Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing
Congenital cataracts are a major cause of vision loss in children worldwide. Congenital autosomal recessive cataract is one of the most common orphan diseases in indigenous Yakut population (the Sakha Republic, Eastern Siberia, Russia). To identify the genetic cause of congenital cataract spread in...
Main Authors: | , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , |
---|---|
Format: | Article in Journal/Newspaper |
Language: | Russian |
Published: |
Publishing House «Genius Media» LLC
2017
|
Subjects: | |
Online Access: | https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/197 |
id |
ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/197 |
---|---|
record_format |
openpolar |
institution |
Open Polar |
collection |
Medical Genetics (E-Journal) |
op_collection_id |
ftjmedgen |
language |
Russian |
topic |
врожденная аутосомно-рецессивная катаракта CTRCT18 ген FYCO1 якуты популяционный изолят Якутия Восточная Сибирь congenital autosomal recessive cataract FYCO1 Yakuts population isolate Sakha Republic Eastern Siberia |
spellingShingle |
врожденная аутосомно-рецессивная катаракта CTRCT18 ген FYCO1 якуты популяционный изолят Якутия Восточная Сибирь congenital autosomal recessive cataract FYCO1 Yakuts population isolate Sakha Republic Eastern Siberia N. Barashkov A. F. Konovalov A. A. Solovyev V. F. Teryutin M. V. Pshennikova G. N. Sapojnikova V. L. Vytuzhina S. M. Tomsky I. L. Dzhemileva U. E. Khusnutdinova K. O. Posukh L. S. Fedorova A. Н. Барашков А. Ф. Коновалов А. А. Соловьев В. Ф. Терютин М. В. Пшенникова Г. Н. Сапожникова В. Л. Вытюжина С. М. Томский И. Л. Джемилева У. Э. Хуснутдинова К. О. Посух Л. С. Федорова А. Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing |
topic_facet |
врожденная аутосомно-рецессивная катаракта CTRCT18 ген FYCO1 якуты популяционный изолят Якутия Восточная Сибирь congenital autosomal recessive cataract FYCO1 Yakuts population isolate Sakha Republic Eastern Siberia |
description |
Congenital cataracts are a major cause of vision loss in children worldwide. Congenital autosomal recessive cataract is one of the most common orphan diseases in indigenous Yakut population (the Sakha Republic, Eastern Siberia, Russia). To identify the genetic cause of congenital cataract spread in Yakut population we performed whole exome sequencing on Illumina NextSeq 500 in one Yakut patient from family with three affected siblings, whose parents had preserved vision and revealed novel homozygous transition c.1621C>T (chr3:46009205G>A) in gene FYCO1 (3p21.31) previously known in association with congenital cataract. The c.1621C>T transition leads to premature stop-codon formation (p.Gln541*, NM_024513.3) in exon 8 of the FYCO1 gene. Variant c.1621C>T is not reported in the 1000 Genomes, the ESP6500, and the ExAC projects. Sanger sequencing confirmed the segregation of homozygosity for c.1621C>T with congenital cataract in this Yakut family: all affected siblings were homozygotes for c.1621C>T while their healthy parents were heterozygous for this variant. Subsequent screening c.1621C>T in other patients with congenital cataract allowed us to define the contribution of c.1621C>T in etiology of this disease in Yakutia. In total, 87.5% of the congenital cataract cases in Yakutia were caused by homozygous variant c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene. The highest prevalence of congenital cataract caused by homozygosity for c.1621C>T was registered in the сentral districts of the Sakha Republic (Yakutia). These results suggest that the novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakut population in the Sakha Republic (Yakutia). Врожденная катаракта - основная причина детской слепоты во многих популяциях мира. В Якутии врожденная катаракта является одним из наиболее частых орфанных заболеваний с неустановленной генетической природой. Для поиска молекулярно-генетических причин этого заболевания было проведено полноэкзомное секвенирование (Illumina NextSeq 500) у одного пациента с врожденной катарактой из якутской семьи, в которой, помимо обследуемого, было еще два пораженных сибса, а родители имели сохранное зрение. Полноэкзомный анализ выявил у этого пациента новую гомозиготную транзицию c.1621C>T в 8-м экзоне гена FYCO1 (локус CATC2, CTRCT18, OMIM 610019), ранее известного в ассоциации с врожденной катарактой. Замена c.1621C>T приводит к образованию преждевременного стоп-кодона p.Gln541*, терминирующего трансляцию белка FYCO1 (FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein), выполняющего ключевую транспортную роль при процессах автофагии в клетках хрусталика. В настоящее время сведения о транзиции c.1621C>T отсутствуют в базах данных 1000 Genomes, ESP6500 и ExAC. Секвенирование по Сэнгеру подтвердило сегрегацию гомозиготности по c.1621C>T с врожденной катарактой в якутской семье: все пораженные сибсы были гомозиготами, а их здоровые родители - гетерозиготами по этому варианту. Результаты полноэкзомного секвенирования в обследованной якутской семье и последующий скрининг варианта c.1621C>T у других пациентов с врожденной катарактой в Якутии показали, что, в целом, вклад гомозиготной транзиции с.1621C>T (p.Gln541*) в этиологию врожденной катаракты составил 87,5%, с очагами накопления в центральных районах Якутии. Полученные результаты позволяют предположить, что обнаруженный впервые вариант c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 является основной причиной врожденной аутосомно-рецессивной катаракты (CTRCT18) в Якутии. |
format |
Article in Journal/Newspaper |
author |
N. Barashkov A. F. Konovalov A. A. Solovyev V. F. Teryutin M. V. Pshennikova G. N. Sapojnikova V. L. Vytuzhina S. M. Tomsky I. L. Dzhemileva U. E. Khusnutdinova K. O. Posukh L. S. Fedorova A. Н. Барашков А. Ф. Коновалов А. А. Соловьев В. Ф. Терютин М. В. Пшенникова Г. Н. Сапожникова В. Л. Вытюжина С. М. Томский И. Л. Джемилева У. Э. Хуснутдинова К. О. Посух Л. С. Федорова А. |
author_facet |
N. Barashkov A. F. Konovalov A. A. Solovyev V. F. Teryutin M. V. Pshennikova G. N. Sapojnikova V. L. Vytuzhina S. M. Tomsky I. L. Dzhemileva U. E. Khusnutdinova K. O. Posukh L. S. Fedorova A. Н. Барашков А. Ф. Коновалов А. А. Соловьев В. Ф. Терютин М. В. Пшенникова Г. Н. Сапожникова В. Л. Вытюжина С. М. Томский И. Л. Джемилева У. Э. Хуснутдинова К. О. Посух Л. С. Федорова А. |
author_sort |
N. Barashkov A. |
title |
Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing |
title_short |
Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing |
title_full |
Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing |
title_fullStr |
Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing |
title_full_unstemmed |
Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing |
title_sort |
novel transition c.1621c>t (p.gln541*) in the fyco1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (ctrct18) in yakutia: results of whole exome sequencing |
publisher |
Publishing House «Genius Media» LLC |
publishDate |
2017 |
url |
https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/197 |
geographic |
Sakha |
geographic_facet |
Sakha |
genre |
Sakha Sakha Republic Yakut Yakutia Yakuts Якути* Якутия Siberia |
genre_facet |
Sakha Sakha Republic Yakut Yakutia Yakuts Якути* Якутия Siberia |
op_source |
Medical Genetics; Том 15, № 10 (2016); 25-33 Медицинская генетика; Том 15, № 10 (2016); 25-33 2073-7998 |
op_relation |
https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/197/174 Robinson GC, Jan JE, Kinnis C. Congenital ocular blindness in children 1945 to 1984. Am J Dis Child. 1987. 141: 1321-1324. Lambert SR, Drack AV. Infantile cataracts. Surv. Ophthalmol. 1996. 40: 427-458. Francois J. Genetics of cataract Ophthalmologica. 1982. 184: 61-71. Merin S. Inherited Cataracts. Inherited Eye Diseases. 1991. S.Merin (Ed.) Marcel Dekker, Inc., New York: 86-120. Haargaard B, Wohlfahrt J, Fledelius HC et al. A nationwide Danish study of 1027 cases of congenital/infantile cataracts: etiological and clinical classifications // Ophthalmology. 2004. 111: 2292-229. Hejtmancik J.F. Congenital cataracts and their molecular genetics. 2008. Semin. Cell Dev. Biol. 19: 134-149 Shiels A, Bennett TM, Hejtmancik JF. Cat-Map: Putting cataract on the map. Mol. Vis., 2010. 16: 2007-2015. Cohen D, Bar-Yosef U, Levy J et al. Homozygous CRYBB1 deletion mutation underlies autosomal recessive congenital cataract. Invest. Ophthalmol. 2007. 48: 2208-2213. Chacon-Camacho OF, Buentello-Volante B, Velazquez-Montoya R et al. Homozygosity mapping identifies a GALK1 mutation as the cause of autosomal recessive congenital cataracts in 4 adult siblings. Gene. 2014 Jan 25; 534(2): 218-221. Kaul H, Riazuddin SA, Shahid M et al. Autosomal recessive congenital cataract linked to EPHA2 in a consanguineous Pakistani family. Mol. Vis. 2010. 16: 511-517. Ponnam SP, Ramesha K, Tejwani S. et al. Mutation of the gap junction protein alpha 8 (GJA8) gene causes autosomal recessive cataract. J. Med. Genet. 2007. 44, e85. Ponnam SP, Ramesha K, Tejwani S et al. A missense mutation in LIM2 causes auto-somal recessive congenital cataract. Mol. Vis. 2008. 14: 1204-1208. Pras E, Frydman M, Levy-Nissenbaum E et al. A nonsense mutation (W9X) in CRYAA causes autosomal recessive cataract in an inbred Jewish Persian family. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2000. 41: 3511-3515. Pras E, Levy-Nissenbaum E, Bakhan T et al. A missense mutation in the LIM2 gene is associated with autosomal recessive presenile cataract in an inbred Iraqi Jewish family. Am J Hum Genet. 2002. 70: 1363-1367. Pras E., Raz J, Yahalom V et al. A nonsense mutation in the glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2 gene (GCNT2): Association with autosomal recessive congenital cataracts. Invest Ophthalmol Vis. Sci. 2004. 45: 1940-1945. Ramachandran RD, Perumalsamy V, Hejtmancik JF. Autosomal recessive juvenile onset cataract associated with mutation in BFSP1. Hum Genet. 2007. 121: 475-482. Riazuddin SA, Yasmeen A, Yao W. et al. Mutations in betaB3-crystallin associated with autosomal recessive cataract in two Pakistani families. Invest. Ophthalmol. 2005. Vis. Sci. 46: 2100-2106. Smaoui N, Beltaief O, BenHamed S et al. A homozygous splice mutation in the HSF4 gene is associated with an autosomal recessive congenital cataract. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2004. 45: 2716-2721. Aldahmesh MA, Khan AO, Mohamed JY et al. Identification of a Truncation Mutation of Acylglycerol Kinase (AGK) Gene in a Novel Autosomal Recessive Cataract Locus // Hum Mut. 2012. 33: 960-962. Tarskaia LA, Zinchenko RA, El’chinova GI et al. The structure and diversity of hereditary pathology in Sakha Republic (Yakutia). Russ J Genet. 2004. 40: 1530-1539. Galeeva N M, Nazarenko LP, Nazarenko S.A. et al. Molecular-genetic cause of recessive congenital methemoglobinemia type 1 in Yakutia. Med Genet. 2005. 9: 15-21. Макисмова Н.Р. Клинико-генеалогическая и молекулярно-генетическая характеристика этноспецифических форм наследственной патологии у якутов: автореферат дис. доктора медицинских наук: 03.00.15, 14.00.09 / Максимова Надежда Романовна; [Место защиты: Науч.-исслед. ин-т медицинской генетики Том. науч. центра СО РАМН]. - Томск, 2009. - 43 с. Barashkov NA, Dzhemileva LU, Fedorova SA et al. Autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Yakut population isolate in Eastern Siberia: extensive accumulation of the splice site mutation IVS1+1G>A in GJB2 gene as a result of founder effect. J Hum Genet. 2011; 56: 631- 639. Pankiv S, Johansen T. FYCO1: Linking autophagosomes to microtubule plus end directing molecular motors, Autophagy 2010. 6: 550-552. Pras E, Pras E, Bakhan T et al. A gene causing autosomal recessive cataract maps to the short arm of chromosome 3. Isr. Med. Assoc. 2001. J.3: 559-562. Chen J, Ma Z, Jiao X. Mutations in FYCO1 cause autosomal-recessive congenital cataracts. Am J Hum Genet. 2011. 88: 827-38. https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/197 |
op_rights |
Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). |
op_rightsnorm |
CC-BY |
_version_ |
1766180718016200704 |
spelling |
ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/197 2023-05-15T18:08:26+02:00 Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing Новая транзиция c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 - основная причина аутосомно-рецессивной формы катаракты (CTRCT18) в Якутии: результаты полноэкзомного секвенирования N. Barashkov A. F. Konovalov A. A. Solovyev V. F. Teryutin M. V. Pshennikova G. N. Sapojnikova V. L. Vytuzhina S. M. Tomsky I. L. Dzhemileva U. E. Khusnutdinova K. O. Posukh L. S. Fedorova A. Н. Барашков А. Ф. Коновалов А. А. Соловьев В. Ф. Терютин М. В. Пшенникова Г. Н. Сапожникова В. Л. Вытюжина С. М. Томский И. Л. Джемилева У. Э. Хуснутдинова К. О. Посух Л. С. Федорова А. 2017-01-30 application/pdf https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/197 rus rus Publishing House «Genius Media» LLC https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/197/174 Robinson GC, Jan JE, Kinnis C. Congenital ocular blindness in children 1945 to 1984. Am J Dis Child. 1987. 141: 1321-1324. Lambert SR, Drack AV. Infantile cataracts. Surv. Ophthalmol. 1996. 40: 427-458. Francois J. Genetics of cataract Ophthalmologica. 1982. 184: 61-71. Merin S. Inherited Cataracts. Inherited Eye Diseases. 1991. S.Merin (Ed.) Marcel Dekker, Inc., New York: 86-120. Haargaard B, Wohlfahrt J, Fledelius HC et al. A nationwide Danish study of 1027 cases of congenital/infantile cataracts: etiological and clinical classifications // Ophthalmology. 2004. 111: 2292-229. Hejtmancik J.F. Congenital cataracts and their molecular genetics. 2008. Semin. Cell Dev. Biol. 19: 134-149 Shiels A, Bennett TM, Hejtmancik JF. Cat-Map: Putting cataract on the map. Mol. Vis., 2010. 16: 2007-2015. Cohen D, Bar-Yosef U, Levy J et al. Homozygous CRYBB1 deletion mutation underlies autosomal recessive congenital cataract. Invest. Ophthalmol. 2007. 48: 2208-2213. Chacon-Camacho OF, Buentello-Volante B, Velazquez-Montoya R et al. Homozygosity mapping identifies a GALK1 mutation as the cause of autosomal recessive congenital cataracts in 4 adult siblings. Gene. 2014 Jan 25; 534(2): 218-221. Kaul H, Riazuddin SA, Shahid M et al. Autosomal recessive congenital cataract linked to EPHA2 in a consanguineous Pakistani family. Mol. Vis. 2010. 16: 511-517. Ponnam SP, Ramesha K, Tejwani S. et al. Mutation of the gap junction protein alpha 8 (GJA8) gene causes autosomal recessive cataract. J. Med. Genet. 2007. 44, e85. Ponnam SP, Ramesha K, Tejwani S et al. A missense mutation in LIM2 causes auto-somal recessive congenital cataract. Mol. Vis. 2008. 14: 1204-1208. Pras E, Frydman M, Levy-Nissenbaum E et al. A nonsense mutation (W9X) in CRYAA causes autosomal recessive cataract in an inbred Jewish Persian family. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2000. 41: 3511-3515. Pras E, Levy-Nissenbaum E, Bakhan T et al. A missense mutation in the LIM2 gene is associated with autosomal recessive presenile cataract in an inbred Iraqi Jewish family. Am J Hum Genet. 2002. 70: 1363-1367. Pras E., Raz J, Yahalom V et al. A nonsense mutation in the glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2 gene (GCNT2): Association with autosomal recessive congenital cataracts. Invest Ophthalmol Vis. Sci. 2004. 45: 1940-1945. Ramachandran RD, Perumalsamy V, Hejtmancik JF. Autosomal recessive juvenile onset cataract associated with mutation in BFSP1. Hum Genet. 2007. 121: 475-482. Riazuddin SA, Yasmeen A, Yao W. et al. Mutations in betaB3-crystallin associated with autosomal recessive cataract in two Pakistani families. Invest. Ophthalmol. 2005. Vis. Sci. 46: 2100-2106. Smaoui N, Beltaief O, BenHamed S et al. A homozygous splice mutation in the HSF4 gene is associated with an autosomal recessive congenital cataract. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2004. 45: 2716-2721. Aldahmesh MA, Khan AO, Mohamed JY et al. Identification of a Truncation Mutation of Acylglycerol Kinase (AGK) Gene in a Novel Autosomal Recessive Cataract Locus // Hum Mut. 2012. 33: 960-962. Tarskaia LA, Zinchenko RA, El’chinova GI et al. The structure and diversity of hereditary pathology in Sakha Republic (Yakutia). Russ J Genet. 2004. 40: 1530-1539. Galeeva N M, Nazarenko LP, Nazarenko S.A. et al. Molecular-genetic cause of recessive congenital methemoglobinemia type 1 in Yakutia. Med Genet. 2005. 9: 15-21. Макисмова Н.Р. Клинико-генеалогическая и молекулярно-генетическая характеристика этноспецифических форм наследственной патологии у якутов: автореферат дис. доктора медицинских наук: 03.00.15, 14.00.09 / Максимова Надежда Романовна; [Место защиты: Науч.-исслед. ин-т медицинской генетики Том. науч. центра СО РАМН]. - Томск, 2009. - 43 с. Barashkov NA, Dzhemileva LU, Fedorova SA et al. Autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Yakut population isolate in Eastern Siberia: extensive accumulation of the splice site mutation IVS1+1G>A in GJB2 gene as a result of founder effect. J Hum Genet. 2011; 56: 631- 639. Pankiv S, Johansen T. FYCO1: Linking autophagosomes to microtubule plus end directing molecular motors, Autophagy 2010. 6: 550-552. Pras E, Pras E, Bakhan T et al. A gene causing autosomal recessive cataract maps to the short arm of chromosome 3. Isr. Med. Assoc. 2001. J.3: 559-562. Chen J, Ma Z, Jiao X. Mutations in FYCO1 cause autosomal-recessive congenital cataracts. Am J Hum Genet. 2011. 88: 827-38. https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/197 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). CC-BY Medical Genetics; Том 15, № 10 (2016); 25-33 Медицинская генетика; Том 15, № 10 (2016); 25-33 2073-7998 врожденная аутосомно-рецессивная катаракта CTRCT18 ген FYCO1 якуты популяционный изолят Якутия Восточная Сибирь congenital autosomal recessive cataract FYCO1 Yakuts population isolate Sakha Republic Eastern Siberia info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2017 ftjmedgen 2022-02-16T19:36:03Z Congenital cataracts are a major cause of vision loss in children worldwide. Congenital autosomal recessive cataract is one of the most common orphan diseases in indigenous Yakut population (the Sakha Republic, Eastern Siberia, Russia). To identify the genetic cause of congenital cataract spread in Yakut population we performed whole exome sequencing on Illumina NextSeq 500 in one Yakut patient from family with three affected siblings, whose parents had preserved vision and revealed novel homozygous transition c.1621C>T (chr3:46009205G>A) in gene FYCO1 (3p21.31) previously known in association with congenital cataract. The c.1621C>T transition leads to premature stop-codon formation (p.Gln541*, NM_024513.3) in exon 8 of the FYCO1 gene. Variant c.1621C>T is not reported in the 1000 Genomes, the ESP6500, and the ExAC projects. Sanger sequencing confirmed the segregation of homozygosity for c.1621C>T with congenital cataract in this Yakut family: all affected siblings were homozygotes for c.1621C>T while their healthy parents were heterozygous for this variant. Subsequent screening c.1621C>T in other patients with congenital cataract allowed us to define the contribution of c.1621C>T in etiology of this disease in Yakutia. In total, 87.5% of the congenital cataract cases in Yakutia were caused by homozygous variant c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene. The highest prevalence of congenital cataract caused by homozygosity for c.1621C>T was registered in the сentral districts of the Sakha Republic (Yakutia). These results suggest that the novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakut population in the Sakha Republic (Yakutia). Врожденная катаракта - основная причина детской слепоты во многих популяциях мира. В Якутии врожденная катаракта является одним из наиболее частых орфанных заболеваний с неустановленной генетической природой. Для поиска молекулярно-генетических причин этого заболевания было проведено полноэкзомное секвенирование (Illumina NextSeq 500) у одного пациента с врожденной катарактой из якутской семьи, в которой, помимо обследуемого, было еще два пораженных сибса, а родители имели сохранное зрение. Полноэкзомный анализ выявил у этого пациента новую гомозиготную транзицию c.1621C>T в 8-м экзоне гена FYCO1 (локус CATC2, CTRCT18, OMIM 610019), ранее известного в ассоциации с врожденной катарактой. Замена c.1621C>T приводит к образованию преждевременного стоп-кодона p.Gln541*, терминирующего трансляцию белка FYCO1 (FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein), выполняющего ключевую транспортную роль при процессах автофагии в клетках хрусталика. В настоящее время сведения о транзиции c.1621C>T отсутствуют в базах данных 1000 Genomes, ESP6500 и ExAC. Секвенирование по Сэнгеру подтвердило сегрегацию гомозиготности по c.1621C>T с врожденной катарактой в якутской семье: все пораженные сибсы были гомозиготами, а их здоровые родители - гетерозиготами по этому варианту. Результаты полноэкзомного секвенирования в обследованной якутской семье и последующий скрининг варианта c.1621C>T у других пациентов с врожденной катарактой в Якутии показали, что, в целом, вклад гомозиготной транзиции с.1621C>T (p.Gln541*) в этиологию врожденной катаракты составил 87,5%, с очагами накопления в центральных районах Якутии. Полученные результаты позволяют предположить, что обнаруженный впервые вариант c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 является основной причиной врожденной аутосомно-рецессивной катаракты (CTRCT18) в Якутии. Article in Journal/Newspaper Sakha Sakha Republic Yakut Yakutia Yakuts Якути* Якутия Siberia Medical Genetics (E-Journal) Sakha |