Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge
Mikroorganismer som bakterier og virus kan overføres mellom mennesker og dyr, noen av disse kan være potensielt patogene. Candidatus Neoehrlichia mikurensis er en flåttbåren patogen bakterie som første gang ble karakterisert i Japan i 2004, den ble i Japan oppdaget i Ixodes ovatus og Rattus norvegic...
Main Author: | |
---|---|
Format: | Master Thesis |
Language: | Norwegian Bokmål |
Published: |
Høgskolen i Telemark
2016
|
Subjects: | |
Online Access: | http://hdl.handle.net/11250/2438970 |
id |
fthsbuskerudcom:oai:brage.bibsys.no:11250/2438970 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
fthsbuskerudcom:oai:brage.bibsys.no:11250/2438970 2023-05-15T17:24:09+02:00 Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge Raasok, Cecelie 2016-01-18T09:15:23Z http://hdl.handle.net/11250/2438970 nob nob Høgskolen i Telemark © Copyright The Author. All rights reserved flått patogener 473 484 Master thesis 2016 fthsbuskerudcom 2017-04-28T14:02:17Z Mikroorganismer som bakterier og virus kan overføres mellom mennesker og dyr, noen av disse kan være potensielt patogene. Candidatus Neoehrlichia mikurensis er en flåttbåren patogen bakterie som første gang ble karakterisert i Japan i 2004, den ble i Japan oppdaget i Ixodes ovatus og Rattus norvegicus(rotte), mens den nylig ble oppdaget i Ixodes ricinus (skogflått) her i Norge. DNA konsentrasjon ble funnet ved kjøring av «Cutoff». Utvikling av en PCR miks og kjøring av Cutoff gav oss muligheten til å bruke Real-time PCR for å kartlegge prevalensen av «Neo» i flått i Norge. Etter å ha testet 1005 flått fra 11 lokaliteter i Norge, Viser det seg at prevalensen er veldig variabel. «Neo» er mest prevalent i Kystnære områder på ?stlandet og Sørlandet, men positiver er også funnet i Nord Norge. Det ble testet flått også i Hordaland og Rogaland, men her fantes det ingen positiver. Mens i Hillevågen i Mandal var det en total prevalens på opp imot 19%. Av all flåtten som ble testet var det en total prevalens på 7,9 % i Norge. Flere av de positive prøvene viste variasjoner i smeltepunktet (Tm). PCR produktet varierte fra 71,9-74,4°C. Variasjonene i smeltepunkt kan tyde på sekvensvariasjoner. På noen av lokalitetene; Håøya, Tromøya, Hillevågen og Spjærøya er det tydelige variasjoner i smeltepunktet, mens ved Langøya og Brønnøya er det få variasjoner i smeltepunktene. Ca gjennomsnittlig smeltepunkt ligger rundt Tm 73°C ± 0,5 I denne studien ble det påvist Neo i norsk skogflått, det ble i tillegg påvist år til år variasjon i forekomsten av Neo. I noen lokaliteter ble bakterien ikke påvist, men det kan allikevel ikke utelukke tilstedeværelsen av Neo på bakgrunn av et enkelt studie. En større kartlegging av forekomsten kan bidra til bedre kunnskap om prevalensen til Neo i Norge. Published version Master Thesis Nord-Norge University of South-Eastern Norway: USN Open Archive (Brage) Flått ENVELOPE(12.331,12.331,64.693,64.693) Flåtten ENVELOPE(14.039,14.039,67.113,67.113) Langøya ENVELOPE(6.479,6.479,62.513,62.513) Sørlandet ENVELOPE(13.859,13.859,66.871,66.871) |
institution |
Open Polar |
collection |
University of South-Eastern Norway: USN Open Archive (Brage) |
op_collection_id |
fthsbuskerudcom |
language |
Norwegian Bokmål |
topic |
flått patogener 473 484 |
spellingShingle |
flått patogener 473 484 Raasok, Cecelie Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge |
topic_facet |
flått patogener 473 484 |
description |
Mikroorganismer som bakterier og virus kan overføres mellom mennesker og dyr, noen av disse kan være potensielt patogene. Candidatus Neoehrlichia mikurensis er en flåttbåren patogen bakterie som første gang ble karakterisert i Japan i 2004, den ble i Japan oppdaget i Ixodes ovatus og Rattus norvegicus(rotte), mens den nylig ble oppdaget i Ixodes ricinus (skogflått) her i Norge. DNA konsentrasjon ble funnet ved kjøring av «Cutoff». Utvikling av en PCR miks og kjøring av Cutoff gav oss muligheten til å bruke Real-time PCR for å kartlegge prevalensen av «Neo» i flått i Norge. Etter å ha testet 1005 flått fra 11 lokaliteter i Norge, Viser det seg at prevalensen er veldig variabel. «Neo» er mest prevalent i Kystnære områder på ?stlandet og Sørlandet, men positiver er også funnet i Nord Norge. Det ble testet flått også i Hordaland og Rogaland, men her fantes det ingen positiver. Mens i Hillevågen i Mandal var det en total prevalens på opp imot 19%. Av all flåtten som ble testet var det en total prevalens på 7,9 % i Norge. Flere av de positive prøvene viste variasjoner i smeltepunktet (Tm). PCR produktet varierte fra 71,9-74,4°C. Variasjonene i smeltepunkt kan tyde på sekvensvariasjoner. På noen av lokalitetene; Håøya, Tromøya, Hillevågen og Spjærøya er det tydelige variasjoner i smeltepunktet, mens ved Langøya og Brønnøya er det få variasjoner i smeltepunktene. Ca gjennomsnittlig smeltepunkt ligger rundt Tm 73°C ± 0,5 I denne studien ble det påvist Neo i norsk skogflått, det ble i tillegg påvist år til år variasjon i forekomsten av Neo. I noen lokaliteter ble bakterien ikke påvist, men det kan allikevel ikke utelukke tilstedeværelsen av Neo på bakgrunn av et enkelt studie. En større kartlegging av forekomsten kan bidra til bedre kunnskap om prevalensen til Neo i Norge. Published version |
format |
Master Thesis |
author |
Raasok, Cecelie |
author_facet |
Raasok, Cecelie |
author_sort |
Raasok, Cecelie |
title |
Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge |
title_short |
Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge |
title_full |
Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge |
title_fullStr |
Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge |
title_full_unstemmed |
Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge |
title_sort |
candidatus neoehrlichia mikurensis i ixodes ricinus i norge |
publisher |
Høgskolen i Telemark |
publishDate |
2016 |
url |
http://hdl.handle.net/11250/2438970 |
long_lat |
ENVELOPE(12.331,12.331,64.693,64.693) ENVELOPE(14.039,14.039,67.113,67.113) ENVELOPE(6.479,6.479,62.513,62.513) ENVELOPE(13.859,13.859,66.871,66.871) |
geographic |
Flått Flåtten Langøya Sørlandet |
geographic_facet |
Flått Flåtten Langøya Sørlandet |
genre |
Nord-Norge |
genre_facet |
Nord-Norge |
op_rights |
© Copyright The Author. All rights reserved |
_version_ |
1766115042060664832 |