On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea
50 samples of bottom sediments of Kandalaksha Bay of the White Sea were taken in 2016–2017 from depths of 1.5–15 meters of which 1419 colonies of culturable filamentous fungi were obtained. Based on morphological and cultural features, a total of 136 morphotypes were classified, 81 of these were ide...
Published in: | Mycology |
---|---|
Main Authors: | , , , , , |
Format: | Article in Journal/Newspaper |
Language: | Russian |
Published: |
Lomonosov Moscow State University, School of Biology
2020
|
Subjects: | |
Online Access: | https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/903 |
id |
ftjhmub:oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/903 |
---|---|
record_format |
openpolar |
institution |
Open Polar |
collection |
Herald of Moscow University. Series 16. Biology |
op_collection_id |
ftjhmub |
language |
Russian |
topic |
морские грибы;Ascomycota;донные грунты;разнообразие;Белое море;ординация сообществ |
spellingShingle |
морские грибы;Ascomycota;донные грунты;разнообразие;Белое море;ординация сообществ E. Bubnova N. O. Grum-Grzhimailo A. V. Kozlovsky V. Е. Бубнова Н. О. Грум-Гржимайло А. В. Козловский В. On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea |
topic_facet |
морские грибы;Ascomycota;донные грунты;разнообразие;Белое море;ординация сообществ |
description |
50 samples of bottom sediments of Kandalaksha Bay of the White Sea were taken in 2016–2017 from depths of 1.5–15 meters of which 1419 colonies of culturable filamentous fungi were obtained. Based on morphological and cultural features, a total of 136 morphotypes were classified, 81 of these were identified to a species. We discovered 13 species new to the White Sea. The most common were Tolypocladium cylindrosporum, Penicillium chrysogenum, Tolypocladium inflatum, Penicillium glabrum and the anamorph of Pseudogymnoascus pannorum. The dominance of ascomycetous fungi was a common characteristic of the mycobiota due to the anamorphic species, and the class Sordariomycetes was the most prevailing group. Assessment of species richness using a cumulative curve and the calculation of the expected total number of species adjusted using Chao2 showed that about 81% of the species diversity was found. The ordination of samples by the nMDS with the ANOSIM test showed the high importance of combining the samples into groups based on the year of sampling and type of sediment, as well as the year of sampling and type of ecotope. Therefore, the type of sediment associated with the type of coast and the presence of fresh inflow is the most important factor for the formation of mycobiota. Moreover, the communities of mycelial fungi change from year to year in the studied bottom sediments. 50 образцов донных грунтов были отобраны в 2016–2017 гг. в Кандалакшском заливе Белого моря с глубин 1,5–15 м. Выделено 1419 колоний мицелиальных грибов, отнесенных к 136 морфотипам, из которых 81 был идентифицирован до вида по морфолого-культуральным признакам. Обнаружено 13 видов, новых для Белого моря. Наиболее распространенными были Tolypocladium cylindrosporum, Penicillium chrysogenum, Tolypocladium inflatum, Penicillium glabrum и анаморфа Pseudogymnoascus pannorum. В таксономической структуре преобладали анаморфы аскомицетов, а самой многочисленной и разнообразной группой был класс Sordariomycetes. Оценка видового богатства с помощью кумулятивной кривой и расчета ожидаемого полного числа видов с поправкой Chao2 показала, что видовое разнообразие выявлено примерно на 81%. Ординация сообществ грибов методом nMDS с тестом ANOSIM показала высокую значимость объединения групп по признакам года отбора и типа грунта, а также года отбора и типа экотопа. Таким образом, важнейшим фактором для формирования микобиоты является тип грунта, связанный с типом берега и наличием пресного стока. Кроме того, сообщества мицелиальных грибов в исследованных донных грунтах меняются год от года. |
format |
Article in Journal/Newspaper |
author |
E. Bubnova N. O. Grum-Grzhimailo A. V. Kozlovsky V. Е. Бубнова Н. О. Грум-Гржимайло А. В. Козловский В. |
author_facet |
E. Bubnova N. O. Grum-Grzhimailo A. V. Kozlovsky V. Е. Бубнова Н. О. Грум-Гржимайло А. В. Козловский В. |
author_sort |
E. Bubnova N. |
title |
On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea |
title_short |
On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea |
title_full |
On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea |
title_fullStr |
On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea |
title_full_unstemmed |
On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea |
title_sort |
on the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the white sea |
publisher |
Lomonosov Moscow State University, School of Biology |
publishDate |
2020 |
url |
https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/903 |
long_lat |
ENVELOPE(32.417,32.417,67.133,67.133) |
geographic |
Kandalaksha White Sea |
geographic_facet |
Kandalaksha White Sea |
genre |
Arctic Polar Biology White Sea Белого моря Белое море |
genre_facet |
Arctic Polar Biology White Sea Белого моря Белое море |
op_source |
Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 75, № 3 (2020); 182-187 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 75, № 3 (2020); 182-187 0137-0952 |
op_relation |
https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/903/524 Bongiorni L. Thraustochytrids, a neglected component of organic matter decomposition and food webs in marine sediments // Biology of marine fungi. Progress in molecular and subcellular biology. Vol. 53 / Ed. C. Raghukumar. Berlin–Heidelberg: Springer, 2012. P. 1–15. Kohlmeyer J., Kohlmeyer E. Marine mycology, the higher fungi. N.Y.–San Francisco–London: Academic Press, 1979. 690 pp. Khudyakova Yu.V., Pivkin M.V., Kuznetsova T.A., Svetashev V.I. Fungi in sediments of the Sea of Japan and their biologically active metabolites // Microbiology. 2000. Vol. 69. N 5. P. 608–611. Damare S., Raghukumar C., Raghukumar S. Fungi in deep-sea sediments of the Central Indian Basin // Deep Sea Res. Part I Oceanogr. Res. Pap. 2006. Vol. 53. P. 14–27. Бубнова Е.Н. Грибы донных грунтов Кандалакшского залива Белого моря // Микол. фитопатол. 2009. Т. 43. № 4. С. 4–11. Bubnova E.N. Fungal diversity in bottom sediments of the Kara Sea // Botanica Marina. 2010. Vol. 53. N 6. P. 595–600. Nagano Y., Nagahama T. Cultured and uncultured fungal diversity in Deep-Sea environments // Biology of marine fungi. Progress in molecular and subcellular biology. Vol. 53 / Ed. C. Raghukumar. Berlin–Heidelberg: Springer, 2012. P. 173–189. Bubnova E.N., Nikitin D.A. Fungi in bottom sediments of the Barents and Kara seas // Russ. J. Mar. Biol. 2017. Vol. 43. N 5. P. 400–406. Бубнова Е.Н., Коновалова О.П. Разнообразие мицелиальных грибов в грунтах литорали и сублиторали Баренцева моря (окрестности поселка Дальние Зеленцы) // Микол. фитопатол. 2018. Т. 52. № 5. С. 320–328. Khusnullina A.I., Bilanenko E.N., Kurakov A.V. Microscopic fungi of White Sea sediments // Contemp. Probl. Ecol. 2018. Vol. 11. N 5. P. 503–513. Hagestad O.C., Andersen J.H., Altemark B., Hansen E., Rämä T. Cultivable marine fungi from the Arctic Archipelago of Svalbard and their antibacterial activity // Mycologia. 2019. Vol. 10. N. 4. DOI:10.1080/21501203.2019.1708492 Luo Y., Xu W. Luo Z-H., Pang K-L. Diversity and temperature adaptability of cultivable fungi in marina sediments from the Chukchi Sea // Botanica Marina. 2020. Vol. 63. N 2. P. 197–207. Chikina M.V., Basin A.B., Mokievskiy V.O., Kucheruk N.V., Kozlovskiy V.V., Shabalin N.V. Spatial structure of macro- and meiobenthic communities in a homogeneous environment (on the example of the Pechora Sea) // Oceanology. 2019. Vol. 59. N 3. P. 367–373. Clarke K.R., Warwick R.M. Change in marine communities: an approach to statistical analysis and interpretation. 2nd edition. Plymouth: Primer-E Ltd, 2001. 172 pp. Bubnova E.N. Diversity of the microscopic fungi in the littoral sands of the White sea // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 3. P. 121–127. Bubnova E.N., Grum-Grzhimaylo O.A., Konovalova O.P., Marfenina O.E. Fifty Years of mycological studies at the White Sea Biological Station of Moscow State University: challenges, results, and outlook // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2014. Vol. 69. N 1. P. 23–39. Jones E.B.G., Suetrong S., Sakayaroj J., Bahkali A.H., Abdel-Wahab M.A., Boekhout T., Pang K.L. Classification of marine Ascomycota, Basidiomycota, Blastocladiomycota and Chytridiomycota // Fungal Diversity. 2015. Vol. 73. N 1. P. 1–72. Rämä T., Hassett B.T., Bubnova E. Arctic marine fungi: from filaments and flagella to operation taxonomic units and beyond // Botanica Marina. 2017. Vol. 60. N 4. P. 433–452. Grum-Grzhimaylo O.A., Debets J.M., Bilanenko E.N. Mosaic structure of the fungal community in the Kislo-Sladkoe Lake that is detaching from the White Sea // Polar Biology. 2018. Vol. 41. N 10. P. 2075–2089. https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/903 |
op_rights |
Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте). |
op_rightsnorm |
CC-BY |
op_doi |
https://doi.org/10.1080/21501203.2019.1708492 |
container_title |
Mycology |
container_volume |
11 |
container_issue |
3 |
container_start_page |
230 |
op_container_end_page |
242 |
_version_ |
1766302438397050880 |
spelling |
ftjhmub:oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/903 2023-05-15T14:28:16+02:00 On the composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea Состав и структура сообществ мицелиальных грибов в донных грунтах Белого моря E. Bubnova N. O. Grum-Grzhimailo A. V. Kozlovsky V. Е. Бубнова Н. О. Грум-Гржимайло А. В. Козловский В. 2020-08-01 application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/903 rus rus Lomonosov Moscow State University, School of Biology https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/903/524 Bongiorni L. Thraustochytrids, a neglected component of organic matter decomposition and food webs in marine sediments // Biology of marine fungi. Progress in molecular and subcellular biology. Vol. 53 / Ed. C. Raghukumar. Berlin–Heidelberg: Springer, 2012. P. 1–15. Kohlmeyer J., Kohlmeyer E. Marine mycology, the higher fungi. N.Y.–San Francisco–London: Academic Press, 1979. 690 pp. Khudyakova Yu.V., Pivkin M.V., Kuznetsova T.A., Svetashev V.I. Fungi in sediments of the Sea of Japan and their biologically active metabolites // Microbiology. 2000. Vol. 69. N 5. P. 608–611. Damare S., Raghukumar C., Raghukumar S. Fungi in deep-sea sediments of the Central Indian Basin // Deep Sea Res. Part I Oceanogr. Res. Pap. 2006. Vol. 53. P. 14–27. Бубнова Е.Н. Грибы донных грунтов Кандалакшского залива Белого моря // Микол. фитопатол. 2009. Т. 43. № 4. С. 4–11. Bubnova E.N. Fungal diversity in bottom sediments of the Kara Sea // Botanica Marina. 2010. Vol. 53. N 6. P. 595–600. Nagano Y., Nagahama T. Cultured and uncultured fungal diversity in Deep-Sea environments // Biology of marine fungi. Progress in molecular and subcellular biology. Vol. 53 / Ed. C. Raghukumar. Berlin–Heidelberg: Springer, 2012. P. 173–189. Bubnova E.N., Nikitin D.A. Fungi in bottom sediments of the Barents and Kara seas // Russ. J. Mar. Biol. 2017. Vol. 43. N 5. P. 400–406. Бубнова Е.Н., Коновалова О.П. Разнообразие мицелиальных грибов в грунтах литорали и сублиторали Баренцева моря (окрестности поселка Дальние Зеленцы) // Микол. фитопатол. 2018. Т. 52. № 5. С. 320–328. Khusnullina A.I., Bilanenko E.N., Kurakov A.V. Microscopic fungi of White Sea sediments // Contemp. Probl. Ecol. 2018. Vol. 11. N 5. P. 503–513. Hagestad O.C., Andersen J.H., Altemark B., Hansen E., Rämä T. Cultivable marine fungi from the Arctic Archipelago of Svalbard and their antibacterial activity // Mycologia. 2019. Vol. 10. N. 4. DOI:10.1080/21501203.2019.1708492 Luo Y., Xu W. Luo Z-H., Pang K-L. Diversity and temperature adaptability of cultivable fungi in marina sediments from the Chukchi Sea // Botanica Marina. 2020. Vol. 63. N 2. P. 197–207. Chikina M.V., Basin A.B., Mokievskiy V.O., Kucheruk N.V., Kozlovskiy V.V., Shabalin N.V. Spatial structure of macro- and meiobenthic communities in a homogeneous environment (on the example of the Pechora Sea) // Oceanology. 2019. Vol. 59. N 3. P. 367–373. Clarke K.R., Warwick R.M. Change in marine communities: an approach to statistical analysis and interpretation. 2nd edition. Plymouth: Primer-E Ltd, 2001. 172 pp. Bubnova E.N. Diversity of the microscopic fungi in the littoral sands of the White sea // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 3. P. 121–127. Bubnova E.N., Grum-Grzhimaylo O.A., Konovalova O.P., Marfenina O.E. Fifty Years of mycological studies at the White Sea Biological Station of Moscow State University: challenges, results, and outlook // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2014. Vol. 69. N 1. P. 23–39. Jones E.B.G., Suetrong S., Sakayaroj J., Bahkali A.H., Abdel-Wahab M.A., Boekhout T., Pang K.L. Classification of marine Ascomycota, Basidiomycota, Blastocladiomycota and Chytridiomycota // Fungal Diversity. 2015. Vol. 73. N 1. P. 1–72. Rämä T., Hassett B.T., Bubnova E. Arctic marine fungi: from filaments and flagella to operation taxonomic units and beyond // Botanica Marina. 2017. Vol. 60. N 4. P. 433–452. Grum-Grzhimaylo O.A., Debets J.M., Bilanenko E.N. Mosaic structure of the fungal community in the Kislo-Sladkoe Lake that is detaching from the White Sea // Polar Biology. 2018. Vol. 41. N 10. P. 2075–2089. https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/903 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте). CC-BY Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 75, № 3 (2020); 182-187 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 75, № 3 (2020); 182-187 0137-0952 морские грибы;Ascomycota;донные грунты;разнообразие;Белое море;ординация сообществ info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2020 ftjhmub https://doi.org/10.1080/21501203.2019.1708492 2022-03-01T06:34:49Z 50 samples of bottom sediments of Kandalaksha Bay of the White Sea were taken in 2016–2017 from depths of 1.5–15 meters of which 1419 colonies of culturable filamentous fungi were obtained. Based on morphological and cultural features, a total of 136 morphotypes were classified, 81 of these were identified to a species. We discovered 13 species new to the White Sea. The most common were Tolypocladium cylindrosporum, Penicillium chrysogenum, Tolypocladium inflatum, Penicillium glabrum and the anamorph of Pseudogymnoascus pannorum. The dominance of ascomycetous fungi was a common characteristic of the mycobiota due to the anamorphic species, and the class Sordariomycetes was the most prevailing group. Assessment of species richness using a cumulative curve and the calculation of the expected total number of species adjusted using Chao2 showed that about 81% of the species diversity was found. The ordination of samples by the nMDS with the ANOSIM test showed the high importance of combining the samples into groups based on the year of sampling and type of sediment, as well as the year of sampling and type of ecotope. Therefore, the type of sediment associated with the type of coast and the presence of fresh inflow is the most important factor for the formation of mycobiota. Moreover, the communities of mycelial fungi change from year to year in the studied bottom sediments. 50 образцов донных грунтов были отобраны в 2016–2017 гг. в Кандалакшском заливе Белого моря с глубин 1,5–15 м. Выделено 1419 колоний мицелиальных грибов, отнесенных к 136 морфотипам, из которых 81 был идентифицирован до вида по морфолого-культуральным признакам. Обнаружено 13 видов, новых для Белого моря. Наиболее распространенными были Tolypocladium cylindrosporum, Penicillium chrysogenum, Tolypocladium inflatum, Penicillium glabrum и анаморфа Pseudogymnoascus pannorum. В таксономической структуре преобладали анаморфы аскомицетов, а самой многочисленной и разнообразной группой был класс Sordariomycetes. Оценка видового богатства с помощью кумулятивной кривой и расчета ожидаемого полного числа видов с поправкой Chao2 показала, что видовое разнообразие выявлено примерно на 81%. Ординация сообществ грибов методом nMDS с тестом ANOSIM показала высокую значимость объединения групп по признакам года отбора и типа грунта, а также года отбора и типа экотопа. Таким образом, важнейшим фактором для формирования микобиоты является тип грунта, связанный с типом берега и наличием пресного стока. Кроме того, сообщества мицелиальных грибов в исследованных донных грунтах меняются год от года. Article in Journal/Newspaper Arctic Polar Biology White Sea Белого моря Белое море Herald of Moscow University. Series 16. Biology Kandalaksha ENVELOPE(32.417,32.417,67.133,67.133) White Sea Mycology 11 3 230 242 |