.519.11.2036), ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» (соглашение №8042), Российским Фондом фундаментальных исследований (грант №12-04-00595a).
format Article in Journal/Newspaper
author V. Stepanov A.
E. Trifonova A.
K. Simonova V.
A. Cherednichenko A.
В. Степанов А.
Е. Трифонова А.
К. Симонова В.
А. Чередниченко А.
author_facet V. Stepanov A.
E. Trifonova A.
K. Simonova V.
A. Cherednichenko A.
В. Степанов А.
Е. Трифонова А.
К. Симонова В.
А. Чередниченко А.
author_sort V. Stepanov A.
title VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA
title_short VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA
title_full VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA
title_fullStr VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA
title_full_unstemmed VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA
title_sort variability of interleukin 4 and its receptor genes in native populations of siberia
publisher Publishing House «Genius Media» LLC
publishDate 2015
url https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/49
https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-4-38-40
genre Yakut
Siberia
genre_facet Yakut
Siberia
op_source Medical Genetics; Том 12, № 4 (2013); 38-40
Медицинская генетика; Том 12, № 4 (2013); 38-40
2073-7998
op_relation https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/49/55
Степанов В.А., Канделария П., Кхо С. и др. Деканализация иммунного ответа при расселении современного человека: связь генетического разнообразия в генах иммунной системы с климато-географическими факторами // Медицинская Генетика. — В печати.
Abi-Rached et al. The shaping of modern human immune systems by multiregional admixture with archaic humans // Science. — 2011. — Vol. 334, №6052. — P. 89—94.
Basehore M.J. Howard T.D., Lange L.A. et al. A comprehensive evaluation of IL4 variants in ethnically diverse populations: association of total serum IgE levels and asthma in white subjects // J. Aliergy Clin. Immunol. — 2004. — Vol. 114. — P. 80—87.
Battle N.C., Choudhry S., et al. Ethnicity-specific gene-gene interaction between IL-13 and IL-4Ralpha among African Americans with asthma // Am. J. Respir. Crit. Care. Med. — 2007. — 1. — Vol. 175, №9. — P. 881—887.
Beghe B. et al. Polymorphisms in the interleukin-4 and interleukin-4 receptor alpha chain genes confer susceptibility to asthma and atopy in a Caucasian population // Clin. Exp. Allergy. — 2003. — Vol. 33. — P. 1111—1119.
Granada M., Wilk J.B., Tuzova M. et al. A genome-wide association study of plasma total IgE concentrations in the Framingham Heart Study // J. Allergy Clin. Immunol. — 2012. — Vol. 129. — P. 840—845.
Hancock A.M., Witonsky D.B., Alkorta-Aranburu G. et al. Adaptations to climat-mediated selectivre pressures in humans // PLoS Genetics. — 2011. — Vol. 7, №4. — e1001375. doi:10.1371 /journal.pgen. 1001375
Isidoro-Garcia M., Davila I., Laffond E. et al. Interleukin-4 (IL4) and interleukin-4 receptor (IL4RA) polymorphisms in asthma: a case control study // Clin. And Mol. Aliergy. — 2005. — Vol. 3.
Izuhara K., Shirakawa T. Signal transduction via the interleukin-4 receptor and its corteiation with atopy // Int. J. Mol. Med. 1999. — Vol. 3, №1. — P. 3—10.
Kabesch M., Tzotcheva I., Carr D. et al. A compiete screening of the IL4 gene: novel polymorphisms and their association with asthma and IgE in childhood // J. Aliergy Clin. Immunol. — 2003. — Vol. 112. — P. 893—898.
Li Y., Guo B., Zhang L. et al. Association between C-589T polymorphisms of interleukin-4 gene promoter and asthma: a meta-analysis // Respir. Med. — 2008. — Vol. 102. — P. 984—982.
Migliaccio C., Patuzzo C. et al. No linkage or association of five polymorphisms in the interleukin-4 receptor alpha gene with atopic asthma in Italian families // Eur. J. Immunogenet. — 2003. — Vol. 30, №5. — P. 349—353.
Nieters A., Linseisen J., Becker N. Association of polymorphisms in Th1., Th2 cytokine genes with hayfever and atopy in a subsample of EPIC-Heidelberg // Clin. Exp. Allergy. — 2004. — Vol. 34, №3. — P. 346—353.
Sabeti P.C., Schaffner S.F., Fry B. еt al. Positive natural seiection in the human lineage // Science. — 2006. — Vol. 312. — P. 1614—1620.
Suzuki I., Hizawa N., Yamaguchi E., Kawakami Y. Association between a C+33T polymorphism in the IL-4 promoter region and total serum IgE levels // Clin. Exp. Allergy. — 2000. — Vol. 30. — P. 1746—1749.
Yang H.J. Association between the interleukin-4 gene C-589T and C+33T polymorphisms and asthma risk: a meta-analysis // Arch. Med. — res. 2—13. — Vol. 44. — P. 127—135.
https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/49
doi:10.1234/XXXX-XXXX-2013-4-38-40
op_rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
op_rightsnorm CC-BY
op_doi https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-4-38-40
_version_ 1766235236480319488
spelling ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/49 2023-05-15T18:44:33+02:00 VARIABILITY OF INTERLEUKIN 4 AND ITS RECEPTOR GENES IN NATIVE POPULATIONS OF SIBERIA ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ ГЕНОВ ИНТЕРЛЕЙКИНА 4 И ЕГО РЕЦЕПТОРА В ПОПУЛЯЦИЯХ КОРЕННЫХ НАРОДОВ СИБИРИ V. Stepanov A. E. Trifonova A. K. Simonova V. A. Cherednichenko A. В. Степанов А. Е. Трифонова А. К. Симонова В. А. Чередниченко А. Работа частично финансировалась ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техни¬ки» (госконтракт №11.519.11.2036), ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» (соглашение №8042), Российским Фондом фундаментальных исследований (грант №12-04-00595a). 2015-12-24 application/pdf https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/49 https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-4-38-40 rus rus Publishing House «Genius Media» LLC https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/49/55 Степанов В.А., Канделария П., Кхо С. и др. Деканализация иммунного ответа при расселении современного человека: связь генетического разнообразия в генах иммунной системы с климато-географическими факторами // Медицинская Генетика. — В печати. Abi-Rached et al. The shaping of modern human immune systems by multiregional admixture with archaic humans // Science. — 2011. — Vol. 334, №6052. — P. 89—94. Basehore M.J. Howard T.D., Lange L.A. et al. A comprehensive evaluation of IL4 variants in ethnically diverse populations: association of total serum IgE levels and asthma in white subjects // J. Aliergy Clin. Immunol. — 2004. — Vol. 114. — P. 80—87. Battle N.C., Choudhry S., et al. Ethnicity-specific gene-gene interaction between IL-13 and IL-4Ralpha among African Americans with asthma // Am. J. Respir. Crit. Care. Med. — 2007. — 1. — Vol. 175, №9. — P. 881—887. Beghe B. et al. Polymorphisms in the interleukin-4 and interleukin-4 receptor alpha chain genes confer susceptibility to asthma and atopy in a Caucasian population // Clin. Exp. Allergy. — 2003. — Vol. 33. — P. 1111—1119. Granada M., Wilk J.B., Tuzova M. et al. A genome-wide association study of plasma total IgE concentrations in the Framingham Heart Study // J. Allergy Clin. Immunol. — 2012. — Vol. 129. — P. 840—845. Hancock A.M., Witonsky D.B., Alkorta-Aranburu G. et al. Adaptations to climat-mediated selectivre pressures in humans // PLoS Genetics. — 2011. — Vol. 7, №4. — e1001375. doi:10.1371 /journal.pgen. 1001375 Isidoro-Garcia M., Davila I., Laffond E. et al. Interleukin-4 (IL4) and interleukin-4 receptor (IL4RA) polymorphisms in asthma: a case control study // Clin. And Mol. Aliergy. — 2005. — Vol. 3. Izuhara K., Shirakawa T. Signal transduction via the interleukin-4 receptor and its corteiation with atopy // Int. J. Mol. Med. 1999. — Vol. 3, №1. — P. 3—10. Kabesch M., Tzotcheva I., Carr D. et al. A compiete screening of the IL4 gene: novel polymorphisms and their association with asthma and IgE in childhood // J. Aliergy Clin. Immunol. — 2003. — Vol. 112. — P. 893—898. Li Y., Guo B., Zhang L. et al. Association between C-589T polymorphisms of interleukin-4 gene promoter and asthma: a meta-analysis // Respir. Med. — 2008. — Vol. 102. — P. 984—982. Migliaccio C., Patuzzo C. et al. No linkage or association of five polymorphisms in the interleukin-4 receptor alpha gene with atopic asthma in Italian families // Eur. J. Immunogenet. — 2003. — Vol. 30, №5. — P. 349—353. Nieters A., Linseisen J., Becker N. Association of polymorphisms in Th1., Th2 cytokine genes with hayfever and atopy in a subsample of EPIC-Heidelberg // Clin. Exp. Allergy. — 2004. — Vol. 34, №3. — P. 346—353. Sabeti P.C., Schaffner S.F., Fry B. еt al. Positive natural seiection in the human lineage // Science. — 2006. — Vol. 312. — P. 1614—1620. Suzuki I., Hizawa N., Yamaguchi E., Kawakami Y. Association between a C+33T polymorphism in the IL-4 promoter region and total serum IgE levels // Clin. Exp. Allergy. — 2000. — Vol. 30. — P. 1746—1749. Yang H.J. Association between the interleukin-4 gene C-589T and C+33T polymorphisms and asthma risk: a meta-analysis // Arch. Med. — res. 2—13. — Vol. 44. — P. 127—135. https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/49 doi:10.1234/XXXX-XXXX-2013-4-38-40 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). CC-BY Medical Genetics; Том 12, № 4 (2013); 38-40 Медицинская генетика; Том 12, № 4 (2013); 38-40 2073-7998 genetic diversity native Siberian populations interleukins генетическое разнообразие коренные народы Сибири интерлейкины info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2015 ftjmedgen https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-4-38-40 2022-02-16T19:36:26Z Genetic diversity of SNP markers of Interleukin 4 alpha and Interleukin 4 receptor genes was investigated in 4 populations of native Siberian ethnic groups (Buryat, Yakut, Ket and Khant). In the populations under study, except Khants, the close spectrum of allele frequencies and similar level of expected heterozygosity were revealed and low level of genetic differentiation was found. Исследовано генетическое разнообразие популяций четырёх этнических групп коренного населения Сибири (буряты, якуты, кеты, ханты) по SNP-маркёрам генов интерлейкина 4 и α-цепи рецептора интерлейкина 4. В исследованных популяциях, за исключением хантов, выявлен близкий спектр частот аллелей, сходный уровень ожидаемой гетерозиготности и показана низкая степень генетической дифференциации популяций. Article in Journal/Newspaper Yakut Siberia Medical Genetics (E-Journal)