Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013
In 2013 after two previous years when the situation had been calm the incidence rates of enterovirus infection significantly increased on certain territories of the North-West of Russia. In Novgorod and Vologda regions and in Saint-Petersburg enterovirus meningitis group cases were registered. The e...
| Main Authors: | , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article in Journal/Newspaper |
| Language: | Russian |
| Published: |
IPO “АIDSSPbR"
2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344 https://doi.org/10.22625/2072-6732-2014-6-3-84-91 |
| _version_ | 1828686462039621632 |
|---|---|
| author | M. A. Bichurina N. I. Romanenkova L. N. Golitsyna N. R. Rozaeva O. I. Kanaeva S. G. Fomina T. I. Krainova L. A. Shishko T. A. Gordienko V. A. Pianykh T. G. Ivanova S. N. Smelkov M. V. Lesnikova N. A. Novikova М. А. Бичурина Н. И. Романенкова Л. Н. Голицына Н. Р. Розаева О. И. Канаева С. Г. Фомина Т. И. Крайнова Л. А. Шишко Т. А. Гордиенко В. А. Пьяных Т. Г. Иванова С. Н. Смелков М. В. Лесникова Н. А. Новикова |
| author_facet | M. A. Bichurina N. I. Romanenkova L. N. Golitsyna N. R. Rozaeva O. I. Kanaeva S. G. Fomina T. I. Krainova L. A. Shishko T. A. Gordienko V. A. Pianykh T. G. Ivanova S. N. Smelkov M. V. Lesnikova N. A. Novikova М. А. Бичурина Н. И. Романенкова Л. Н. Голицына Н. Р. Розаева О. И. Канаева С. Г. Фомина Т. И. Крайнова Л. А. Шишко Т. А. Гордиенко В. А. Пьяных Т. Г. Иванова С. Н. Смелков М. В. Лесникова Н. А. Новикова |
| author_sort | M. A. Bichurina |
| collection | Journal Infectology |
| description | In 2013 after two previous years when the situation had been calm the incidence rates of enterovirus infection significantly increased on certain territories of the North-West of Russia. In Novgorod and Vologda regions and in Saint-Petersburg enterovirus meningitis group cases were registered. The etiology of enterovirus infection was studied by virological and molecular methods. Enterovirus ECHO30 was identified as the principal etiological agent of the cases. Molecular study revealed that enteroviruses ECHO30 isolated in the North-West of Russia belonged to the genotype H and formed two subtypes inside this genotype. Phylogenetic analysis has shown that enteroviruses ECHO30 of both subtypes were closely related to the strains detected in different provinces of China in 2010-2013. Probably enteroviruses ECHO30 of the genotype H which largely circulated in Russia in 2013 and practically had not been detected in the country earlier had been imported on the territory of Russia from South-East Asia. Enteroviruses ECHO30 isolated in Arkhangelsk and Novgorod regions in 2008-2009 belonged to another genotype Ec2. Enteroviruses of this genotype had circulated at that time in the European countries. В 2013 г. после относительно спокойной ситуации в течение двух предыдущих лет заболеваемость энтеровирусной инфекцией на ряде территорий Северо-Западного федерального округа резко возросла. Были зарегистрированы групповые заболевания энтеровирусным менингитом в Новгородской, Вологодской областях и в Санкт-Петербурге. Проведена расшифровка этиологии заболеваний энтеровирусной инфекцией с использованием вирусологического и молекулярно- генетического методов исследования. В качестве основного этиологического агента был идентифицирован энтеровирус ЕСНО 30. Установлено, что изолированные на Северо-Западе России вирусы ЕСНО 30 относились к генотипу Н и сформировали две филогенетические группы. Филогенетический анализ показал, что энтеровирусы ЕСНО 30 обоих субтипов были наиболее близко родственны штаммам, выделенным в разных ... |
| format | Article in Journal/Newspaper |
| genre | Arkhangelsk |
| genre_facet | Arkhangelsk |
| id | ftjinfectology:oai:oai.jofin.elpub.ru:article/344 |
| institution | Open Polar |
| language | Russian |
| op_collection_id | ftjinfectology |
| op_doi | https://doi.org/10.22625/2072-6732-2014-6-3-84-9110.22625/2072-6732-2014-6-3 |
| op_relation | https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344/341 Amvrosieva T.V. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 3: 17-21 (in Russian). Bichurina M.A., Pianykh V.A., Novikova N.A. et al. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2012; 4: 747-752 (in Russian). Golitsyna L.N., Novikova N.A., Fomina S.G. et al. Innovatsionnye tekhnologii v protivoepidemicheskoi zashite naseleniya [Innovation technologies in the antiepidemic protection of the population]. N. Novgorod; 2014. p. 88-92 (in Russian). Lukashev A.N., Ivanova O.E., Eremeeva T.P et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2004; 5: 12-16 (in Russian). Lukashev A.N., Reznik V.I., Ivanova O.E. et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2008; 1: 16-21 (in Russian). Novikova N.A., Golitsyna L.N., Fomina S.G., Efimov E.I. . Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2013; 1: 75-78 (in Russian). Onishchenko G.G., Novikova N.A., Efimov E.I. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2009; 2: 24-30 (in Russian). Reznik V.I., Kozhevnikova N.V., Karavyanskaya T.N. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii –Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2007; 5: 32-37 (in Russian). Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Rozaeva N.R. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2011; 6: 32- 36 (in Russian). Seibil V.B., Frolochkina T.I. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 1: 87-92 (in Russian). Shishko L.A., Romanenkova N.I., Bichurina M.A. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2013; 1: 65-72 (in Russian). Lobzin Yu.V., Skripchenko N.V., Murina E.A. Enterovirus infections: Guidelines for Physicians. Saint-Petersburg; 2012 (in Russian). Bailly J.L. Phylogeography of circulating populatios of human echovirus 30 over 50years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene / J.L. Bailly et [al.] // Infect. Genet. Evol.- 2009. – Vol. 9. – P. 699-708. CDC. Outbreaks of aseptic meningitis associated with echovirus 9 and 30 and preliminary surveillance reports on enterovirus activity – United States, 2003 // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2003. – Vol. 52. – P. 761-764. Domingo E. Basic concepts in RNA virus evolution / E. Domingo et [al.] // Faseb. J. – 1996. – N 10. – P. 859-864. Khetsuriani N. Enterovirus surveillance – United States, 1970-2005 / N. Khetsuriani et [al.] // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2006. – Vol. 55. – N 8. – P. 1-20. Lukashev A.N. Analysis of echovirus 30 isolates from Russia and new independent states revealing frequent recombination and reemergence of ancient lineages / A.N. Lukashev et [al.] // J. Clin. Microbiol. – 2008. – Vol. 46. – P. 665-670. Milia M.G. Recent outbreak of aseptic meningitis in Italy due to Echovirus 30 and phylogenetic relationship with other European circulating strains / M.G. Milia et [al.] // J. Clin. Virol. 2013. – Vol. 58. – P. 579-583. Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens / W.A. Nix, M.S. Oberste, M.A. Pallansch // Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44. – P. 2698-2704. Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10.World Health Organization, Geneva, Switzerland. — 2004. — 157 p. Savolainen-Kopra C., Paananen A., Blomqvist S. A large Finnish echovirus 30 outbreak was preceded by silent circulation of the same genotype / C. Savolainen-Kopra, A. Paananen, S. Blomqvist // Virus Genes. – 2011. – Vol. 42. – P. 28-36. Tamura K. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods / K. Tamura et [al.] // Mol. Biol. and Evol. – 2011. – Vol. 28. – N 10. – P. 2731-2739. Tao Z. Molecular epidemiology of human enterovirus associated with aseptic meningitis in Shandong province, Сhina, 2006-2012 / Z. Tao et [al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9. – N 2. -e89766. Yang X.H., Yan Y.S., Weng Y.W. Molecular epidemiology of Echovirus 30 in Fujian, China between 2001 and 2011 /X.H. Yang, Y.S. Yan, Y.W. Weng // J. Med. Virol. – 2013. – Vol. 85. – P. 696-702. https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344 |
| op_rights | Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). |
| op_source | Journal Infectology; Том 6, № 3 (2014); 84-91 Журнал инфектологии; Том 6, № 3 (2014); 84-91 2072-6732 10.22625/2072-6732-2014-6-3 |
| publishDate | 2014 |
| publisher | IPO “АIDSSPbR" |
| record_format | openpolar |
| spelling | ftjinfectology:oai:oai.jofin.elpub.ru:article/344 2025-04-06T14:47:04+00:00 Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013 РОЛЬ ЭНТЕРОВИРУСА ECHO 30 В ЭТИОЛОГИИ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ НА СЕВЕРО -ЗАПАДЕ РОССИИ В 2013 г M. A. Bichurina N. I. Romanenkova L. N. Golitsyna N. R. Rozaeva O. I. Kanaeva S. G. Fomina T. I. Krainova L. A. Shishko T. A. Gordienko V. A. Pianykh T. G. Ivanova S. N. Smelkov M. V. Lesnikova N. A. Novikova М. А. Бичурина Н. И. Романенкова Л. Н. Голицына Н. Р. Розаева О. И. Канаева С. Г. Фомина Т. И. Крайнова Л. А. Шишко Т. А. Гордиенко В. А. Пьяных Т. Г. Иванова С. Н. Смелков М. В. Лесникова Н. А. Новикова 2014-10-21 application/pdf https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344 https://doi.org/10.22625/2072-6732-2014-6-3-84-91 rus rus IPO “АIDSSPbR" https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344/341 Amvrosieva T.V. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 3: 17-21 (in Russian). Bichurina M.A., Pianykh V.A., Novikova N.A. et al. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2012; 4: 747-752 (in Russian). Golitsyna L.N., Novikova N.A., Fomina S.G. et al. Innovatsionnye tekhnologii v protivoepidemicheskoi zashite naseleniya [Innovation technologies in the antiepidemic protection of the population]. N. Novgorod; 2014. p. 88-92 (in Russian). Lukashev A.N., Ivanova O.E., Eremeeva T.P et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2004; 5: 12-16 (in Russian). Lukashev A.N., Reznik V.I., Ivanova O.E. et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2008; 1: 16-21 (in Russian). Novikova N.A., Golitsyna L.N., Fomina S.G., Efimov E.I. . Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2013; 1: 75-78 (in Russian). Onishchenko G.G., Novikova N.A., Efimov E.I. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2009; 2: 24-30 (in Russian). Reznik V.I., Kozhevnikova N.V., Karavyanskaya T.N. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii –Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2007; 5: 32-37 (in Russian). Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Rozaeva N.R. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2011; 6: 32- 36 (in Russian). Seibil V.B., Frolochkina T.I. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 1: 87-92 (in Russian). Shishko L.A., Romanenkova N.I., Bichurina M.A. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2013; 1: 65-72 (in Russian). Lobzin Yu.V., Skripchenko N.V., Murina E.A. Enterovirus infections: Guidelines for Physicians. Saint-Petersburg; 2012 (in Russian). Bailly J.L. Phylogeography of circulating populatios of human echovirus 30 over 50years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene / J.L. Bailly et [al.] // Infect. Genet. Evol.- 2009. – Vol. 9. – P. 699-708. CDC. Outbreaks of aseptic meningitis associated with echovirus 9 and 30 and preliminary surveillance reports on enterovirus activity – United States, 2003 // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2003. – Vol. 52. – P. 761-764. Domingo E. Basic concepts in RNA virus evolution / E. Domingo et [al.] // Faseb. J. – 1996. – N 10. – P. 859-864. Khetsuriani N. Enterovirus surveillance – United States, 1970-2005 / N. Khetsuriani et [al.] // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2006. – Vol. 55. – N 8. – P. 1-20. Lukashev A.N. Analysis of echovirus 30 isolates from Russia and new independent states revealing frequent recombination and reemergence of ancient lineages / A.N. Lukashev et [al.] // J. Clin. Microbiol. – 2008. – Vol. 46. – P. 665-670. Milia M.G. Recent outbreak of aseptic meningitis in Italy due to Echovirus 30 and phylogenetic relationship with other European circulating strains / M.G. Milia et [al.] // J. Clin. Virol. 2013. – Vol. 58. – P. 579-583. Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens / W.A. Nix, M.S. Oberste, M.A. Pallansch // Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44. – P. 2698-2704. Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10.World Health Organization, Geneva, Switzerland. — 2004. — 157 p. Savolainen-Kopra C., Paananen A., Blomqvist S. A large Finnish echovirus 30 outbreak was preceded by silent circulation of the same genotype / C. Savolainen-Kopra, A. Paananen, S. Blomqvist // Virus Genes. – 2011. – Vol. 42. – P. 28-36. Tamura K. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods / K. Tamura et [al.] // Mol. Biol. and Evol. – 2011. – Vol. 28. – N 10. – P. 2731-2739. Tao Z. Molecular epidemiology of human enterovirus associated with aseptic meningitis in Shandong province, Сhina, 2006-2012 / Z. Tao et [al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9. – N 2. -e89766. Yang X.H., Yan Y.S., Weng Y.W. Molecular epidemiology of Echovirus 30 in Fujian, China between 2001 and 2011 /X.H. Yang, Y.S. Yan, Y.W. Weng // J. Med. Virol. – 2013. – Vol. 85. – P. 696-702. https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). Journal Infectology; Том 6, № 3 (2014); 84-91 Журнал инфектологии; Том 6, № 3 (2014); 84-91 2072-6732 10.22625/2072-6732-2014-6-3 молекулярное типирование isolation and identification of enteroviruses molecular typing выделение и идентификация энтеровирусов info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2014 ftjinfectology https://doi.org/10.22625/2072-6732-2014-6-3-84-9110.22625/2072-6732-2014-6-3 2025-03-10T11:39:51Z In 2013 after two previous years when the situation had been calm the incidence rates of enterovirus infection significantly increased on certain territories of the North-West of Russia. In Novgorod and Vologda regions and in Saint-Petersburg enterovirus meningitis group cases were registered. The etiology of enterovirus infection was studied by virological and molecular methods. Enterovirus ECHO30 was identified as the principal etiological agent of the cases. Molecular study revealed that enteroviruses ECHO30 isolated in the North-West of Russia belonged to the genotype H and formed two subtypes inside this genotype. Phylogenetic analysis has shown that enteroviruses ECHO30 of both subtypes were closely related to the strains detected in different provinces of China in 2010-2013. Probably enteroviruses ECHO30 of the genotype H which largely circulated in Russia in 2013 and practically had not been detected in the country earlier had been imported on the territory of Russia from South-East Asia. Enteroviruses ECHO30 isolated in Arkhangelsk and Novgorod regions in 2008-2009 belonged to another genotype Ec2. Enteroviruses of this genotype had circulated at that time in the European countries. В 2013 г. после относительно спокойной ситуации в течение двух предыдущих лет заболеваемость энтеровирусной инфекцией на ряде территорий Северо-Западного федерального округа резко возросла. Были зарегистрированы групповые заболевания энтеровирусным менингитом в Новгородской, Вологодской областях и в Санкт-Петербурге. Проведена расшифровка этиологии заболеваний энтеровирусной инфекцией с использованием вирусологического и молекулярно- генетического методов исследования. В качестве основного этиологического агента был идентифицирован энтеровирус ЕСНО 30. Установлено, что изолированные на Северо-Западе России вирусы ЕСНО 30 относились к генотипу Н и сформировали две филогенетические группы. Филогенетический анализ показал, что энтеровирусы ЕСНО 30 обоих субтипов были наиболее близко родственны штаммам, выделенным в разных ... Article in Journal/Newspaper Arkhangelsk Journal Infectology |
| spellingShingle | молекулярное типирование isolation and identification of enteroviruses molecular typing выделение и идентификация энтеровирусов M. A. Bichurina N. I. Romanenkova L. N. Golitsyna N. R. Rozaeva O. I. Kanaeva S. G. Fomina T. I. Krainova L. A. Shishko T. A. Gordienko V. A. Pianykh T. G. Ivanova S. N. Smelkov M. V. Lesnikova N. A. Novikova М. А. Бичурина Н. И. Романенкова Л. Н. Голицына Н. Р. Розаева О. И. Канаева С. Г. Фомина Т. И. Крайнова Л. А. Шишко Т. А. Гордиенко В. А. Пьяных Т. Г. Иванова С. Н. Смелков М. В. Лесникова Н. А. Новикова Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013 |
| title | Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013 |
| title_full | Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013 |
| title_fullStr | Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013 |
| title_full_unstemmed | Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013 |
| title_short | Role of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013 |
| title_sort | role of enterovirus echo 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the north-west of russia in 2013 |
| topic | молекулярное типирование isolation and identification of enteroviruses molecular typing выделение и идентификация энтеровирусов |
| topic_facet | молекулярное типирование isolation and identification of enteroviruses molecular typing выделение и идентификация энтеровирусов |
| url | https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344 https://doi.org/10.22625/2072-6732-2014-6-3-84-91 |