Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge

Mikroorganismer som bakterier og virus kan overføres mellom mennesker og dyr, noen av disse kan være potensielt patogene. Candidatus Neoehrlichia mikurensis er en flåttbåren patogen bakterie som første gang ble karakterisert i Japan i 2004, den ble i Japan oppdaget i Ixodes ovatus og Rattus norvegic...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Raasok, Cecelie
Format: Master Thesis
Language:Norwegian Bokmål
Published: Høgskolen i Telemark 2016
Subjects:
473
484
Online Access:http://hdl.handle.net/11250/2438970
id fthsbuskerudcom:oai:brage.bibsys.no:11250/2438970
record_format openpolar
spelling fthsbuskerudcom:oai:brage.bibsys.no:11250/2438970 2023-05-15T17:24:09+02:00 Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge Raasok, Cecelie 2016-01-18T09:15:23Z http://hdl.handle.net/11250/2438970 nob nob Høgskolen i Telemark © Copyright The Author. All rights reserved flått patogener 473 484 Master thesis 2016 fthsbuskerudcom 2017-04-28T14:02:17Z Mikroorganismer som bakterier og virus kan overføres mellom mennesker og dyr, noen av disse kan være potensielt patogene. Candidatus Neoehrlichia mikurensis er en flåttbåren patogen bakterie som første gang ble karakterisert i Japan i 2004, den ble i Japan oppdaget i Ixodes ovatus og Rattus norvegicus(rotte), mens den nylig ble oppdaget i Ixodes ricinus (skogflått) her i Norge. DNA konsentrasjon ble funnet ved kjøring av «Cutoff». Utvikling av en PCR miks og kjøring av Cutoff gav oss muligheten til å bruke Real-time PCR for å kartlegge prevalensen av «Neo» i flått i Norge. Etter å ha testet 1005 flått fra 11 lokaliteter i Norge, Viser det seg at prevalensen er veldig variabel. «Neo» er mest prevalent i Kystnære områder på ?stlandet og Sørlandet, men positiver er også funnet i Nord Norge. Det ble testet flått også i Hordaland og Rogaland, men her fantes det ingen positiver. Mens i Hillevågen i Mandal var det en total prevalens på opp imot 19%. Av all flåtten som ble testet var det en total prevalens på 7,9 % i Norge. Flere av de positive prøvene viste variasjoner i smeltepunktet (Tm). PCR produktet varierte fra 71,9-74,4°C. Variasjonene i smeltepunkt kan tyde på sekvensvariasjoner. På noen av lokalitetene; Håøya, Tromøya, Hillevågen og Spjærøya er det tydelige variasjoner i smeltepunktet, mens ved Langøya og Brønnøya er det få variasjoner i smeltepunktene. Ca gjennomsnittlig smeltepunkt ligger rundt Tm 73°C ± 0,5 I denne studien ble det påvist Neo i norsk skogflått, det ble i tillegg påvist år til år variasjon i forekomsten av Neo. I noen lokaliteter ble bakterien ikke påvist, men det kan allikevel ikke utelukke tilstedeværelsen av Neo på bakgrunn av et enkelt studie. En større kartlegging av forekomsten kan bidra til bedre kunnskap om prevalensen til Neo i Norge. Published version Master Thesis Nord-Norge University of South-Eastern Norway: USN Open Archive (Brage) Flått ENVELOPE(12.331,12.331,64.693,64.693) Flåtten ENVELOPE(14.039,14.039,67.113,67.113) Langøya ENVELOPE(6.479,6.479,62.513,62.513) Sørlandet ENVELOPE(13.859,13.859,66.871,66.871)
institution Open Polar
collection University of South-Eastern Norway: USN Open Archive (Brage)
op_collection_id fthsbuskerudcom
language Norwegian Bokmål
topic flått
patogener
473
484
spellingShingle flått
patogener
473
484
Raasok, Cecelie
Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge
topic_facet flått
patogener
473
484
description Mikroorganismer som bakterier og virus kan overføres mellom mennesker og dyr, noen av disse kan være potensielt patogene. Candidatus Neoehrlichia mikurensis er en flåttbåren patogen bakterie som første gang ble karakterisert i Japan i 2004, den ble i Japan oppdaget i Ixodes ovatus og Rattus norvegicus(rotte), mens den nylig ble oppdaget i Ixodes ricinus (skogflått) her i Norge. DNA konsentrasjon ble funnet ved kjøring av «Cutoff». Utvikling av en PCR miks og kjøring av Cutoff gav oss muligheten til å bruke Real-time PCR for å kartlegge prevalensen av «Neo» i flått i Norge. Etter å ha testet 1005 flått fra 11 lokaliteter i Norge, Viser det seg at prevalensen er veldig variabel. «Neo» er mest prevalent i Kystnære områder på ?stlandet og Sørlandet, men positiver er også funnet i Nord Norge. Det ble testet flått også i Hordaland og Rogaland, men her fantes det ingen positiver. Mens i Hillevågen i Mandal var det en total prevalens på opp imot 19%. Av all flåtten som ble testet var det en total prevalens på 7,9 % i Norge. Flere av de positive prøvene viste variasjoner i smeltepunktet (Tm). PCR produktet varierte fra 71,9-74,4°C. Variasjonene i smeltepunkt kan tyde på sekvensvariasjoner. På noen av lokalitetene; Håøya, Tromøya, Hillevågen og Spjærøya er det tydelige variasjoner i smeltepunktet, mens ved Langøya og Brønnøya er det få variasjoner i smeltepunktene. Ca gjennomsnittlig smeltepunkt ligger rundt Tm 73°C ± 0,5 I denne studien ble det påvist Neo i norsk skogflått, det ble i tillegg påvist år til år variasjon i forekomsten av Neo. I noen lokaliteter ble bakterien ikke påvist, men det kan allikevel ikke utelukke tilstedeværelsen av Neo på bakgrunn av et enkelt studie. En større kartlegging av forekomsten kan bidra til bedre kunnskap om prevalensen til Neo i Norge. Published version
format Master Thesis
author Raasok, Cecelie
author_facet Raasok, Cecelie
author_sort Raasok, Cecelie
title Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge
title_short Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge
title_full Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge
title_fullStr Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge
title_full_unstemmed Candidatus neoehrlichia mikurensis i Ixodes ricinus i Norge
title_sort candidatus neoehrlichia mikurensis i ixodes ricinus i norge
publisher Høgskolen i Telemark
publishDate 2016
url http://hdl.handle.net/11250/2438970
long_lat ENVELOPE(12.331,12.331,64.693,64.693)
ENVELOPE(14.039,14.039,67.113,67.113)
ENVELOPE(6.479,6.479,62.513,62.513)
ENVELOPE(13.859,13.859,66.871,66.871)
geographic Flått
Flåtten
Langøya
Sørlandet
geographic_facet Flått
Flåtten
Langøya
Sørlandet
genre Nord-Norge
genre_facet Nord-Norge
op_rights © Copyright The Author. All rights reserved
_version_ 1766115042060664832